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文獻(xiàn)分享|華中師大戴雄風(fēng)團(tuán)隊(duì)揭示細(xì)菌經(jīng)受氧化脅迫的關(guān)鍵性生理指標(biāo)

2019-6-12  閱讀(673)

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在自然界中,細(xì)菌需要對抗各種逆境環(huán)境,包括高溫、氧化、強(qiáng)酸以及高滲透壓等,其中氧化脅迫是一種常見逆境。當(dāng)細(xì)胞遭遇氧化脅迫時(shí), 一個(gè)明顯的表征即為生長抑制,之后,細(xì)胞需要建立逆境響應(yīng)防御體系來清除自由氧,進(jìn)而恢復(fù)生長;然而,當(dāng)氧化脅迫程度較高時(shí),細(xì)胞將無法存活。但迄今為止,決定細(xì)胞耐受氧化脅迫極限的生理學(xué)關(guān)鍵因素仍未得到解答


2019年5月27日,華中師范大學(xué)戴雄風(fēng)團(tuán)隊(duì)在生物化學(xué)與分子生物學(xué)雜志《Nucleic Acids Research》 IF11.6)發(fā)表了題為“Maintenance of translational elongation rate underlies the survival of Escherichia coli during oxidative stress”的研究論文。


以往對逆境生理的研究主要集中在轉(zhuǎn)錄水平的響應(yīng)(比如全局逆境響應(yīng)體系,RpoS regulon),而該項(xiàng)研究是目前為此發(fā)現(xiàn)一種特定的逆境可以在翻譯水平抑制細(xì)菌的逆境響應(yīng)過程證明了細(xì)菌維持核糖體“速度”的重要生理性意義,揭示了核糖體翻譯延伸過程是決定細(xì)菌能否經(jīng)受氧化脅迫的關(guān)鍵性生理指標(biāo)。

戴雄風(fēng)團(tuán)隊(duì)以大腸桿菌為研究對象,采用定量生物學(xué)手段,對細(xì)胞耐受氧化脅迫的生理機(jī)制進(jìn)行了深入的剖析。研究表明,過氧化氫脅迫造成了細(xì)菌tRNA的急劇降解,進(jìn)一步導(dǎo)致了核糖體翻譯延伸速率的極大降低,全局性地抑制了細(xì)菌的逆境防御體系。核糖體翻譯延伸速率的降低導(dǎo)致細(xì)菌合成 oxyR regulon相關(guān)逆境響應(yīng)蛋白的顯著滯后。而在閾值濃度下(6 mM),核糖體的翻譯延伸*停滯,導(dǎo)致細(xì)菌氧化脅迫防御體系的全局性崩潰,進(jìn)而無法在氧化脅迫中存活。
 

示意圖:過氧化氫介導(dǎo)的氧化脅迫抑制細(xì)菌的逆境響應(yīng)過程進(jìn)而抑制細(xì)菌的存活


通訊作者:戴雄風(fēng)(華中師范大學(xué))
作者:朱曼璐(華中師范大學(xué))


該研究是戴雄風(fēng)團(tuán)隊(duì)今年第二次在 《Nucleic Acids Research》 發(fā)文。此前3月27號,課題組發(fā)表了題為“Growth suppression by altered (p)ppGpp levels results from non-optimal resource allocation in Escherichia coli”的研究論文,揭示了“魔斑”(p)ppGpp對細(xì)菌生長、蛋白質(zhì)翻譯與基因表達(dá)的全局調(diào)控作用。該研究選擇使用了YEASEN的Canace gold高保真酶(Yeasen,CAT#10149,2× Hieff Canace® Gold PCR Master Mix)。
(此處放上期文獻(xiàn)解讀鏈接)
值得注意的是,戴雄風(fēng)團(tuán)隊(duì)此項(xiàng)研究再次選擇了YEASEN的定量產(chǎn)品(Yeasen CAT#11201,Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix (No Rox),用于開展細(xì)菌經(jīng)受氧化脅迫后tRNA含量變化的測定這一關(guān)鍵實(shí)驗(yàn)。

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