常見(jiàn)問(wèn)題解答:
Q:在用Zymo的重亞硫酸鹽試劑盒處理前,起始DNA樣本應(yīng)該儲(chǔ)存在TE,水,還是其他緩沖液中?
A:水和TE緩沖液均可用來(lái)儲(chǔ)存DNA,并且不會(huì)對(duì)轉(zhuǎn)化過(guò)程造成干擾。
Q: 為什么使用EZ DNA Methylation-Direct Kit,我的DNA沒(méi)有得到*的轉(zhuǎn)化?
A: 1) 如果是固體樣本,很可能是處理的樣本量過(guò)大,而導(dǎo)致不*DNA轉(zhuǎn)化;
2)如果是FFPE組織樣本,有可能是DNA已大規(guī)模受損以及/或者交聯(lián),導(dǎo)致不*轉(zhuǎn)化;
3)如果在Proteinase K消化后,沒(méi)有通過(guò)離心去除碎片,則可能會(huì)干擾重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化過(guò)程,導(dǎo)致DNA的不*轉(zhuǎn)化;
Q: 為什么EZ-96 DNA Methylatioin 甲基化(96孔板)產(chǎn)品線有兩種不同的目錄號(hào)?
A: 這兩種不同的目錄號(hào)是用來(lái)區(qū)分試劑盒內(nèi)不同類(lèi)型的96孔板。深孔板和淺孔板均適用于大多數(shù)離心機(jī)和微板架。如下闡釋了這兩類(lèi)96孔板的區(qū)別:
Silicon-A | Zymo-Spin I-96 | |
款式 | 淺孔 | 深孔 |
尺寸(H x W x L) | 19 mm x 83 mm x 125 mm | 35 mm x 83 mm x 125 mm |
結(jié)合/收集板組合高度 | 43 mm | 60 mm |
結(jié)合力/zui小洗脫體積 | 5µg/30µl per well | 5µg/15µl per well |
貨號(hào) | D5003, D5007, D5022, D5032 | D5004,D5008, D5023, D5033 |
Q: Zymo 重亞硫酸鹽處理試劑盒與illumina技術(shù)平臺(tái)兼容嗎?
A: 是的,Zymo的EZ DNA Methylation Kit技術(shù)被illumina推薦使用在其GoldenGate和Infinium Assays平臺(tái)上;
Q: 用Zymo的EZ DNA Methylation Kit轉(zhuǎn)化得到的DNA可用作哪些下游分析應(yīng)用?
A: 用Zymo的任何一款EZ DNA Methylation kit轉(zhuǎn)化得到的DNA,可適用于后續(xù)的各類(lèi)測(cè)序分析法,Ms-SNuPE, COBRA, Bisulfite-PCR, MSP, Bisulfite-sequencing, mass spectroscopy (如: Sequenom的EpiTYPER), 以及其他分析方法。
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