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細(xì)胞系STR鑒定
  • 細(xì)胞系STR鑒定

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更新時(shí)間:2024-03-14 09:36:23

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細(xì)胞系STR鑒定即通過STR(短串聯(lián)重復(fù))圖譜所建立細(xì)胞系的遺傳特征。一株細(xì)胞系的遺傳特征確立后,細(xì)胞系可以通過定期的檢測(cè),以防止出現(xiàn)細(xì)胞系被誤認(rèn)或交叉污染的情況。細(xì)胞系STR系鑒定是自2014年起開始推出的專業(yè)服務(wù),是國(guó)內(nèi)較早一批開展細(xì)胞系STR遺傳質(zhì)量鑒定服務(wù)的公司,迄今為止已有年的細(xì)胞STR鑒定服務(wù)經(jīng)驗(yàn),十余年的STR分型經(jīng)驗(yàn)。

細(xì)胞系鑒定即通過STR(短串聯(lián)重復(fù))圖譜所建立細(xì)胞系的遺傳特征。一株細(xì)胞系的遺傳特征確立后,細(xì)胞系可以通過定期的檢測(cè),以防止出現(xiàn)細(xì)胞系被誤認(rèn)或交叉污染的情況。


什么時(shí)候需細(xì)胞系鑒定?

  • 當(dāng)建立或獲得一個(gè)新的細(xì)胞系時(shí);

  • 一個(gè)涉及到細(xì)胞試驗(yàn)項(xiàng)目開始/結(jié)束時(shí)

  • 在細(xì)胞凍存之前,或細(xì)胞已連續(xù)培養(yǎng)2~3個(gè)月時(shí)

  • 發(fā)表文章或申請(qǐng)課題經(jīng)費(fèi)前

  • 細(xì)胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大時(shí)

  • 當(dāng)實(shí)驗(yàn)室使用超過一種細(xì)胞系時(shí),所有細(xì)胞系最好先鑒定以排除交叉污染的可能


如何進(jìn)行細(xì)胞系鑒定?

細(xì)胞系鑒定目前主要依據(jù)國(guó)際身份認(rèn)證委員會(huì)的標(biāo)準(zhǔn)。依據(jù)該標(biāo)準(zhǔn),可以通過多重?zé)晒釶CR技術(shù),對(duì)人源8個(gè)STR位點(diǎn)以及1個(gè)性別決定位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè)。下表為這些位點(diǎn)的遺傳信息。


圖片



STR 基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測(cè)來識(shí)別。然后通過一定的計(jì)算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。

圖片

采用DSMZ tools進(jìn)行細(xì)胞系比對(duì),其中包含來自于ATCC, DSMZ, JCRB 和 RIKEN數(shù)據(jù)庫(kù)的2455個(gè)細(xì)胞系STR數(shù)據(jù)。如果待檢測(cè)細(xì)胞未收錄于以上細(xì)胞庫(kù)或這是自行建立的新細(xì)胞系將無法進(jìn)行比對(duì),用戶需根據(jù)細(xì)胞分型結(jié)果自行與其他數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。




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