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在選擇色譜柱之前，先多了解自己的樣品和雜質(zhì)，他們的類型結構、極性、酸堿性、分子量大小等等，
1.樣品是極性的且弱酸性的；就可以選擇C18在100%酸性水溶液條件下檢測，即要選擇承受100%純水且對極性化合物保留很好的色譜柱
2.如果樣品極性太強，或酸性太強；可以選擇CN，NH2，或硅膠柱，HILIC（親水色譜），也有使用C18+強陰離子對試劑或強陰離子交換色譜柱（缺點是離子對試劑平衡時間長，對流動相pH要求比較精密，否則很難重復實驗，另外離子對試劑很難洗下來，基本上用了離子對的色譜柱就不能再用于其它實驗）
3.若樣品是堿性的；可選擇高純硅膠柱（高純硅膠缺少金屬雜質(zhì)，且硅膠端基封尾）或一些經(jīng)過修飾的C18柱（如極性嵌入技術或堿去活技術等），他們都會減少堿性化合物的拖尾，一般會選擇中性或偏堿的條件下做，因為這樣可增加堿性樣品的保留
4.如果堿性化合物的極性太強，或堿性太強；可以選擇寬pH的C18色譜柱在高pH值檢測（優(yōu)點是方法開發(fā)簡單，缺點是目前實現(xiàn)這一技術的色譜柱品牌比較少，價格也高）或者選用HILIC色譜柱（硅膠柱在反相條件下使用，這也是很經(jīng)典的檢測堿性樣品的方法）選擇強離子交換柱（缺點是不能用來分析其它樣品，對流動相pH要求比較精密，否則很難重復實驗）也有使用C18+強陰離子對試劑或強陰離子交換色譜柱。
影響因素
A:物理因素1.硅膠純度----·填料硅膠的純度與殘留金屬離子濃度
2.色譜柱尺寸---填料床的長度和內(nèi)徑
3.顆粒形狀------球型或不規(guī)則型
4.粒徑------------平均顆粒直徑,通常3-10µm
5.表面積---------顆粒外表面和內(nèi)部孔表面的總和,以m2/gram表示
6.孔徑------------顆粒的孔或腔的平均尺寸,范圍80-300Å
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