關(guān)于WB實(shí)驗(yàn)中的marker,你應(yīng)該知道的事
1、什么是蛋白marker?
蛋白Marker,也稱為蛋白質(zhì)分子量標(biāo)準(zhǔn)(Protein Molecular Weight Marker),是用于蛋白質(zhì)電泳分析中的一系列已知分子量的蛋白質(zhì)混合物。它們通常包含多個(gè)不同分子量的蛋白質(zhì)條帶,這些條帶在電泳過(guò)程中會(huì)根據(jù)分子量的大小和電荷差異遷移不同的距離,從而在凝膠上形成一系列有序的條帶。
2、Marker在WB中的作用?
分子量標(biāo)定:Marker包含一系列已知分子量的蛋白質(zhì),通過(guò)與Marker上的帶狀蛋白質(zhì)帶進(jìn)行比較,可以精確地確定待測(cè)蛋白的分子量;
驗(yàn)證電泳和轉(zhuǎn)印效果:Marker在電泳和轉(zhuǎn)印的過(guò)程中移動(dòng)到膜上,可以幫助研究者驗(yàn)證這些步驟的效果。通過(guò)檢查Marker的帶狀分布,可以確保電泳和轉(zhuǎn)印過(guò)程中沒(méi)有發(fā)生異常;
確定蛋白質(zhì)遷移距離:通過(guò)測(cè)量Marker的遷移距離,可以估算待測(cè)蛋白質(zhì)的遷移距離。這對(duì)于進(jìn)一步的數(shù)據(jù)分析和結(jié)果解釋非常重要;
標(biāo)定凝膠濃度:Marker還可以用于幫助研究者選擇適當(dāng)?shù)哪z濃度。不同分子量的Marker在不同的凝膠濃度下會(huì)產(chǎn)生不同的遷移模式,因此可以根據(jù)Marker的遷移特性選擇合適的凝膠濃度。
3、Marker有哪些分類,各有什么特點(diǎn)?
● 天然蛋白Marker:
這類Marker是從自然來(lái)源提取的蛋白質(zhì),它們經(jīng)歷了天然的修飾過(guò)程,如裂解、二硫鍵形成、糖基化或磷酸化,并保持其復(fù)雜的3D結(jié)構(gòu)。天然蛋白Marker更接近其在體內(nèi)的自然狀態(tài),這使得它們?cè)谒幬镩_發(fā)和生物醫(yī)學(xué)研究中非常有用。天然蛋白Marker可以提供更準(zhǔn)確的分子量估計(jì),因?yàn)樗鼈兾唇?jīng)過(guò)重組或合成,保持了蛋白質(zhì)的自然特性。abs9919非變性蛋白Marker (66-669kDa),經(jīng)過(guò)非變性電泳后,用考馬斯亮藍(lán)染色后可以得到分布均勻、密度相近的4條帶,不適用于SDS-Page,因?yàn)樵赟DS存在下,含有多個(gè)亞單位的蛋白會(huì)不同程度解聚。
abs9919非變性蛋白Marker(66-669kDa)
● 變性Marker:
這類Marker在生產(chǎn)過(guò)程中經(jīng)過(guò)了變性處理,通常是通過(guò)加熱和化學(xué)物質(zhì)(如SDS)的處理,以確保蛋白質(zhì)wan全展開成線性結(jié)構(gòu)。變性Marker的優(yōu)點(diǎn)在于它們提供了一致的蛋白質(zhì)遷移特性,這對(duì)于精確的分子量估計(jì)和實(shí)驗(yàn)重復(fù)性非常重要。由于變性處理,這類Marker的蛋白質(zhì)保持一致的電荷和形狀,使得它們?cè)陔娪具^(guò)程中的遷移更加可預(yù)測(cè)。
變性蛋白Marker一般可分為預(yù)染和非預(yù)染兩種
● 未預(yù)染蛋白Marker:
這類Marker包括寬分子量、高分子量和低分子量蛋白標(biāo)準(zhǔn)。它們是較簡(jiǎn)單、較準(zhǔn)確的一種,因?yàn)椴桓綆玖戏肿踊驑?biāo)記分子,所以所示大小正好是蛋白原本的大小。缺點(diǎn)是在電泳過(guò)程中不可見,需要在電泳結(jié)束后經(jīng)過(guò)染色才能看到,無(wú)法實(shí)時(shí)監(jiān)控電泳過(guò)程。適合精確判斷蛋白大小,但操作相對(duì)麻煩,需要額外的染色步驟。如abs9840非預(yù)染蛋白Marker (14.4-97.4kDa),用考馬斯亮藍(lán)R-250染色可得分布均勻密度相同的六個(gè)條帶,產(chǎn)品含SDS, 不適合用于非變性膠。
abs9840非預(yù)染蛋白Marker(14.4-97.4kDa)
● 預(yù)染蛋白Marker:
這類Marker在生產(chǎn)時(shí)就結(jié)合了染料,因此在電泳過(guò)程中或轉(zhuǎn)膜時(shí)可以直接觀察到不同顏色的條帶。預(yù)染蛋白Marker方便實(shí)驗(yàn)人員在電泳時(shí)、電泳后,以及轉(zhuǎn)膜后監(jiān)測(cè)電泳情況和估計(jì)遷移率。又分為單色預(yù)染和多色預(yù)染。單色預(yù)染Marker通常會(huì)利用其中某些條帶加倍濃度來(lái)提示其大小,而多色預(yù)染Marker用不同的顏色來(lái)區(qū)別,更易于辨認(rèn) 。需要注意的是,預(yù)染蛋白Marker與染料共價(jià)耦聯(lián),所以在不同的緩沖條件下電泳時(shí)遷移特性可能會(huì)發(fā)生某些變化,可能導(dǎo)致一些偏差,因此不太適合精確定位蛋白。
abs923預(yù)染蛋白Marker(10-245kDa)
● 預(yù)染發(fā)光Western Marker:
傳統(tǒng)的Western Blot試驗(yàn)需要使用預(yù)染蛋白Marker來(lái)跟蹤檢測(cè)陽(yáng)性抗原信號(hào)和轉(zhuǎn)膜效率,但預(yù)染蛋白Marker無(wú)法在膠片上曝光,曝光信號(hào)需要根據(jù)膜上的預(yù)染蛋白Marker來(lái)判斷。absin新品abs90004 預(yù)染發(fā)光Western Marker由9種發(fā)光蛋白和9種預(yù)染蛋白組成;9中發(fā)光蛋白分別為23、30、36、44、50、62、90、120和160KDa,這些蛋白均可與抗體結(jié)合,因此能與抗原在同一張膜上曝出信號(hào),陽(yáng)性信號(hào)可以直接通過(guò)Western Marker的位置來(lái)判斷;9種預(yù)染蛋白分別為15、25、35、40、55、70、100、130和180KDa,其中70KDa為紅色,其他為藍(lán)色,轉(zhuǎn)膜完畢后在膜上肉眼可見。
1)可與抗原同時(shí)檢測(cè)信號(hào),使Western blot結(jié)果判斷更加簡(jiǎn)便;
2)發(fā)光marker沒(méi)有偶聯(lián)和標(biāo)記其他分子,分子量更加準(zhǔn)確;
3)綜合發(fā)光marker和預(yù)染marker的優(yōu)勢(shì),既能監(jiān)測(cè)轉(zhuǎn)膜又能與抗原同時(shí)檢測(cè)。
HRP標(biāo)記的Goat anti mouse IgG二抗(一抗:mouse anti P38)ECL化學(xué)發(fā)光檢測(cè)
多重?zé)晒鈾z測(cè)
按照分子量又可以將marker分為高分子量、低分子量、寬分子量等。高分子量蛋白Marker是指那些用于檢測(cè)大分子量蛋白質(zhì)的標(biāo)記,通常包含的蛋白質(zhì)分子量范圍較高,它們提供的分子量范圍通常從幾十kDa到幾百kDa不等。低分子量蛋白Marker是指用于檢測(cè)小分子量蛋白質(zhì)的標(biāo)記,通常包含的蛋白質(zhì)分子量范圍較低,從幾kDa到幾十kDa的分子量范圍。寬分子量蛋白Marker是指覆蓋寬廣分子量范圍的標(biāo)記,通常包含從低到高多個(gè)分子量的蛋白質(zhì)。
4、如何選擇marker?需要考慮什么因素?
首先看實(shí)驗(yàn)類型,非變性蛋白需要非變性蛋白marker,變性蛋白則需要變性marker,兩者不可以相互替換,然后看目的蛋白大小,選擇相應(yīng)的marker,在可選條件下,寬分子量蛋白marker,是不錯(cuò)的選擇,另外看實(shí)驗(yàn)要求,如果需要在電泳和轉(zhuǎn)印過(guò)程中檢測(cè),需要選擇預(yù)染marker,如果需要精確的條帶分子量大小,則需要非預(yù)染marker做參考,可以同時(shí)使用預(yù)染marker和非預(yù)染marker,除了以上因素,還需要考慮marker的使用體系,absin常見marker信息如下:
類型 | 非變性蛋白marker | 非預(yù)染蛋白 Marker | 藍(lán)色預(yù)染蛋白 Marker | 多色預(yù)染蛋白Marker | 預(yù)染發(fā)光Western Marker | |||
貨號(hào) | abs9919 | abs9840 | abs9511 | abs9859 | abs922 | abs923 | abs924 | abs90004 |
分離量范圍 | 66-669kDa | 14.4-97.4kDa | 3.3-31kDa | 14.4-97.4kDa | 10-180kDa | 10-245kDa(Tris-glycine-SDS) | 10-180kDa | 發(fā)光蛋白:23-160kDa 預(yù)染蛋白:15-180kDa |
條帶數(shù)量 | 4 | 6 | 5 | 6 | 10(10和17可能因?yàn)槟z濃度原因跑不開) | 12 | 10(10和17可能因?yàn)槟z濃度原因跑不開) | 9 |
條帶分子量 | 66、238、440、669 | 14.4、22、31、43、66.2、97.4 | 3.3、6.5、14.4、20.1、31 | 14.4、20.1、31、43、66.2、97.4 | 10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180 | 11、17、20、25、35、48、63、75、100、135、180、135、180、245(Tris-glycine-SDS) | 10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180 | 發(fā)光蛋白: 23、30、36、44、50、62、90、120 、 160 預(yù)染蛋白: 15、25、35、40、55、70、100、130 、 180 |
顏色 | 單色 | 單色 | 藍(lán)色 | 藍(lán)色 | 75紅色,25k綠色,其余藍(lán)色 | 25綠色,75橙紅色,其余藍(lán)色 | 72橙色,10綠色,其余藍(lán)色,10k條帶在15%以下膠濃度時(shí)深綠色 | 預(yù)染蛋白70KDa為紅色,其他為藍(lán)色, |
推薦凝膠體系 | 非變性電泳 | 變性電泳 | Tricine SDS-PAGE | Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍(lán)色和綠色條帶表觀分子量無(wú)變化,橙色條帶和進(jìn)口一致 | Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍(lán)色和綠色條帶表觀分子量無(wú)變化,橙色條帶和進(jìn)口一致 | Tris-Glycine | Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍(lán)色和綠色條帶表觀分子量無(wú)變化,橙色條帶和進(jìn)口一致 | Tris-Glycine,Bis-Tris等 |
處理 | 需要考馬斯亮藍(lán)染色,不能加熱 | 需要考馬斯亮藍(lán)染色及上樣前沸水浴 | 無(wú)需染色,勿加熱 | 無(wú)需染色、無(wú)需加熱 | 無(wú)需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理 | 無(wú)需染色、無(wú)需加熱 | 無(wú)需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理 | 無(wú)需染色、直接使用,不要煮沸 |
非變性蛋白電泳好物推薦
貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
abs9116 | 免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液 | 100mL |
abs9360 | Tris-Glycine電泳緩沖液(10×) | 500mL |
abs9618 | Glass gel預(yù)制膠 Tris-Gly 15%, 10wells, 1.5mm | 10片/盒 |
abs9954 | 非變性非還原性蛋白上樣緩沖液(5×) | 1mL×5 |
abs9919 | 非變性蛋白 Marker(66-669kDa) | 200uL |
abs964 | 考馬斯亮藍(lán)染色試劑盒(常規(guī)型) | 1kit |
WB好物推薦
| 貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 |
樣本處理 | abs9346 | 細(xì)胞漿、細(xì)胞核及細(xì)胞膜蛋白抽提試劑盒 | 50T |
abs9116 | 免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液 | 100mL | |
abs9162 | 廣譜型磷酸酶抑制劑混合物(100×儲(chǔ)液) | 1mL | |
abs9161 | 廣譜型蛋白酶抑制劑混合物(不含EDTA,100×DMSO儲(chǔ)液) | 1mL | |
蛋白定量 | abs9232 | BCA蛋白定量試劑盒 | 500T |
膠 | 配膠試劑盒,各類預(yù)制膠(參考前面表格) | ||
上樣與電泳 | abs953 | 上樣緩沖液(2×) | 10mL |
abs951 | 電泳液(10×) | 100mL | |
abs923 | 預(yù)染蛋白Marker(10-245kDa) | 500uL | |
轉(zhuǎn)膜 | abs932 | PVDF膜(0.45μm) | 20張 |
abs960 | NC膜(0.45μm) | 20張 | |
abs950 | 電轉(zhuǎn)液(10×) | 100mL | |
封閉 | abs9175 | 脫脂奶粉 | 500g |
abs9157 | 牛血清白蛋白 | 100g | |
抗體稀釋與去除 | abs954 | WB專用一抗二抗稀釋液 | 100mL |
abs967 | Western一抗二抗去除液(強(qiáng)堿性) | 500mL | |
顯色與檢測(cè) | abs920 | ECL化學(xué)發(fā)光檢測(cè)試劑盒 | 25mL×2 |
Absin產(chǎn)品線:
爆款產(chǎn)品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測(cè)、殘留檢測(cè)、多因子檢測(cè));細(xì)胞培養(yǎng)(類器官試劑盒+基質(zhì)膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細(xì)胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務(wù)+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測(cè))...
特色產(chǎn)品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...
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