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優(yōu)化電穿孔技術(shù)構(gòu)建馬爾尼菲青霉轉(zhuǎn)化體系

來源:威尼德生物科技(北京)有限公司   2024年11月26日 14:48  

一、引言


馬爾尼菲青霉(Penicillium marneffei)作為一種更好的雙相型真菌,在自然界中呈現(xiàn)出復(fù)雜的生活史,其在 25℃左右環(huán)境下呈菌絲相生長,而在 37℃人體體溫環(huán)境下則轉(zhuǎn)變?yōu)榻湍赶啵@種特殊的相變特性與它對(duì)人體的致病性緊密相關(guān)。作為東南亞地區(qū)及我國南方部分省份常見的深部致病真菌,馬爾尼菲青霉可引發(fā)嚴(yán)重的系統(tǒng)性感染,尤其在免疫功能低下人群,如艾滋病患者、受者等群體中,感染率及致死率頗高,對(duì)公共衛(wèi)生安全構(gòu)成顯著威脅。


深入探究馬爾尼菲青霉的致病機(jī)制、毒力因子以及開展抗真菌藥物靶點(diǎn)篩選等研究工作,迫切依賴高效、穩(wěn)定的基因轉(zhuǎn)化體系?;蜣D(zhuǎn)化技術(shù)能夠?qū)⑼庠椿蚓珳?zhǔn)導(dǎo)入真菌細(xì)胞內(nèi),通過跟蹤標(biāo)記基因表達(dá)、分析目的基因敲除或過表達(dá)后的表型變化,實(shí)現(xiàn)對(duì)真菌基因功能全方面解讀。目前,馬爾尼菲青霉的轉(zhuǎn)化方法雖有多種嘗試,諸如原生質(zhì)體介導(dǎo)轉(zhuǎn)化、農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化等,但均存在各自局限。原生質(zhì)體法操作繁瑣,原生質(zhì)體制備與再生環(huán)節(jié)易受環(huán)境因素干擾,導(dǎo)致轉(zhuǎn)化效率波動(dòng)大且重復(fù)性差;農(nóng)桿菌介導(dǎo)法則面臨著宿主范圍限制、轉(zhuǎn)化流程冗長等不足。


電穿孔技術(shù),憑借其原理上借助短暫高壓電脈沖在細(xì)胞膜上形成可逆性微孔,促使外源 DNA 高效進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)部,具有操作簡便、轉(zhuǎn)化速度快、對(duì)細(xì)胞生理狀態(tài)影響相對(duì)小等優(yōu)勢,在眾多微生物轉(zhuǎn)化領(lǐng)域嶄露頭角。然而,在馬爾尼菲青霉轉(zhuǎn)化應(yīng)用中,尚未形成一套標(biāo)準(zhǔn)化、高效的電穿孔參數(shù)及流程,亟需系統(tǒng)性優(yōu)化,以解鎖其在該真菌研究中的巨大潛力,為馬爾尼菲青霉基礎(chǔ)研究與臨床防控研究搭建堅(jiān)實(shí)技術(shù)橋梁。

二、材料與方法

(一)菌株與質(zhì)粒


實(shí)驗(yàn)所采用的馬爾尼菲青霉菌株分離自臨床確診患者樣本,經(jīng)多輪純化與鑒定確保遺傳背景單一穩(wěn)定。選用攜帶潮霉素抗性基因(hph)作為篩選標(biāo)記的質(zhì)粒 pUC-HPH,該質(zhì)粒含有真菌通用啟動(dòng)子,可驅(qū)動(dòng)抗性基因在馬爾尼菲青霉中高效表達(dá),以保證后續(xù)轉(zhuǎn)化子篩選準(zhǔn)確性與高效性。

(二)培養(yǎng)基配制


  1. 完整培養(yǎng)基(CM):包含葡萄糖 20g/L、蛋白胨 5g/L、酵母提取物 3g/L、瓊脂 20g/L(固體培養(yǎng)基添加),用于馬爾尼菲青霉常規(guī)培養(yǎng)與活化,提供豐富營養(yǎng)成分支持菌株旺盛生長,維持其正常生理代謝與形態(tài)發(fā)育。

  2. 電穿孔緩沖液(EB):基礎(chǔ)成分為蔗糖 0.5 - 1.5M、HEPES 10 - 50mM、MgCl? 1 - 10mM,pH 值精確調(diào)控在 6.5 - 7.5 區(qū)間。蔗糖作為滲透壓調(diào)節(jié)劑,維持細(xì)胞內(nèi)外滲透壓平衡,避免細(xì)胞在電脈沖沖擊下過度失水或吸水破裂;HEPES 保障緩沖體系酸堿穩(wěn)定性,為細(xì)胞營造穩(wěn)定化學(xué)微環(huán)境;MgCl?有助于穩(wěn)定細(xì)胞膜結(jié)構(gòu),協(xié)同提升電穿孔過程細(xì)胞膜對(duì) DNA 攝取能力。通過設(shè)置多組不同濃度梯度組合的 EB 緩沖液,篩選最適配馬爾尼菲青霉電穿孔的緩沖液配方。

(三)感受態(tài)細(xì)胞制備


  1. 挑取經(jīng) CM 培養(yǎng)基活化的馬爾尼菲青霉酵母相單菌落,接種至含 50mL 液體 CM 培養(yǎng)基的三角瓶中,25℃、180r/min 振蕩培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長期(通過監(jiān)測 OD???值,控制在 0.8 - 1.2 范圍)。

  2. 4℃、5000r/min 離心 10min 收集菌體,用預(yù)冷的無菌水洗滌 2 - 3 次,去除培養(yǎng)基殘留成分,減輕對(duì)后續(xù)電穿孔過程干擾。

  3. 再以適量預(yù)冷 EB 緩沖液重懸菌體,冰浴孵育 30 - 60min,期間輕柔顛倒混勻數(shù)次,促使細(xì)胞進(jìn)入感受態(tài),便于接納外源 DNA。

(四)電穿孔操作


  1. 取 100μL 制備好的感受態(tài)細(xì)胞與 1 - 10μg 線性化處理后的 pUC-HPH 質(zhì)粒輕柔混勻,轉(zhuǎn)移至預(yù)冷的電穿孔杯(電極間距 0.2 - 0.4cm)中,冰上靜置 5 - 10min,使細(xì)胞與 DNA 充分結(jié)合。

  2. 運(yùn)用電穿孔儀(可精確調(diào)控電壓、脈沖時(shí)間、脈沖次數(shù)等參數(shù))施加不同參數(shù)組合的電脈沖。電壓設(shè)置在 500 - 2000V 范圍,以 200V 為梯度遞增;脈沖時(shí)間從 1 - 10ms 區(qū)間按 1ms 步長變化;脈沖次數(shù)設(shè)為 1 - 5 次,通過全面交叉組合實(shí)驗(yàn),探究最佳電穿孔條件。

  3. 電穿孔結(jié)束后,迅速加入 900μL 預(yù)冷的 CM 培養(yǎng)基,輕柔混勻后轉(zhuǎn)移至無菌離心管,25℃、100r/min 低速振蕩復(fù)蘇培養(yǎng) 1 - 2h,助于細(xì)胞修復(fù)電穿孔造成的膜損傷,穩(wěn)定攝取外源 DNA 并啟動(dòng)基因表達(dá)。

(五)轉(zhuǎn)化子篩選與鑒定


  1. 將復(fù)蘇后的菌液梯度稀釋,涂布于含潮霉素(100 - 300μg/mL)的 CM 固體培養(yǎng)基平板上,25℃倒置培養(yǎng) 3 - 7 天,直至長出肉眼可見單菌落。潮霉素抗性篩選確保僅攝取并穩(wěn)定整合質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化子存活生長。

  2. 隨機(jī)挑取多個(gè)抗性單菌落,轉(zhuǎn)接至新的含潮霉素 CM 平板及不含潮霉素 CM 平板,驗(yàn)證抗性穩(wěn)定性與遺傳特性。同時(shí),提取轉(zhuǎn)化子基因組 DNA,利用 PCR 技術(shù)擴(kuò)增 hph 基因片段,通過電泳檢測擴(kuò)增產(chǎn)物條帶,確證外源基因整合入馬爾尼菲青霉基因組情況,進(jìn)一步借助 Southern blot 雜交精準(zhǔn)鑒定整合拷貝數(shù)與位點(diǎn),全方面評(píng)估轉(zhuǎn)化體系可靠性與穩(wěn)定性。

三、結(jié)果與分析

(一)電穿孔緩沖液優(yōu)化結(jié)果


在不同蔗糖、HEPES、MgCl?濃度組合的 EB 緩沖液測試中,當(dāng)蔗糖濃度為 1.0M、HEPES 濃度為 30mM、MgCl?濃度為 5mM,pH 值為 7.0 時(shí),電穿孔后轉(zhuǎn)化子長出數(shù)量最多。相較于基礎(chǔ)配方(蔗糖 0.5M、HEPES 10mM、MgCl? 1mM),轉(zhuǎn)化效率提升約 2.5 倍。高濃度蔗糖有效維持細(xì)胞滲透壓,減少電脈沖下細(xì)胞破裂;適宜 HEPES 和 MgCl?含量協(xié)同優(yōu)化細(xì)胞膜狀態(tài),利于 DNA 分子接近與進(jìn)入細(xì)胞,凸顯緩沖液成分精準(zhǔn)調(diào)配對(duì)電穿孔效果的關(guān)鍵支撐。

(二)電穿孔參數(shù)優(yōu)化結(jié)果


  1. 電壓影響:在 500 - 2000V 測試區(qū)間,當(dāng)電壓為 1200V 時(shí),轉(zhuǎn)化子數(shù)量達(dá)峰值。低于此電壓,細(xì)胞膜微孔形成不足,DNA 進(jìn)入受阻,轉(zhuǎn)化效率低下;高于 1200V 則細(xì)胞損傷嚴(yán)重,死亡率飆升,存活細(xì)胞接納外源 DNA 并正常轉(zhuǎn)化能力銳減,印證合適電壓是平衡膜穿孔與細(xì)胞存活的 “支點(diǎn)”。

  2. 脈沖時(shí)間影響:脈沖時(shí)間在 4 - 6ms 時(shí),轉(zhuǎn)化效率顯著優(yōu)于其他時(shí)長設(shè)置,此時(shí)給予細(xì)胞足夠時(shí)間形成穩(wěn)定微孔并攝取 DNA,過長易破壞膜修復(fù)機(jī)制致細(xì)胞失活,過短則 DNA 遷移不充分,彰顯精準(zhǔn)脈沖時(shí)長把控對(duì)轉(zhuǎn)化成敗的決定性意義。

  3. 脈沖次數(shù)影響:脈沖次數(shù)為 3 次時(shí),轉(zhuǎn)化子產(chǎn)出量優(yōu)異,多次脈沖適度累加微孔形成與 DNA 導(dǎo)入效果,但超 3 次后,細(xì)胞累積損傷遠(yuǎn)超收益,轉(zhuǎn)化效率隨細(xì)胞活力下降而降低,表明適度脈沖刺激是高效轉(zhuǎn)化 “催化劑”。

(三)轉(zhuǎn)化子鑒定結(jié)果


經(jīng)潮霉素抗性平板篩選、PCR 擴(kuò)增及 Southern blot 分析,挑取的轉(zhuǎn)化子均穩(wěn)定攜帶 hph 基因,且多數(shù)呈現(xiàn)單拷貝整合入基因組,遺傳穩(wěn)定,在無潮霉素培養(yǎng)基連續(xù)傳代 5 次后仍保留抗性,有力證實(shí)優(yōu)化電穿孔體系可介導(dǎo)外源基因精準(zhǔn)、穩(wěn)定整合,滿足后續(xù)長期遺傳學(xué)研究需求。

四、討論


本研究成功優(yōu)化電穿孔技術(shù)構(gòu)建馬爾尼菲青霉轉(zhuǎn)化體系,關(guān)鍵在于精細(xì)雕琢電穿孔各環(huán)節(jié)要素。緩沖液成分協(xié)同互作,從物理化學(xué)層面 “呵護(hù)” 細(xì)胞度過電脈沖沖擊;電壓、脈沖時(shí)間、次數(shù) “三位一體” 精密平衡,突破以往轉(zhuǎn)化 “瓶頸”。與傳統(tǒng)轉(zhuǎn)化方法相比,新體系摒棄原生質(zhì)體制備繁瑣流程與脆弱再生環(huán)節(jié),規(guī)避農(nóng)桿菌介導(dǎo)的復(fù)雜互作限制,轉(zhuǎn)化周期從常規(guī)數(shù)周縮至 1 - 2 周,效率提升 3 - 4 倍,穩(wěn)定性大幅增強(qiáng)。


在醫(yī)學(xué)真菌研究版圖中,此體系為馬爾尼菲青霉致病性基因挖掘、抗藥機(jī)制剖析點(diǎn)亮明燈。借助該工具可敲除疑似毒力基因,對(duì)比野生株與突變株感染模型差異,鎖定致病關(guān)鍵因子;針對(duì)耐藥株,可轉(zhuǎn)化熒光標(biāo)記耐藥基因,追蹤表達(dá)調(diào)控,解析耐藥根源。未來,持續(xù)拓展該體系適配外源基因類型、優(yōu)化多基因共轉(zhuǎn)化流程,有望將馬爾尼菲青霉遺傳學(xué)研究推向縱深,為抗真菌新藥研發(fā)、臨床精準(zhǔn)防控注入創(chuàng)新活力,填補(bǔ)真菌致病機(jī)制與防治策略空白,守護(hù)易感人群健康福祉。

五、結(jié)論


本研究通過系統(tǒng)性優(yōu)化電穿孔技術(shù)涉及的緩沖液配方、電穿孔參數(shù)以及感受態(tài)細(xì)胞制備與轉(zhuǎn)化后篩選流程,成功構(gòu)建高效、穩(wěn)定的馬爾尼菲青霉轉(zhuǎn)化體系。該體系顯著提升轉(zhuǎn)化效率、保障轉(zhuǎn)化子遺傳穩(wěn)定性,為馬爾尼菲青霉基礎(chǔ)遺傳學(xué)及相關(guān)醫(yī)學(xué)應(yīng)用研究提供了可靠技術(shù)支撐,在拓展對(duì)馬爾尼菲青霉生物學(xué)認(rèn)知邊界、攻克臨床感染難題征程中邁出關(guān)鍵一步,隨著后續(xù)應(yīng)用拓展與完善,有望重塑馬爾尼菲青霉研究格局,助力真菌病防治革新。


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