組學社區(qū)福利!重磅回看- HUPO 2020 賽默飛用戶會
HUPO作為蛋白質(zhì)組學的盛會,每年都會成為業(yè)內(nèi)關(guān)注的焦點。2020 年受到新冠疫情影響,轉(zhuǎn)戰(zhàn)線上,并新命名Connect。在這場代表蛋白質(zhì)組學ding尖水平的盛會上,有哪些令人耳目一新的新技術(shù),又哪些讓人眼前一亮的新應用?許多錯過現(xiàn)場精彩內(nèi)容的老師一定有所遺憾。作為組學社區(qū)的福利之一,我們將為您回放HUPO 2020之中一場看點頗多的賽默飛用戶會:Accelerating COVID-19 Proteomics Research Using Tandem Mass Tags,讓您不再錯失精彩!
看點直擊
看點一:TMT 定量分析
TMT標記定量助力新冠研究
TMT標記定量方案擁有更優(yōu)的分析速度、覆蓋深度和定量質(zhì)量;并可靈活與SILAC標記技術(shù)聯(lián)用,進行快速蛋白差異分析。
圖1. 多重增強蛋白質(zhì)動力學(multiplexed enhanced protein dynamicsme, mePROD)實驗流程(點擊查看大圖)
它的價值在于提升蛋白質(zhì)組的解析深度;一次性在多個樣品中量化蛋白水平的差異,定量準確性更高;適用于更復雜的大樣本實驗設計,有效地縮短了實驗時間,加速確證病毒致病性相關(guān)的生物途徑以及尋找潛在的藥物靶標。
看點二:直擊新冠
COVID-19研究熱點話題與成果展示
借助TMT實驗流程,能夠從多角度分析SARS-CoV-2蛋白組學,進而全面了解在新冠發(fā)展進程中,SARS-CoV-2病毒的感染機制、宿主細胞信號通路的改變、輕重癥患者免疫反應,以及COVID-19zhi療藥物的潛在靶點。
圖2. SARS-CoV-2引起的免疫相關(guān)蛋白變化(點擊查看大圖)
看點三:多種冠狀病毒的橫向分析
基于親和純化質(zhì)譜技術(shù)(AP-MS)和TMT流程,比較SARS-CoV-1和SARS-CoV-2、MERS-CoV非結(jié)構(gòu)同源蛋白與宿主蛋白的相互作用,量化不同病毒間 Nsp2、Nsp4及Nsp3同源蛋白的差異并進行富集分析。
圖3. 病毒-宿主蛋白互做關(guān)系
借助AP-MS的特異性與TMT的高通量優(yōu)勢,可以目標性地開展蛋白互作圖譜分析,幫助揭示了SARS-CoV-1、SARS-CoV-2、MERS-CoV之間共享/*的病毒-宿主依賴關(guān)系 ,非結(jié)構(gòu)蛋白驅(qū)動的病毒復制和致病性,調(diào)節(jié)蛋白穩(wěn)態(tài)用于疾病干預zhi療。
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