邊緣效應(yīng)(Edge Effect)是指在利用96孔(或更多)培養(yǎng)板進行細胞培養(yǎng)時,處在周邊及四個角孔中的細胞通常會表現(xiàn)出異常的現(xiàn)象。
產(chǎn)生邊緣效應(yīng)的原因
1. 溫度:聚苯乙烯本身為不良熱導(dǎo)體,將板從室溫(25℃左右)置于37℃的溫箱,隨著孔板升溫,在外周孔與中心孔之間可能存在熱力學(xué)梯度。
2. 蒸發(fā):在培養(yǎng)箱經(jīng)常開關(guān)的情況下,由于位置效應(yīng),邊緣孔的濕度較中間孔更低,水分揮發(fā)的現(xiàn)象就更為嚴(yán)重。容易造成四周培養(yǎng)基的體積會明顯少于中間孔,而四個角落則更甚。對于長時間周期的研究來說,這是一個不容忽視的問題——隨著培養(yǎng)基的蒸發(fā),孔內(nèi)的培養(yǎng)基成分和藥物濃度將增加,這可能導(dǎo)致孔內(nèi)沉淀的出現(xiàn)??着c孔之間的營養(yǎng)物濃度、pH值也會影響基因和蛋白質(zhì)的表達,以及最終的細胞生長發(fā)生變化。隨之而來的Western、PCR/qPCR、ELISA和其他應(yīng)用也就越不一致。
不推薦的應(yīng)對辦法
1. 留空:許多研究人員會通過避免使用邊緣孔來提高數(shù)據(jù)可重復(fù)性,比如使用96孔板,外圍的36個孔將被棄用(板的37.5%被浪費)。因此,實驗組須分布在多塊培養(yǎng)板上以達到足夠的通量,增加了工作量和成本,同時也降低了實驗中培養(yǎng)板布局的靈活性。
2. 填充:PBS溶液、水或培養(yǎng)基填充外孔將有助于板的水合,限制蒸發(fā),但這可能會成為細菌的滋生地。
3. 平鋪:當(dāng)堆疊起來的時候,處于頂部和底部的孔板將比中間的更快達到37℃,造成溫度梯度。但大多數(shù)培養(yǎng)箱被不止一個研究人員使用且空間有限,如果其他人選擇堆放,仍然會阻礙空氣流向你的樣品,影響溫度。
防止邊緣效應(yīng)的建議
1. 盡量縮短試驗周期,從而減少液體在孔中儲存的時間,減少蒸發(fā)。
2. 使用低蒸發(fā)蓋帶冷凝環(huán)的蓋子。
3. 使用透明或鋁箔密封膠帶進行生化測定,或使用透氣的無菌膠帶進行細胞測定。
相關(guān)產(chǎn)品
免責(zé)聲明
- 凡本網(wǎng)注明“來源:化工儀器網(wǎng)”的所有作品,均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品,未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載、摘編或利用其它方式使用上述作品。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的,應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,并注明“來源:化工儀器網(wǎng)”。違反上述聲明者,本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責(zé)任。
- 本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源(非化工儀器網(wǎng))的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點和對其真實性負(fù)責(zé),不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任。其他媒體、網(wǎng)站或個人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時,必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
- 如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問題,請在作品發(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系,否則視為放棄相關(guān)權(quán)利。