fish技術(shù)服務(wù)早期一般用于了解基因或染色體發(fā)生擴(kuò)增、缺失、融合或斷裂,適用于:產(chǎn)前診斷、產(chǎn)后遺傳病檢測、腫瘤診斷及預(yù)后評估等。樣本來源廣泛:組織、脫落細(xì)胞、羊水、血液、骨髓都可以檢測,且不僅限于新鮮樣本,2-3年的石蠟樣本都可以檢測。
FISH亦可檢測組織芯片中的核酸(目前常用于檢測ncRNA:microRNA、lncRNA、circRNA),可以知道核酸在幾十或幾百個標(biāo)本的表達(dá)定位情況,可用于分析核酸在癌與癌旁的表達(dá)差異、核酸表達(dá)與生存期的相關(guān)性、核酸表達(dá)與腫瘤的發(fā)生發(fā)展的關(guān)系等等。
fish技術(shù)服務(wù)實驗流程:
fish技術(shù)服務(wù)(Florescence In-Situ Hybridization簡稱FISH)是一種利用非放射性的熒光信號對原位雜交樣本進(jìn)行檢測的技術(shù)。它將熒光信號的高靈敏度、安全性,熒光信號的直觀性和原位雜交的高準(zhǔn)確性結(jié)合起來,通過熒光標(biāo)記的DNA探針與待測樣本的DNA進(jìn)行原位雜交,在熒光顯微鏡下對熒光信號進(jìn)行辨別和計數(shù),從而對染色體或基因異常的細(xì)胞、組織樣本進(jìn)行檢測和診斷,為各種基因相關(guān)疾病的分型、預(yù)前和預(yù)后提供準(zhǔn)確的依據(jù)。自20世紀(jì)80年代末,Pinkel和Heiles將FISH技術(shù)引入染色體檢測領(lǐng)域后,F(xiàn)ISH技術(shù)就在臨床診斷及科研工作中得到了廣泛的運(yùn)用,顯示出與一些傳統(tǒng)技術(shù)相比的明顯優(yōu)勢。
熒光原位雜交技術(shù)fish技術(shù)服務(wù)與傳統(tǒng)的免疫組織化學(xué)法(IHC)相比,F(xiàn)ISH具有良好的穩(wěn)定性和可重復(fù)性。目前免疫組織化學(xué)法正廣泛應(yīng)用于腫瘤等多個領(lǐng)域的臨床診斷。免疫組化的檢測對象是疾病相關(guān)的蛋白。由于蛋白的表達(dá)和本身的構(gòu)象受各種因素的影響很大(例如酸、堿和變性劑),檢測條件的穩(wěn)定性對檢測結(jié)果至關(guān)重要。此外,免疫組化檢測結(jié)果的判斷依賴于檢測者對顯色結(jié)果的主觀判斷,對于一些弱陽性的結(jié)果,不同的檢測者容易產(chǎn)生分歧。上述的因素都可能影響醫(yī)生對病情的終診斷。
熒光原位雜交技術(shù)fish技術(shù)服務(wù)的對象是細(xì)胞中的DNA,致密的雙螺旋結(jié)構(gòu)使DNA可以歷經(jīng)千百萬年而依然保持良好,其結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,不易被環(huán)境條件影響,為熒光原位雜交技術(shù)的穩(wěn)定提供了良好的基礎(chǔ)。此外,熒光原位雜交結(jié)果的判定借助于對熒光的顏色判斷和信號計數(shù),客觀地量化了檢測地結(jié)果。如果借助于相應(yīng)的FISH操作系統(tǒng)(例如Abbott-Vysis公司的Hybrit雜交儀和VP2000樣本預(yù)處理系統(tǒng))和染色體成像系統(tǒng)就能實現(xiàn)整個FISH操作的自動化,大限度的降低操作者和檢測者的主觀因素,確保結(jié)果的準(zhǔn)確性。
PCR由于靈敏度高,操作簡便快捷是近年來應(yīng)用比較多的基因診斷技術(shù),但PCR診斷技術(shù)的假陰性和假陽性的比例較高,對同一樣本也只能作一次分析,不能重復(fù)實驗結(jié)果。隨著探針技術(shù)的不斷發(fā)展,F(xiàn)ISH目前的靈敏度已經(jīng)接近或達(dá)到PCR的水平,并能很好彌補(bǔ)PCR技術(shù)的局限。熒光原位雜交技術(shù)fish檢測不僅有極低的假陽性、假陰性的比例(以Abbott-Vysis的產(chǎn)前診斷探針為例,29,000例的使用結(jié)果證實正確率高達(dá)99.9%),還能對同一樣本進(jìn)行多次的FISH操作以及利用不同顏色的熒光探針一次檢測多個染色體或基因的異常,大大節(jié)省了檢測的時間。此外,通過fish技術(shù)服務(wù)可以對染色體或特定基因的數(shù)目異常,特定片斷的缺失、易位和重排進(jìn)行診斷研究。
熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization, FISH)技術(shù)是一種應(yīng)用非放射性熒光物質(zhì)依靠核酸探針雜交原理在核中或染色體上顯示DNA序列位置的方法。該技術(shù)具有快速、安全、靈敏度高以及探針可長期保存等特點,目前已廣泛應(yīng)用于細(xì)胞遺傳學(xué)、腫瘤生物學(xué)、基因定位、基因作圖、基因擴(kuò)增,產(chǎn)前診斷及哺乳動物染色體進(jìn)化研究等領(lǐng)域。
簡單點說就是堿基互補(bǔ)配對原則,就是我們將外源核酸(也就是常說的分子探針)與組織、細(xì)胞上待檢測的DNA或RNA進(jìn)行配對,形成核酸雜交分子,再經(jīng)過一定手段將這個雜交分子的位置顯示出來。
RNA—RNA>DNA—RNA>DNA—DNA
fish技術(shù)服務(wù)已經(jīng)在細(xì)胞遺傳學(xué)、腫瘤生物學(xué)、基因定位、基因作圖、基因擴(kuò)增、產(chǎn)前診斷及哺乳動物染色體進(jìn)化研究等領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用。
熒光原位雜交簡化了染色體結(jié)構(gòu)變異的檢測。如植物染色體的非整倍體是由于染色體行為異常,即可能是雙親配子染色體數(shù)目和結(jié)構(gòu)差異引起或染色體親緣關(guān)系較遠(yuǎn)等因素導(dǎo)致。利用原位雜交可比較容易地檢測出缺失、附加或替換的染色體。
FISH空間分辨率和敏感性使得親本和擴(kuò)增基因在抗病蟲害細(xì)胞中定位成為可能。被擴(kuò)增基因主要在同一染色體臂上,但離初始親本基因有一定距離,且經(jīng)常獨立地位于染色體端粒部位;FISH分析表明細(xì)胞斷裂可能是由于染色體含有擴(kuò)增區(qū)域的結(jié)構(gòu)重排。同時用FISH 可定位轉(zhuǎn)基因植物中外源基因位置和拷貝數(shù),此法在番茄、煙草、大麥、小麥、黑麥等作物中已獲成功。利用FISH技術(shù)也可檢測一些與遺傳性疾病相關(guān)的基因缺失,如成功檢測了aniridia疾病患者的缺失基因。
熒光原位雜交的基因定位技術(shù)有著廣泛的應(yīng)用。PP2Ac突變型肺癌相關(guān)基因在染色體區(qū)域的定位,熒光顯微鏡下觀察記錄和分析雜交信號的特征。結(jié)果在正常人淋巴細(xì)胞的染色體5q23-31可見明顯雜交信號,在GLC-82細(xì)胞的5號和7號染色體上出現(xiàn)較強(qiáng)信號。說明點突變引起PP2Ac活性改變,從而基因易位,導(dǎo)致肺腫瘤的產(chǎn)生。FISH技術(shù)與生化、計算機(jī)和重組DNA技術(shù)結(jié)合檢測Alu位點,表明DNA序列與帶型有關(guān)。用FISH技術(shù)對人類基因組中編碼基因分布的研究揭示,基因主要集中在染色體上G+C(占全基因組35% )的DNA區(qū)段。FISH技術(shù)為著絲粒結(jié)構(gòu)研究提供了重要手段。應(yīng)用FISH技術(shù)可直接觀察染色體端粒,這簡化了染色體在核內(nèi)的結(jié)構(gòu)和功能研究。
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