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翌圣生物科技（上海）股份有限公司
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新品預(yù)告 | cfDNA和FFPE DNA提取試劑盒即將上線！
MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit
cfDNA是指在循環(huán)血中，游離于細(xì)胞外的部分降解了的機(jī)體內(nèi)源性 DNA，因其在疾病診斷和檢測(cè)如液體活檢，NIPT等方面的巨大潛力，相關(guān)的研究和實(shí)驗(yàn)在臨床中應(yīng)用日益廣泛，且發(fā)展極其迅速。cfDNA在健康成年人中濃度大約只有10~30 ng/mL，且片段僅有170 bp左右。從樣本采集運(yùn)輸，到血漿獲取，再到樣本裂解、捕獲、清洗、洗脫，最后到下游應(yīng)用，每一步都有巨大的挑戰(zhàn)。
MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit適用于從1-5mL的血漿、血清樣本中的提取高質(zhì)量cfDNA，操作簡(jiǎn)單、快速。本產(chǎn)品采用*的磁珠和精心優(yōu)化的緩沖體系，可最大限度的純化回收游離DNA。提取的核酸產(chǎn)量高，質(zhì)量穩(wěn)定可靠，最大限度的去除蛋白等其他抑制物，適用于各種下游應(yīng)用實(shí)驗(yàn)，如熒光定量PCR和二代測(cè)序等，兼容手動(dòng)提取和自動(dòng)提取流程。
產(chǎn) 品 特 點(diǎn)
◎ 提取質(zhì)量高: 總量,純度均較高,滿足后續(xù)建庫要求；
產(chǎn) 品 優(yōu) 勢(shì)
◎ 提取總量?jī)?yōu)異
以1 mL人血漿為樣本，YEASEN提取總量好于競(jìng)品N，其組內(nèi)穩(wěn)定性優(yōu)于競(jìng)品Q。
圖1. 各試劑盒提取cfDNA結(jié)果
◎ 抑制性殘留物少
qPCR擴(kuò)增TERT基因，競(jìng)品Q（藍(lán)色）、YEASEN（橙色）、競(jìng)品N（綠色），與競(jìng)品相比，YEASEN擴(kuò)增曲線無顯著差異，表明YEASEN提取試劑盒可獲得較為純凈，無擴(kuò)增抑制物殘留的cfDNA。
圖2. TERT基因qPCR結(jié)果
圖3. TERT基因qPCR擴(kuò)增Ct值
◎ 文庫產(chǎn)量高
取1ng cfDNA，采用建庫試劑盒Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit for Illumina®（12201ES08），PCR循環(huán)數(shù)=14進(jìn)行建庫，文庫取2μL電泳，與競(jìng)品相比，YEASEN產(chǎn)量及文庫大小無差異，性能較為優(yōu)異。
圖4. 1ng cfDNA建庫結(jié)果
圖5. 1ng cfDNA建庫后文庫大小分布
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產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編號(hào) | 規(guī)格 |
MolPure® Magnetic Circulating Cell-Free DNA Kit | 18381ES50 | 50 T |
MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit
腫瘤組織幾乎是病人愿意被切下來的組織，也是疾病回顧性研究的最佳研究對(duì)象。但受限于醫(yī)院的保存條件，臨床離體的組織容易喪失原有正常的結(jié)構(gòu)和功能。使用福爾馬林固定石蠟包埋處理的樣本（Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded，F(xiàn)FPE）可以在常溫保留很久，所以FFPE就成了醫(yī)院里常用的樣本。但福爾馬林的固定容易使組織中的核酸發(fā)生降解以及導(dǎo)致和分子間的交聯(lián)，因而從石蠟切片中提取出高質(zhì)量核酸是腫瘤基因檢測(cè)領(lǐng)域大大的難題。
MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit脫蠟過程不涉及有毒試劑，采用精心優(yōu)化的緩沖體系，可最大限度的分離純化高純度DNA。提取的核酸純度高，質(zhì)量穩(wěn)定可靠，適用于各種下游應(yīng)用實(shí)驗(yàn)，如酶切、PCR、RT-qPCR等。
產(chǎn) 品 特 點(diǎn)
◎ 安全無毒：采用無毒性脫蠟液脫蠟，不涉及二甲苯等有機(jī)試劑；
產(chǎn) 品 優(yōu) 勢(shì)
◎ 提取質(zhì)量高
以10mg小鼠石蠟包埋組織為樣本，100μL洗脫，與競(jìng)品相比，YEASEN提取產(chǎn)量無明顯差異。其中磁珠法總量、純度整體優(yōu)于競(jìng)品Q和競(jìng)品T。
圖6. 各試劑盒 提取FFPE DNA結(jié)果
表1. 各試劑盒提取FFPE DNA純度
試劑盒 | 260/280 | 260/230 |
Q-離心柱 | 2.04 | 2.30 |
2.01 | 2.24 | |
T-離心柱 | 1.98 | 2.34 |
1.99 | 2.39 | |
YEASEN-離心柱 | 2.03 | 2.04 |
2.00 | 2.32 | |
YEASEN-磁珠 | 1.98 | 2.30 |
1.98 | 2.31 |
◎ 抑制性殘留物少
電泳擴(kuò)增內(nèi)參Gapdh基因，內(nèi)參擴(kuò)增無顯著差異，抑制性產(chǎn)物少，整體提取質(zhì)量較優(yōu)。
圖7. 提取DNA中Gapdh基因擴(kuò)增
◎ 建庫性能優(yōu)
取50ng FFPE DNA，采用建庫試劑盒Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina®（12205ES08），PCR循環(huán)數(shù)=7進(jìn)行建庫，文庫進(jìn)行電泳，分析發(fā)現(xiàn)，與競(jìng)品相比，YEASEN產(chǎn)量及文庫大小無異常，其中YEASEN磁珠法優(yōu)于競(jìng)品。.
圖8. 50ng FFPE DNA建庫結(jié)果
圖9. FFPE DNA建庫后片段大小分布
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產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編號(hào) | 規(guī)格 |
MolPure® Magnetic FFPE DNA Kit | 18371ES60 | 50 T |
