產(chǎn)品及特點(diǎn)
免RNA提取FFPE RT-PCR試劑盒是在天凈沙動(dòng)物 RNAout 基礎(chǔ)上根據(jù)細(xì)菌提取的具體情況改良而得。它基于異硫氰酸胍/酚/氯提取RNA原理，可用于包括 E.coli、Campylobacterfetus、Pseudomonas aeruginosa、Rhodobacter sphaeroides 等各種常見(jiàn)的革氏陰性細(xì)菌。如果需要提革氏陽(yáng)性細(xì)菌（如 Bacillus subtilis、Staphylococcusaureus 等）的 RNA，可以選擇真菌 RNAout。本產(chǎn)品特點(diǎn)如下：
1. 操作簡(jiǎn)單快速，只要十分鐘左右,可以全在室溫下進(jìn)行。
2. 所得 RNA 質(zhì)量高,OD260/OD280 一般在 1.9，不含基因 DNA 污染。
3. 靈敏度高，可以從一個(gè)菌落中提取到普通電泳能夠檢測(cè)到的總 RNA。
4. 性?xún)r(jià)比高于進(jìn)口同類(lèi)產(chǎn)品。
規(guī)格及成分 成分 編號(hào) 100 次包裝 250 次包裝
細(xì)菌 RNAout 51102 100 mL 250 mL
使用手冊(cè) 1 份



運(yùn)輸及保存 常溫運(yùn)輸，4℃保存，有效期一年。
自備試劑 氯，異丙醇，75%乙醇，RNA 溶解液
免RNA提取FFPE RT-PCR試劑盒使用方法 1. 在 1.5 mL 塑料離心管中離心收集 0.2-1.5 mL 新鮮細(xì)菌(注意:由于細(xì)菌RNA 半衰期十分短，所以，必須使用鮮細(xì)菌)，吸盡液體培養(yǎng)基，加 入
1 mL 細(xì)菌 RNAOUT 并用槍充分吹打，確保細(xì)菌全部裂解，沒(méi)有塊狀 物。如果使用菌落，則用接種環(huán)小心將其轉(zhuǎn)移到裝有 1 mL 細(xì)菌 RNAOUT 的
1.5 m 塑料離心管中，用移液槍吹打均勻。在細(xì)菌數(shù)較少時(shí)，建議使 用雅吉基因的助沉劑 RNADOWN 以提高 RNA 回收率。
2. 加入 0.2 mL 氯，在振蕩器上充分振蕩混均 30 秒（必須將管底的液體振蕩起來(lái)，否則不能有效將 DNA 打斷和去除蛋白質(zhì)）。
3. 12000-15000 g 室溫離心 3 分鐘。上清液無(wú)色，下層液呈籃色，中間為 蛋白質(zhì)。小心將上清液轉(zhuǎn)移到另一干凈 1.5 m 塑料離心管中，上清液體 積約為 0.6 mL。為避免觸及中間層的 DNA 和蛋白質(zhì)，建議分小量多次 吸
取，并且只取 0.5 mL，留 0.1 mL 左右。當(dāng)細(xì)菌數(shù)量較少時(shí)，中間層 十
分松散，上清時(shí)很容易吸到下層有機(jī)相，需要更加小心。
4. 在上清液中加入等體積的異丙醇，振蕩器上振蕩混均 30 秒。
5. 12000-15000 室溫離心 3-10 分鐘，RNA 將在管底側(cè)面形成沉淀。
6. 小心吸棄上清液，注意不要吸棄 RNA 沉淀。
7. 在離心管中加入 1mL 75%乙醇，振蕩器上振蕩混均 30 秒。
8. 12000-15000 g 室溫離心 1 分鐘。
9. 小心吸棄上清液，注意不要吸棄 RNA 沉淀。
10. 重復(fù)第 8 到第 10 步一次。
11. 短暫快速離心，用移液槍小心吸棄殘留液（約 50 uL）。
12. 短暫放 1-2 分鐘后加入適量 RNA 溶解液使 RNA 沉淀溶解，可以立即使用或存放于-80℃長(zhǎng)期保存。
13. RNA 完整性的電泳檢測(cè)：
如果需要做 Northern 雜交，強(qiáng)烈建議用戶(hù)使用甲醛變性膠進(jìn)行 RNA電泳，因?yàn)榉亲冃阅z不能分離所有的 RNA 分子（BioTechniques，28：414 ， 2000 ）。 如果是簡(jiǎn)單檢測(cè)，可以使用 TAE 或雅吉基因的SuperBuffer-2 DNA/RNA 兩用快速電泳液，但文獻(xiàn)報(bào)道必須使用變性上樣液（BioTechniques，9：558，1990）。普通 DNA 上樣液不含變 性劑，也沒(méi)經(jīng)過(guò)去 RNase 處理，所以zui不要使用。 尤其需要注意的是不要使用 TBE 進(jìn)行 RNA 電泳，因?yàn)?TBE 所含硼酸是研究多糖的經(jīng)典方法----硼酸絡(luò)合法中的關(guān)鍵成分，硼酸通過(guò)與 RNA 核糖中的羥基發(fā)生絡(luò)合反應(yīng)，形成 RNA 分子內(nèi)或 RNA 分子間的絡(luò)合復(fù) 合物，使同樣長(zhǎng)度的 RNA 具有
不同的泳動(dòng)速度，電泳條帶彌散，同時(shí)有大的 RNA 絡(luò)合復(fù)合物遲留在加樣孔中（一般會(huì)誤以為是基因組 DNA 污染）。RNA 分子內(nèi)或 RNA 分子間的絡(luò)合物的形成的多少和比例又與硼酸與 RNA 的數(shù)量比例有關(guān)，而 RNA 樣品中污染的其他多糖（如植物中提取的 RNA）也會(huì)參與此反應(yīng)，使硼酸對(duì)RNA 電泳的影響更復(fù)雜，所以 TBE 對(duì) RNA 電泳的影響沒(méi)有規(guī)律性和重復(fù)性。有的樣品可以使用有的又不行，zui是避免使用。
由于細(xì)菌細(xì)胞中 70-80%的 RNA 為 rRNA，后者又由 23S (約 3700nt)，16S (約 1700 nt)和 5S (約 100 nt)三種組成，所以變性膠電泳后應(yīng)
該 在 UV 下看見(jiàn)三條清晰的 rRNA 帶。由于核酸長(zhǎng)度與結(jié)合 EB 的數(shù)量成正比（當(dāng)然還與 RNA 的二級(jí)結(jié)構(gòu)有關(guān)，雙鏈部分結(jié)合能力比單鏈部分強(qiáng)），
所以 23S rRNA 條帶的熒光強(qiáng)度一般比 16S rRNA 條帶的熒光強(qiáng)度強(qiáng) 2倍。如果這兩條 rRNA 帶不清晰或比例小于此范圍則表示 RNA 有降解（因?yàn)榇蟮?RNA 被酶降解的可能更大）。
14. RNA 產(chǎn)量產(chǎn)率測(cè)定：
將 5-10 μL RNA 溶于 TE 緩沖液中(pH7.5-8.2 之間)檢測(cè)其在OD260 的光吸收。通過(guò)光吸收可以得出 RNA 濃度（1 OD260 的
RNA=40 μg/mL），進(jìn)而計(jì)算出 RNA 的產(chǎn)量和產(chǎn)率。注意不要將 RNA 稀釋在 DEPC 水中檢測(cè) OD260 和 OD280，否則光吸收比在 TE 中測(cè)得的低 10%-15%，因?yàn)楹怂峁馕崭芤?pH 相關(guān)，而 DEPC 水中的DEPC 高壓分解后產(chǎn)生的 CO2 與水反應(yīng)生成碳酸，使溶液 pH 降低進(jìn)而降低 RNA 的光吸收。
15. RNA 純度測(cè)定：
無(wú)污染的總 RNA 的 OD260/OD280 一般在 1.8-2.1 之間(具體數(shù)值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關(guān))， OD260/OD230 一般在2.0-2.3 之間，如果低于或高于此范圍則分別表示樣品可能有蛋白質(zhì)或多糖
的污染，但一般不影響 RT-PCR 等反應(yīng)。蛋白質(zhì)污染可以通過(guò)酚/氯抽提一次然后酒精沉淀去除，DNA 和多糖污染可以分別用雅吉基因的 DNAErasol 和 PS Erasol 去除。
疑難解答 Q：上樣孔里的紅色熒光物一定是污染的基因組 DNA 嗎？
A：不是。用 TAE 或 TBE 電泳液和非變性膠電泳 RNA 時(shí)容易產(chǎn)生此現(xiàn)象，雅吉基因初步研究發(fā)現(xiàn)大部分紅色熒光物是變性不充分的單鏈RNA通過(guò)堿基
互補(bǔ)或通過(guò)硼酸絡(luò)合（如果使用 TBE 作電泳液的話(huà)）形成的復(fù)合物，加 RNase處理后，這些紅色熒光物一般會(huì)消失。為避免此現(xiàn)象，建議zui使用甲醛變性膠電泳。如果需要使用非變性膠，也必須在上樣前使 RNA 變性。使用雅吉基因優(yōu)化的上樣/變性/染色三用溶液 RNAON 可以使 RNA 在非變性膠上電泳時(shí)也有較 好分 辨率 。使用 非變性 膠時(shí) ，可以使用 TAE 或超快 電泳 液SuperBuffer-2，zui不要使用 TBE 緩沖液，因?yàn)?TBE 中的硼酸能與 RNA的多羥基形成復(fù)合物，RNA 很難形成銳利的條帶。
Q：如何確認(rèn)和去處除污染的基因組 DNA？
A：如果懷疑有 DNA 污染，可以用 RNase 處理 RNA 樣品，然后再電泳。如果上樣孔里的紅色熒光物不消失，則表示是基因組 DNA 污染。進(jìn)一步確認(rèn)可以使用 PCR 擴(kuò)增法。去除污染的 DNA 可以使用非酶的 DNA 去除劑DNA
Erasol 或 RNase-free DNase，由于 RNase-free DNase 一般都有殘留的RNase 污染，所以必須嚴(yán)格按照廠(chǎng)家提供的使用手冊(cè)進(jìn)行操作。
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 溫馨提示：不可用于臨床治療。