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腸道菌群操控宿主的飲食模式是為了生存和繁殖，也是為了消滅隔壁的微生物競爭對手。腸道是這些細菌的戰(zhàn)場，操縱宿主的腦以使其攝取特定的食物是它們的主要武器。有時候它們甚至會因為令宿主吃下有害的食物而危及宿主。腸道菌群不夠多樣性（也就是說一種細菌憑借對腦的操控殺光了其他細菌）的人更容易肥胖。 
腸道菌群并不是肥胖的因素，微生物群可能具有傳染性，包括那些造成過度進食的細菌。  
但是不能馬上用一堆抗生素把腸道里的細菌消滅，因為這些微生物群具備“營養(yǎng)攝取和免疫發(fā)展”等重要功能，也就是說它們?yōu)樯眢w提供維生素和礦物質(zhì)，并且建立起身體免疫系統(tǒng)，以此作為居住在體內(nèi)的回報。這些微生物群還幫助宿主消化特定食物。比如生活在日本的人有一種特殊的細菌幫助他們消化海藻。非洲一些食用高粱稈的兒童擁有能幫助他們消化纖維素的細菌。 
不過幸運的是，通過相對簡單的飲食習慣改變，每個人的微生物群也都很容易得到控制。飲食發(fā)生改變后腸道菌群自我重建所需的時間是24小時，改變腸道里的細菌有助于改變飲食習慣，反之亦然。