八聚體錐形孔跨膜蛋白——MspA蛋白
恥垢分枝桿菌毒素蛋白(Mycobacterium smegmatisporin A, MspA)是一種通道形成蛋白,用于小分子和水的通道。MspA是分子量 20 kDa 的單體蛋白構(gòu)建的同源性八聚體,其形狀為“八”字形杯狀結(jié)構(gòu)。MspA長度大約 1 nm,具有大約1 nm的寬度收縮區(qū),兩側(cè)有明顯較大的直徑區(qū)域。
MspA 擁有很好的化學(xué)穩(wěn)定性和熱穩(wěn)定性,在 100℃的溫度下活性能耐受 30 min,在80℃的2% SDS條件中培養(yǎng)15分鐘依然可以保持良好的通道活性,在 pH 0~14 的范圍內(nèi)保持穩(wěn)定,同時MspA具有易于進行多位點突變修飾。
圖1 MspA突變體的結(jié)構(gòu)與表達
MspA是一種納米孔分析的理想材料
MspA 的幾何形狀可以提供很好的空間分辨率,因為離子電流阻塞的特征主要是由穿過孔隙狹窄區(qū)域的多核苷酸片段決定的。另外,MspA 擁有很好的化學(xué)穩(wěn)定性和熱穩(wěn)定性,最后,MspA可以為多種氨基酸替代保留高水平表達和通道活性,是一種通過定點誘變進行工程設(shè)計的理想選擇。近年來,MspA蛋白在單分子檢測領(lǐng)域的研究和應(yīng)用得到越來越多關(guān)注,MspA蛋白納米孔最重要的應(yīng)用集中在DNA測序方面,主要用于檢測表征ssDNA。
圖2 納米孔測序原理
MspA在生物和醫(yī)學(xué)展現(xiàn)應(yīng)用潛力
MspA作為一種具有錐形結(jié)構(gòu)的八聚體孔道蛋白,通過引入突變開發(fā)工程化MspA孔道,可以實現(xiàn)多種單糖直接區(qū)分,說明MspA是核酸與多種生物大分子檢測的有力品。
MspA是細菌細胞外膜上親水性營養(yǎng)溶質(zhì)的主要通道,負電性密集的收縮區(qū)具有天冬氨酸的雙圈結(jié)構(gòu),能夠與陽離子結(jié)合。使用合適的通道阻斷劑可以堵塞MspA蛋白孔,則親水性營養(yǎng)溶質(zhì)不能輸送進細菌體內(nèi),造成細菌休眠,同時可以破壞細胞外壁的穩(wěn)定性,增強細菌的抗生素易感性,對于疾病治療具有重要作用。
圖3 MspA實現(xiàn)單糖區(qū)分
珀羅汀基于無細胞體系成功表達MspA八聚體跨膜蛋白
客戶案例
收到MspA序列后,珀羅汀構(gòu)建融合了GFP的線性化表達模版,隨后,采用自主研發(fā)的PLD無細胞蛋白表達試劑盒(膜蛋白(或困難蛋白)表達增強版,#PLDK002)進行蛋白合成,蛋白合成后采用9種方案進行合適的表面活性劑篩選,對于目的蛋白的表達結(jié)果采用SDS-PAGE進行鑒定。
圖4 目的蛋白表達鑒定
(channel 1:空白對照;channel 2~10:不同方案的目的膜蛋白表達情況;channel 11:marker)
之后,選擇PLDK002-C(channel 3)和PLDK002-I(channel 9) 的無細胞蛋白表達體系進行第二輪優(yōu)化。優(yōu)化結(jié)果顯示,channel 5的無細胞蛋白表達方案可以正確表達該MspA的單體與多聚體。
圖5 MspA目的蛋白表達鑒定
客戶評價
這次選擇比較新穎的無細胞蛋白表達體系進行MspA表達,珀羅汀僅用4天完成小試,相當(dāng)快速,膠圖結(jié)果中單體和多聚體的亞基都是對的。相比于細胞表達體系,無細胞體系可以輕松實現(xiàn)多亞基膜蛋白表達及正確組裝的難題。對于復(fù)雜多亞基超結(jié)構(gòu)膜蛋白的結(jié)構(gòu)研究和物理、化學(xué)、生物性質(zhì)研究而言,這無疑是巨大的福音。
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Tom Z, Mikhail P,et al.Single-molecule DNA detection with an engineered MspA protein nanopore. PNAS,doi 10.1073 (2008).
SY Zhang,ZY Cao,et al.A Nanopore-Based Saccharide Sensor. Angew.Chem. Int.Ed.doi.org/10.1002/anie.202203769 (2022).
Ayomi S. Perera,et al. Channel Blocking of MspA Revisited. Langmuir.doi.org/10.1021/la3037296 (2012).
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