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PCR法是20世紀(jì)80年代中期建立起來(lái)的一種體外DNA擴(kuò)增技術(shù),其基本原理是酶促DNA合成反應(yīng),即在DNA模板、引物和脫氧核糖核酸存在下,經(jīng)DNA聚合酶的作用,使DNA 鏈擴(kuò)增延伸。該方法具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、快速的特點(diǎn),但其對(duì)實(shí)驗(yàn)環(huán)境的要求嚴(yán)格,實(shí)驗(yàn)成本較高,有時(shí)還有假陽(yáng)性的現(xiàn)象出現(xiàn)。
1、儀器設(shè)備
超凈工作臺(tái)、PCR儀、電泳儀、凝膠成像分析系統(tǒng)、臺(tái)式離心機(jī)、旋渦混懸器等。
2、實(shí)驗(yàn)試劑
選用美國(guó)Stratagene公司生產(chǎn)的支原體檢測(cè)試劑盒(內(nèi)有引物、陽(yáng)性對(duì)照、內(nèi)對(duì)照、StrataClean resin、緩沖液),dNTP,TapDNA聚合酶,緩沖液,瓊脂糖,礦物油。
3、實(shí)驗(yàn)操作
PCR反應(yīng)的前期操作應(yīng)在無(wú)菌環(huán)境中進(jìn)行。
(1)樣品的收集:待測(cè)細(xì)胞用抗培養(yǎng)基培養(yǎng)7d,用無(wú)菌容器取上清液500ul,4℃保存待測(cè)。
(2)模板的制作:在無(wú)菌的條件下,取細(xì)胞培養(yǎng)上清100ul于一無(wú)菌的0.5ml塑料離心管內(nèi),蓋好蓋子,95℃水浴加熱5min。
(3)打開蓋子,向管內(nèi)加StrataClean resin10ul,蓋好蓋子,旋渦混懸器混合,離心5—10s,吸取上清至一新的塑料離心管中,模板制作完畢,4℃保存。
(4)PCR反應(yīng):反應(yīng)體系z(mì)ui適條件為:10mmol/lTris-HCL(pH8.38);50mmol/lHCL;1.5-2.5mmol/lMgCL2;200umol/ldNTP;2UDapDNA聚合酶。總反應(yīng)體系為50ul,反應(yīng)用去離子水均需用12000uw/cm2紫外燈照射。反應(yīng)如下表:
表 反應(yīng)程序
程 序 | 循 環(huán) | 溫度/℃ | 時(shí)間/min |
94 | 2 | ||
1 | 1 | 50 | 2 |
72 | 2 | ||
94 | 1 | ||
2 | 40 | 50 | 1 |
72 | 2 |
①在0.5ml塑料離心管中加入35.2ul去離子水及5ul*10Taq反應(yīng)緩沖液。
②依次加入下列成分:0.4uldNTPs(25mmol/l),0.4ulTaqDNA聚合酶(5U/ul),2ul引物。
③加2ul去離子水,總體積45ul。
④加2ul已制成的模板到反應(yīng)體系中。
⑤陽(yáng)性對(duì)照,內(nèi)對(duì)照各5ul加入到各自的反應(yīng)體系中。
⑥取一支含有以上反應(yīng)體系的離心管,加入5ul去離子水作為陰性對(duì)照管。
⑦在反應(yīng)體系中加入100ul礦物油。
(5)瓊脂糖凝膠電泳:PCR反應(yīng)結(jié)束后,進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,瓊脂糖凝膠濃度2%。電泳結(jié)束后,凝膠成像分析結(jié)果。
(6)結(jié)果分析:該方法為檢測(cè)支原體的定性方法,在電泳泳道上,MARKER、陽(yáng)性對(duì)照、內(nèi)對(duì)照均會(huì)出現(xiàn)不同的電泳條帶,當(dāng)被檢樣品泳道出現(xiàn)明亮條帶,且位置在陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照條帶位置之間,即可認(rèn)為該樣品被支原體污染。有時(shí)還會(huì)發(fā)現(xiàn)一條泳道出現(xiàn)多條,可能是該樣品感染兩種以上支原體所致。如果泳道內(nèi)條帶隱約出現(xiàn),則可懷疑有支原體污染,重做該樣品。