Q3又有新應(yīng)用!您只需放好細(xì)胞,剩下的交給Incucyte…
Incucyte® 實(shí)時(shí)活細(xì)胞分析系統(tǒng)是一款革命性的細(xì)胞成像設(shè)備,可以實(shí)現(xiàn)在培養(yǎng)箱內(nèi)無(wú)限時(shí)間的連續(xù)觀察。用戶友好的實(shí)驗(yàn)設(shè)置和分析,以及精準(zhǔn)的各種細(xì)胞指標(biāo)計(jì)算,使得許多用戶對(duì)它青睞有加。
Incucyte® 在細(xì)胞水平的體外實(shí)驗(yàn)中有著廣泛應(yīng)用。話不多說(shuō),讓我們用文章數(shù)量發(fā)話!
去除預(yù)印版,在2023年第三季度,陳老師收集到了國(guó)內(nèi)近30個(gè)不同單位發(fā)表的40余篇文章,匯總?cè)缦拢ㄎ墨I(xiàn)列表在文末哦)。
表1. 2023 Q3 Incucyte® 發(fā)表文章第一作者單位分布
從文章的發(fā)表單位來(lái)看,許多單位發(fā)表了多篇文章,如:中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院、復(fù)旦大學(xué)醫(yī)學(xué)院、四川大學(xué)華西醫(yī)院、北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院等。利用Incucyte®,可以高效地獲取實(shí)時(shí)細(xì)胞信息,快速得到可信的研究成果。值得一提的是,中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院僅在一個(gè)季度,就發(fā)了7篇文章!這足以說(shuō)明Incucyte® 因其簡(jiǎn)單易用、可在短時(shí)間內(nèi)生成多個(gè)精確數(shù)據(jù)的優(yōu)點(diǎn),已然成為發(fā)表高分文章的利器!
表2. 2023 Q3 Incucyte® 發(fā)表文章應(yīng)用分布
Incucyte® 的應(yīng)用范圍非常廣泛。從第三季度發(fā)表的文章上來(lái)看,除了傳統(tǒng)的細(xì)胞增殖活性和劃痕遷移實(shí)驗(yàn)外,還包括血管生成等多種應(yīng)用。與上半年相比,使用Incucyte® 發(fā)表的文章數(shù)量呈現(xiàn)有穩(wěn)步增長(zhǎng)的趨勢(shì)。
今天,陳老濕就挑選幾篇帶有新應(yīng)用
國(guó)內(nèi)文章進(jìn)行介紹:
復(fù)旦大學(xué) 劃痕實(shí)驗(yàn)基因篩選[1]
表觀遺傳調(diào)節(jié)因子(ERF)的失調(diào)在腫瘤的進(jìn)展中起著重要作用。為了確定哪種ERF有助于抑制結(jié)直腸癌(CRC)中的腫瘤細(xì)胞增殖或遷移,研究人員使用siRNA敲低了HT29細(xì)胞中的591種ERF基因,然后使用Incucyte® 高通量實(shí)時(shí)活細(xì)胞成像系統(tǒng)進(jìn)行傷口愈合測(cè)定,以檢查腫瘤細(xì)胞的遷移能力。在這些ERF中,針對(duì)AF9的四個(gè)獨(dú)立的siRNA敲低AF9表達(dá)顯著促進(jìn)了傷口愈合的能力。鋅指轉(zhuǎn)錄因子蛋白(SNAIL)被用作該篩選系統(tǒng)中的陽(yáng)性對(duì)照。AF9在CRC中表現(xiàn)出下調(diào),并與CRC患者的生存期延長(zhǎng)呈正相關(guān)。體外和體內(nèi)測(cè)定證明,AF9的消耗可以促進(jìn)細(xì)胞增殖、遷移以及糖酵解。腸上皮細(xì)胞中MLLT3(AF9)的敲除顯著增加了嘧啶甲烷-葡聚糖硫酸鈉(AOM / DSS)誘導(dǎo)的腫瘤形成。
圖1. 左圖:樣品板排布,一種基因使用四種siRNA進(jìn)行敲低,然后用Incucyte® 進(jìn)行劃痕實(shí)驗(yàn),實(shí)時(shí)觀察48小時(shí);右圖為火山圖,可以明顯看出敲低MLLT3(AF9)能夠促進(jìn)細(xì)胞遷移(SNAIL為陽(yáng)性對(duì)照)
圖2.左圖展示了Incucyte® 劃痕實(shí)驗(yàn)照片;右圖為劃痕寬度統(tǒng)計(jì),從中我們可以發(fā)現(xiàn),AF9能增強(qiáng)細(xì)胞遷移
591個(gè)基因,每個(gè)基因4種siRNA,還有復(fù)孔!一塊96孔板檢測(cè)6個(gè)基因,一共需要100塊96孔板,使用Incucyte® 一次性可以掃描6塊板并提供劃痕工具,還能迅速對(duì)劃痕平均距離等進(jìn)行計(jì)算,這大大提高可劃痕測(cè)試通量。
華僑大學(xué) 病毒侵染測(cè)定[2]
重組腺相關(guān)病毒(rAAV)是基因治療體內(nèi)遞送中具有吸引力的載體,但其對(duì)細(xì)胞和組織的特異性限制了其在臨床上的應(yīng)用。表皮生長(zhǎng)因子受體-蛋白酪氨酸激酶(EGFR-PTK)能夠負(fù)調(diào)節(jié)rAAV轉(zhuǎn)導(dǎo),使得EGFR陽(yáng)性細(xì)胞幾乎不允許rAAV轉(zhuǎn)導(dǎo)。本研究構(gòu)建了一種新型的rAAV-miRNA133b載體,該載體共表達(dá)miRNA133b(可敲低EGFR表達(dá))和轉(zhuǎn)基因,并研究了其在體內(nèi)和體外的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率。通過(guò)使用Incucyte® 活細(xì)胞成像等方法,分析了miRNA133b對(duì)rAAV2轉(zhuǎn)導(dǎo)的影響及其機(jī)制。結(jié)果表明,miRNA133b可促進(jìn)rAAV2轉(zhuǎn)導(dǎo),且影響僅限于EGFR陽(yáng)性細(xì)胞。而ss-rAAV2-Fluc-miRNA133b展現(xiàn)出了抗腫瘤作用。rAAV-miRNA133b載體可能成為一種有前景的平臺(tái),用于遞送各種轉(zhuǎn)基因以治療EGFR陽(yáng)性細(xì)胞相關(guān)疾?。ㄈ绶切〖?xì)胞肺癌等)。
圖3. 上圖:通過(guò)Incucyte® 實(shí)時(shí)成像計(jì)算熒光GFP強(qiáng)度,以此來(lái)評(píng)估AAV的轉(zhuǎn)染能力;下圖為綠色熒光圖像;從圖中可以看出,單獨(dú)添加miRNA133b后,AAV的轉(zhuǎn)染能力顯著增強(qiáng)
圖4. 整合miRNA133b的AAV載體的轉(zhuǎn)染能力顯著增強(qiáng)
相比于流式方法,Incucyte® 無(wú)需進(jìn)行消化細(xì)胞等預(yù)處理步驟;而與其他成像設(shè)備相比,它的操作簡(jiǎn)單易用,并且能夠進(jìn)行AI輔助分析。
中國(guó)科學(xué)院國(guó)家生物信息中心 血管生成[3]
由于衰老的復(fù)雜性,我們的實(shí)際生物年齡并不總是與實(shí)際年齡一致,因此開(kāi)發(fā)能準(zhǔn)確評(píng)估衰老的工具顯得尤為重要。中國(guó)科學(xué)院國(guó)家生物信息中心劉光慧團(tuán)隊(duì)建立了一個(gè)女性衰老時(shí)鐘,該時(shí)鐘包括了與免疫、脂質(zhì)代謝、激素調(diào)節(jié)和組織健康相關(guān)的多組學(xué)水平的年齡相關(guān)特征。他們將30多歲到50多歲確定為女性老齡化的過(guò)渡期,認(rèn)為這是監(jiān)測(cè)衰老的重要時(shí)期。研究人員還發(fā)現(xiàn),激素替代療法可以部分延緩幾個(gè)衰老時(shí)鐘的步伐,并緩解多種與衰老相關(guān)的標(biāo)志物。在這項(xiàng)研究中,Incucyte® 主要用于檢測(cè)一些物質(zhì)對(duì)主動(dòng)脈內(nèi)皮細(xì)胞(Human Aortic Endothelial Cells)的血管生成能力。
圖5. Incucyte® 的血管生成實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn):一些非激素類物質(zhì)(肉豆蔻酸等)能增強(qiáng)血管生成能力
Incucyte® 有專門的血管生成分析模塊哦!
中山大學(xué)癌癥中心 細(xì)胞共培養(yǎng)競(jìng)爭(zhēng)模型測(cè)定[4]
在細(xì)胞轉(zhuǎn)染后,建立轉(zhuǎn)染細(xì)胞與未轉(zhuǎn)染細(xì)胞的競(jìng)爭(zhēng)生長(zhǎng)模型對(duì)于衡量轉(zhuǎn)染細(xì)胞的生長(zhǎng)增殖能力至關(guān)重要。這篇文章中引入了一種新的方法,稱為競(jìng)爭(zhēng)性增殖測(cè)量(ComProliM),以準(zhǔn)確量化細(xì)胞生長(zhǎng)速率。該方法涉及共培養(yǎng)兩種不同類型的細(xì)胞,并定義了一個(gè)關(guān)鍵參數(shù),即 ComProliM 指數(shù) (CPMI)。CPMI 是兩種細(xì)胞數(shù)量比例對(duì)數(shù)和兩種細(xì)胞數(shù)量總數(shù)對(duì)數(shù)進(jìn)行線性回歸的斜率。利用Incucyte® 設(shè)備,我們可以輕松實(shí)現(xiàn)這種檢測(cè)。每隔4個(gè)小時(shí),我們測(cè)定兩種貼壁細(xì)胞(分別帶有紅色和綠色熒光)的數(shù)量(熒光面積),以同時(shí)判定兩種細(xì)胞的增殖。然后,我們使用每個(gè)時(shí)間點(diǎn)的兩種細(xì)胞數(shù)的比值的對(duì)數(shù)和兩種細(xì)胞總量進(jìn)行線性回歸,從而計(jì)算CPMI。
圖6. 實(shí)時(shí)活細(xì)胞成像計(jì)算CPMI的示意圖
圖7. 使用Incucyte® 測(cè)定三種共培養(yǎng)體系,其中B14為親本和耐藥的非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞,初始接種初始比2:3(不加藥),J14為1:9(不加藥),D-14為2:3(加藥物);圖A展示了實(shí)時(shí)生長(zhǎng)曲線,圖B為線性回歸獲得CPMI,圖C為CPMI對(duì)比;由此可見(jiàn),加入藥物后,CPMI值明顯升高,說(shuō)明耐藥株生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì)明顯
文中提到,相比于MTT、流式等終點(diǎn)法,Incucyte® 的方法具有通量高、操作簡(jiǎn)單、可以在短時(shí)間內(nèi)獲得大量數(shù)據(jù)的優(yōu)點(diǎn)。
為什么Incucyte® 如此受歡迎呢?
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培養(yǎng)箱內(nèi)無(wú)限時(shí)間的連續(xù)觀察,最短幾分鐘間隔拍攝,減少人力,防止過(guò)多操作對(duì)細(xì)胞的傷害
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6個(gè)板位,分別獨(dú)立設(shè)置檢測(cè)程序,可以兼容各種孔板和培養(yǎng)皿,通量高;比如第一篇和第四篇文章就用到了Incucyte® 的高通量?jī)?yōu)勢(shì)
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高效簡(jiǎn)便的模塊化軟件設(shè)置和數(shù)據(jù)分析,輸出圖片、視頻、生長(zhǎng)曲線等多指標(biāo)多參數(shù)
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> 100種優(yōu)化過(guò)的配套熒光試劑和耗材及詳盡的protocol
總而言之,您只管放好細(xì)胞,剩下的就交給Incucyte® 吧!
-參考文獻(xiàn)-
[1] AF9 sustains glycolysis in colorectal cancer via H3K9ac-mediated PCK2 and FBP1 transcription.https://doi.org/10.1002/ctm2.1352
[2] MiR133b-mediated inhibition of EGFR-PTK pathway promotes rAAV2 transduction by facilitating intracellular trafficking and augmenting second-strand synthesis. https://doi.org/10.1111/jcmm.17858
[3] Determining a multimodal aging clock in a cohort of Chinese women.Med 2023
[4] ComProliM: A cell growth assay robust to initial cell number in co-culture system. Heliyon 9 (2023) e19433
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