組學(xué)熱點(diǎn)技術(shù)交流
10月20日,由賽默飛與中國疾病預(yù)防控制中心環(huán)境與健康相關(guān)產(chǎn)品安全所聯(lián)合舉辦的《賽默飛世爾疾控系統(tǒng)組學(xué)技術(shù)交流會》在北京舉行。
會議邀請了凱萊譜科研事業(yè)部總監(jiān)孔子青博士、中國檢驗檢疫科學(xué)研究院食品安全研究所副所長許秀麗博士、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所孫偉博士,以及來自中國疾病預(yù)防控制中心各研究所,國家食品安全風(fēng)險評估中心,北京市疾病預(yù)防控制中心及各區(qū)疾病預(yù)防控制中心的近百位專家和用戶,共同對新冠病毒代謝流研究、蛋白組學(xué)、食品組學(xué)和環(huán)境暴露組學(xué)等當(dāng)前與疾控系統(tǒng)密切相關(guān)的熱點(diǎn)問題進(jìn)行了深入探討和技術(shù)交流。
代謝組在新冠與感染性疾病中的應(yīng)用
凱萊譜科研事業(yè)部總監(jiān)孔子青博士
詳細(xì)解讀了由迪安凱萊譜等合作發(fā)表在《Cell》上題為《Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera》的科研成果。作者通過分子層面研究病毒對人體機(jī)能的影響及輕癥轉(zhuǎn)重癥的標(biāo)志物,在賽默飛高分辨QE質(zhì)譜上利用代謝組學(xué)技術(shù)分析了新冠病人的血清樣本,共鑒定出941個代謝產(chǎn)物,其中204個特征改變的代謝產(chǎn)物與疾病嚴(yán)重相關(guān),發(fā)現(xiàn)大量能量相關(guān)代謝物在普通和重癥患者血清中顯著下降,巨噬細(xì)胞、血小板和補(bǔ)體系統(tǒng)調(diào)節(jié)通路異常、肝臟解毒功能受損等情況,解讀“新冠病人為什么沒有一點(diǎn)力氣?”這一現(xiàn)象的原因。研究建立包含7個代謝物和22個蛋白質(zhì)的評估模型,并對進(jìn)一步研究做出展望。
基于orbitrap的環(huán)境暴露組學(xué)研究及解決方案
賽默飛LSMS小分子應(yīng)用工程師史碧云
對暴露組學(xué)的概念和實驗過程進(jìn)行了展示和示例,并針對代謝組學(xué)相關(guān)的部分工作進(jìn)行了基于Orbitrap平臺的數(shù)據(jù)采集和分析介紹,包括數(shù)據(jù)采集的方法、數(shù)據(jù)處理的過程、結(jié)果解讀和展示,對于數(shù)據(jù)庫的組成、鑒定的步驟、歸一化的方法、通路分析的結(jié)果等全流程解決方案進(jìn)行了詳細(xì)講解和實例解讀。
食品中未知有害物質(zhì)的質(zhì)譜發(fā)掘及檢測技術(shù)
中國檢驗檢疫科學(xué)研究院食品安全研究所副所長許秀麗博士
報告對食品中未知有害物質(zhì)譜發(fā)掘理論,食品中未知有害物的質(zhì)譜發(fā)掘技術(shù),食品中有害物的高選擇性質(zhì)譜檢測技術(shù)做了詳細(xì)描述與展望。本研究基于同類結(jié)構(gòu)物質(zhì)具有相同質(zhì)譜裂解規(guī)律,篩選了可標(biāo)識同類結(jié)構(gòu)的質(zhì)譜裂解標(biāo)志物,建立‘逐類發(fā)掘’方法,提出了質(zhì)譜裂解標(biāo)志物的篩選原則,利用賽默飛高分辨高靈敏度的orbitrap質(zhì)譜平臺,篩選出52個質(zhì)譜裂解標(biāo)志物,利用orbitrap質(zhì)譜的高分辨率能力,解決了同類結(jié)構(gòu)未知化學(xué)性有害物的發(fā)掘難題,并在牛奶過度加熱標(biāo)志物發(fā)掘的實踐案例中得到應(yīng)用。
尿液蛋白組及其在疾病研究中的應(yīng)用
中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所孫偉博士
從蛋白質(zhì)組學(xué)角度回顧了尿液中蛋白質(zhì)種類的發(fā)現(xiàn)和研究歷程,以及尿液樣本作為除血液樣本之外,同樣能夠提供各種人體健康相關(guān)信息的重要人體生物樣本,在尿液樣本研究中質(zhì)譜出現(xiàn)的必要性及高分辨Orbitrap的出現(xiàn)給尿液中蛋白研究帶來了更多驚喜。通過2D-LC LTQ-Orbitrap技術(shù),極大的提升了尿液中大分子蛋白種類的發(fā)現(xiàn)數(shù)量,并且通過創(chuàng)新性研究,發(fā)展新的3D-LC 高分辨質(zhì)譜技術(shù),可以從尿液中發(fā)現(xiàn)多達(dá)6085種蛋白。通過蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),發(fā)現(xiàn)了腎臟病人和普通人的尿液蛋白差異,以及男女性別差異造成的尿液蛋白差異,對這些蛋白差異進(jìn)行歸一化分析,進(jìn)一步揭示腎臟疾病和尿液蛋白的相關(guān)聯(lián)系,以達(dá)到通過尿液蛋白的檢測進(jìn)行腎臟疾病的早期預(yù)警作用。
GC orbitrap 在代謝組學(xué)中的應(yīng)用
賽默飛應(yīng)用經(jīng)理邢江濤
GCMS作為代謝組學(xué)*的技術(shù)手段,在近年來受到廣泛關(guān)注。而非靶向研究策略的興起則為傳統(tǒng)GCMS提出了挑戰(zhàn)。GC Orbitrap作為新興的氣質(zhì)高分辨聯(lián)用儀,憑借超高分辨率、優(yōu)異的穩(wěn)定性,以及全掃描分析即可獲得與GCMSMS相當(dāng)?shù)撵`敏度, 6個數(shù)量級的動態(tài)范圍等特點(diǎn),開始被研究學(xué)者青睞。截至目前,已有超過100篇的文獻(xiàn)發(fā)表,涉及食品、環(huán)境、代謝組學(xué)等多個領(lǐng)域的靶向及非靶向分析。
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