DMSO主要用于高GC含量的模板擴(kuò)增,可能的機(jī)理是改善GC含量高的DNA的變形情況,降低其二級結(jié)構(gòu),使得聚合酶在二級結(jié)構(gòu)處延伸。
DMSO可以提高PCR的特異性,幫助擴(kuò)增一些難擴(kuò)的模板。
當(dāng)體系中加入DMSO時,可適當(dāng)降低退火溫度。
在實(shí)踐中,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)可能因各種原因而失敗,通常表現(xiàn)為兩個問題,一是目的模板的擴(kuò)增量太少,二是非目的基因擴(kuò)增太多。
這種情況研究人員通常會在反應(yīng)體系中加入合適的添加劑進(jìn)行解決。
通常添加劑的作用主要是降低基因的二級結(jié)構(gòu)或者降低非特異性的啟動。
下面是幾種常用的添加劑以及它們的作用:
① 二甲基亞砜DMSO、非離子性洗滌劑、甜菜堿——可以降低DNA二級結(jié)構(gòu)
② 甲酰胺、四甲基氯化銨TMAC——降低非特異性啟動
③ 鎂離子——聚合一個輔因子
④ 牛血清白蛋白——減少污染物
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