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全能核酸酶,又稱非限制性核酸內(nèi)切酶,是一種來源于Serratia Marcescen的非特異性核酸內(nèi)切酶,可以降解各種形式的(雙鏈,單鏈,線狀,環(huán)狀,天然或變性)DNA和RNA,產(chǎn)生3-5個堿基長度的5'-單磷酸寡核苷酸。無論是實(shí)驗(yàn)研究,還是工業(yè)生產(chǎn),全能核酸酶都是目前能夠同時有效去除DNA和RNA的酶。另外,全能核酸酶在非常廣泛的條件下(6M urea,0.1 M Guanidine HCl,0.4% Triton X100,0.1% SDS,1 mM EDTA,1 mM PMSF)都能保持很高的穩(wěn)定性和消化活力,非常適用于作為各類科學(xué)研究以及疫苗、蛋白、多糖類制藥工業(yè)的酶制劑,去除樣本或制品中的核酸殘留,提升樣本純度和制品生物功效。
隨著越來越多的生物制品(重組蛋白、Vero細(xì)胞疫苗、細(xì)胞治療/基因治療藥物等)進(jìn)入治療領(lǐng)域,生物制品的質(zhì)量控制也日趨嚴(yán)格,其中核酸殘留是各類質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)的重中之重,因?yàn)镈NA較好的穩(wěn)定性,容易在生產(chǎn)過程中形成殘留,而這些生物制品應(yīng)用到人類疾病預(yù)防和治療時,會帶來不可控危險因素。終產(chǎn)品的宿主核酸殘留量必須遵循WHO、FDA和EMEA以及我國NMPA監(jiān)管條例。尤其近年來包括進(jìn)口產(chǎn)品在內(nèi)的狂犬疫苗DNA殘留超標(biāo)問題,引起了社會和業(yè)界的廣泛關(guān)注。WHO和各國藥物監(jiān)管機(jī)構(gòu)一般將疫苗等生物制品的殘留DNA控制在100pg/劑量,特殊情況下最高允許10ng/劑量。我國參照WHO、FDA和歐盟標(biāo)準(zhǔn),在藥典中對生物制品的核酸殘留量有明確規(guī)定。藥典中明確規(guī)定酵母、大腸桿菌表達(dá)的生物制品中DNA殘留量不超過10ng/劑量。我國2020年藥典將人用狂犬病疫苗(Vero細(xì)胞)DNA殘留標(biāo)準(zhǔn)更新為≤3ng/劑量。本產(chǎn)品無動物源性, 無氨芐青霉素,可高效降解單鏈、雙鏈、線性、環(huán)狀、超螺旋等任何形式的DNA及RNA。
一,產(chǎn)品應(yīng)用范圍
1)用于除去生物制品中的DNA/RNA
美國FDA對治療用每劑量的生物制品的核酸含量要求為低于10 pg,國內(nèi)對此相應(yīng)的要求為低于100 pg。全能核酸酶可用于疫苗、多糖、蛋白等工業(yè)生物制品中核酸的去除,使生物制品的最終核酸含量符合要求,同時提高生物制品功效。
2)用于降低細(xì)胞破碎后的粘度
全能核酸酶可以降解所有形式的核酸,降低細(xì)胞裂解液的粘度,提高蛋白得率,改善分離效果,使之易于過濾(尤其是超濾),利于下游層析純化操作。
圖2 細(xì)胞裂解液全能核酸酶處理(A)和未處理(B)比較圖
3)用于細(xì)胞培養(yǎng)來源產(chǎn)物的純化過程
核酸很容易粘附在病毒樣顆粒(VLP)、病毒粒子、包涵體等細(xì)胞生成顆粒的表面,使顆粒大小或電荷發(fā)生改變,造成這些顆粒的聚集,如外周血單細(xì)胞(PBMC)存放過程中的結(jié)塊現(xiàn)象。全能核酸酶可有效降解核酸,避免核酸對細(xì)胞產(chǎn)物的影響以及純化效率,利于提高細(xì)胞產(chǎn)物純化效率。
4)用于生化分析樣品的制備
在ELISA、色譜分析、雙相電泳和足跡分析等過程中,用全能核酸酶處理含有核酸的蛋白樣品,可提高分辨率,并提高回收率。
圖3 小鼠腦核蛋白全能核酸酶處理(A)和未處理(B)雙向電泳比較圖
二,質(zhì)量控制
1.宿主蛋白殘留:酶聯(lián)免疫檢測試劑盒未檢測到宿主蛋白。
2.蛋白酶殘留:250KU/mL 的全能核酸酶與底物反應(yīng) 60min,未檢測到活力。
3. 細(xì)菌內(nèi)毒素(Endotoxin):LAL-Test,中國藥典 2020 版第四部凝膠限度試驗(yàn)法通則(1143)。
4.微生物負(fù)載:中國藥典2020版第四部無菌檢查法通則(1101),中華人民共和國國家標(biāo)準(zhǔn),GB 4789.2-2016。
5. 重金屬殘留:電感耦合等離子體發(fā)射光譜法,HJ776-2015。
三,常見問答
Q.產(chǎn)品按多少比例加入?
A:建議加入比例(終濃度)為1:1000-1:20000,具體需依據(jù)反應(yīng)時間、溫度、以及待處理樣本中的鹽離子濃度。
Q.產(chǎn)品能否可以減少用量?
A:如希望減少用量,需適當(dāng)延長處理時間。
Q.全能核酸酶的抑制因素有哪些?
A:在含有以下物質(zhì)的體系中,全能核酸酶的活性會降低50%或以上:>150 mM一價陽離子,>100 mM磷酸鹽,>100 mM硫酸銨,>100 mM鹽酸胍,>0.1% SDS,>1% Triton X-100,>1% Tween 20。
Q.怎樣滅活全能核酸酶?
A:采用EDTA螯合金屬離子會可逆地抑制全能核酸酶活性,條件會造成不可逆失活,例如100 mM NaOH,70℃處理30 min等。
Q.如何去除處理后樣本中的全能核酸酶?
億目思的全能核酸酶分為無標(biāo)簽、His標(biāo)簽和Strep標(biāo)簽三種版本。若所處理的樣本無標(biāo)簽,則可選擇帶標(biāo)簽的全能核酸酶,通過相應(yīng)親和resin去除殘留核酸酶;若所處理的樣本帶有His標(biāo)簽,則可選擇無標(biāo)簽的全能核酸酶,通過親和層析吸附目標(biāo)蛋白,從而去除殘留核酸酶;若所處理的樣本是無標(biāo)簽和帶His標(biāo)簽的混合蛋白,則可選擇帶Strep標(biāo)簽的全能核酸酶,通過Strep親和resin去除殘留核酸酶。
Q.全能核酸酶與蛋白酶抑制劑混合物是否兼容?
A:全能核酸酶與不含EDTA的蛋白酶抑制劑混合物兼容。若含有EDTA且濃度>1 mM時,會抑制核酸酶活性,建議:如果必須加EDTA,按照2倍EDTA濃度補(bǔ)加Mg2+。
Q. 如何確認(rèn)樣本中是否還有全能核酸酶殘留?
A:可用億目思的全能核酸酶殘留檢測試劑盒(Cat.No. 70291)進(jìn)行鑒定,僅需10分鐘即可對樣本中的殘留核酸酶進(jìn)行定量鑒定,檢出限達(dá)0.001 ng/mL。
Q.產(chǎn)品的用量是多少?
A:需要根據(jù)重懸菌體所需裂解液的體積來確定需要酶的量。若普通蛋白純化,則需要濃度為25 U/mL;核蛋白則需要100 U/mL;病毒表達(dá)蛋白純化需要濃度為12.5 U/mL;疫苗產(chǎn)品需要量為0.9-1.1 U/mL。具體用量還需要參照待處理樣本成分進(jìn)行調(diào)整。
Q.產(chǎn)品的穩(wěn)定性如何,如果不小心在室溫放置幾天后,酶活性會受到怎樣的影響?
A:室溫2-3天,對活力影響不大。
Q.全能核酸酶能在尿素環(huán)境消化核酸嗎?
A:全能核酸酶在尿素濃度為6 M時活性先增加,隨著時間延長活性又有降低;在尿素為7 M時,全能核酸酶15分鐘后出現(xiàn)變性并失活。但是在酶失活前多數(shù)核酸已經(jīng)降解了。可通過提高全能核酸酶使用濃度補(bǔ)償7 M尿素的影響。
四,逐典Pannarase全能核酸酶優(yōu)勢:
1.無動物源性、無氨芐青霉素
2.杰出單位比酶活、更高效的核酸降解能力
3.先進(jìn)的生產(chǎn)工藝,非傳統(tǒng)His標(biāo)簽純化、排除引入金屬離子風(fēng)險
4.嚴(yán)格的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn),內(nèi)毒水平低,確保單位酶活的準(zhǔn)確性以及批次間穩(wěn)定性
1,全能核酸酶應(yīng)用條件:
全能核酸酶的酶活會受到多種因素的影響(例如溫度、pH、離子強(qiáng)度等),故用量范圍也會從0.1 U/mL-250 U/mL不等。因此,不同的操作環(huán)境下酶的最佳濃度不同,需要通過實(shí)驗(yàn)設(shè)置梯度進(jìn)行最佳條件的摸索。
2,應(yīng)用實(shí)例:
1.樣品:狂犬病毒濃縮液
處理條件:核酸酶濃度50~90U/ml ,
37 ℃處理 2 h,轉(zhuǎn)入18 ~ 26 ℃處理 6h
2.樣品:狂犬病病毒濃縮液
處理條件:25、50和100 U/ml,37℃
3.樣品:流感病毒濃縮液
處理條件:10 U/mL,37℃