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QExactive一小時(shí)DDA鑒定DIA定量Hela 蛋白

閱讀:765      發(fā)布時(shí)間:2017-09-21
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數(shù)據(jù)非依賴性的掃描模式(data-independent acquisition, DIA)是
近幾年來發(fā)展的一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式 [1] 。它的理念是用二
級(jí)碎片離子進(jìn)行蛋白相對(duì)/定量。DIA 掃描模式中,超高分辨
質(zhì)譜對(duì)特定質(zhì)量范圍內(nèi)的所有母離子進(jìn)行碎裂,采集所有母離
子的碎片離子,并快速地依次掃描相鄰的母離子寬口內(nèi)的所有碎
片離子。DIA 的數(shù)據(jù)中包含了所有碎片離子的保留時(shí)間和強(qiáng)度信
息。用非常小的質(zhì)量偏差寬口(如 10 ppm)目標(biāo)性地抽提同一
肽段的多個(gè)子離子,計(jì)算子離子的強(qiáng)度,就能對(duì)該肽段進(jìn)行鑒定
和定量。DIA 定量相比傳統(tǒng)的基于母離子強(qiáng)度的 DDA 定量有選
擇性好,定量準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn) [1] ,所以 DIA 成為定量蛋白組學(xué)新的發(fā)
展方向。
Q Exactive HF 是賽默飛世爾科技在 2014 年的 ASMS 上推出的全
新靜電場(chǎng)軌道阱超高分辨質(zhì)譜儀(圖 1) [2,3] 。Q Exactive HF 采用
了分段式四極桿技術(shù)(Advanced Quadrupole Technology,AQT)
使離子傳輸效率至少提高了 2 倍;超高場(chǎng) Orbitrap 技術(shù),提高了
Orbitrap 掃描速度,在 15000 分辨率時(shí),二級(jí)譜圖的掃描速度是
20 Hz。這兩項(xiàng)技術(shù)提高了 QE HF 進(jìn)行 DDA、DIA 數(shù)據(jù)的采集能
力。本文用 1 小時(shí)快速色譜梯度對(duì) QE HF 的 DDA 鑒定能力和 DIA
定量能力進(jìn)行考察,同時(shí)從定量肽段數(shù)目和 CV 兩方面對(duì) DDA 定
量和 DIA 定量能力進(jìn)行比較。

使用儀器:Q Exactive HF 

 

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賽默飛色譜及質(zhì)譜

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