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預染蛋白marker常見問題及解決方法

來源:上海雅吉生物科技有限公司   2023年02月08日 09:06  

Q1:我使用了你們的一種預染蛋白質標準品進行轉印,發(fā)現(xiàn)在轉印過程中條帶在膜上褪色了。為什么會這樣?

A1褪色最可能是由于封閉/洗滌液中的洗滌劑將一些蛋白質從膜上洗脫造成的。染料本身不會從蛋白質上洗脫,因為它們是共價結合的。我們已經發(fā)現(xiàn)較小孔徑的膜可以在封閉和洗滌過程中更好地保留蛋白質,因此,為了獲得的分辨率和蛋白質保留率,推薦使用0.2 µm代替0.45 µm的膜。轉印后,可以用鉛筆在膜上圈出預染條帶,從而在封閉和處理后仍可辨認條帶位置。
Q2:我的蛋白質標準中的幾個條帶在凝膠上缺失。你們能幫我排查問題嗎?
A2:
  1. *查使用的凝膠類型/凝膠百分比??赡軙捎谀z類型和/或百分比的不同而不能看到所有條帶。例如,蛋白質標準品的最小條帶可能不能在非常低百分比的凝膠上分辨,而較高分子量條帶可能不能在高百分比凝膠上分辨。

  2. *檢查蛋白質分子量標準品的有效日期。由于蛋白質降解,過期批次可能導致條帶褪色或缺失。

  3. *檢查蛋白質分子量標準品的儲存條件。不適當的儲存條件會損害標準品中蛋白質的穩(wěn)定性。

  4. *確保蛋白質分子量標準品在上樣到凝膠上之前未加熱/煮沸。我們的蛋白質分子量標準品可直接上樣,我們不建議將其加熱/煮沸,因為這可能會導致標準品中的蛋白質降解。

Q3:我使用了你們的一種蛋白質標準品,并在泳道中看到了一些額外的條帶。可以提供一些建議嗎?
A3:
  • *上樣時,請注意確保相鄰樣品泳道沒有交叉污染。

  • *確保每個泳道上標準品的量都是正確的。蛋白質上樣過多會導致產生額外的條帶,這個問題在使用銀染凝膠時尤為突出。

  • *標準品儲存不當或反復凍融會導致蛋白質降解。

Q4:我使用了你們的一種蛋白質標準品進行轉印,發(fā)現(xiàn)一些小分子蛋白質條帶穿過了膜。我該如何解決這個問題?
A4:
  • *降低電壓、電流或縮短轉印時間

  • *確保轉膜緩沖液的甲醇濃度合適;可使用濃度為10–20%的甲醇,從而去除SDS-蛋白質復合物中的SDS,并促進蛋白質與膜的結合。

  • *確保轉膜緩沖液的SDS濃度合適(若加入了SDS),SDS濃度不要超過0.02–0.04%。過多的SDS會阻礙蛋白質與膜的結合。

  • *檢查膜的孔徑和靶標蛋白質的大小。小于10kDa的蛋白質很容易穿過0.45μm孔徑的膜。如果您的目標蛋白質小于10 kDa,那么最好使用0.2μm孔徑的膜。

Q5:我在Tris-甘氨酸凝膠上使用了一種預染標準品,發(fā)現(xiàn)蛋白質的分子量與在NuPAGE Bis-Tris凝膠上的分子量不同。這是什么原因?
A5:預染標準品具有與每種蛋白質共價結合的染料,這將導致標準品在不同的緩沖系統(tǒng)(即不同的凝膠)中遷移率不同。因此,使用預染標準品進行分子量估算將僅得出蛋白質的表觀分子量。預染標準品可用于分子量估算、確認凝膠遷移和估算轉膜效率,但對于需要精確估算分子量的應用,應使用非預染標準品。
Q6:我使用了你們的一種蛋白質標準品進行轉印,發(fā)現(xiàn)一些高分子蛋白質條帶轉印到膜上的效果很差??梢蕴峁┮恍┨崾締??
A6:
  • *增加電壓、電流或轉印時間

  • *凝膠和SDS-蛋白質復合物中的SDS會促進蛋白質從凝膠中洗脫,但抑制蛋白質與膜的結合。這種抑制作用在硝化纖維素膜上的強度大于PVDF膜。對于難以從凝膠中洗脫的蛋白質,如大分子量蛋白質,可在轉膜緩沖液中加入少量SDS以改善轉印效果。我們建議在組裝三明治前將凝膠置于含0.02–0.04% SDS的2x轉膜緩沖液(無甲醇)中預平衡10分鐘,然后使用含10%甲醇和0.01% SDS的1X轉膜緩沖液進行轉印。

  • *甲醇可去除SDS-蛋白質復合物中的SDS,促進蛋白質與膜的結合,但對凝膠本身有一些不良影響,會降低轉印效率。甲醇可能導致孔徑減小、某些蛋白質發(fā)生沉淀以及一些堿性蛋白質帶正電荷或變?yōu)橹行?。應確保轉膜緩沖液的甲醇濃度不高于10–20%,并使用高質量的分析級甲醇。

Q7:我使用了你們的一種蛋白質分子量標準品,它的條帶看起來不太明顯,很模糊。我該怎么操作?
A7:
  • *確保每個泳道上標準品的量都是正確的。蛋白質上樣過多會導致模糊,這個問題在使用銀染凝膠時尤為突出。

  • *條帶在低百分比凝膠中不能很好地分辨。嘗試使用更高百分比的凝膠。

  • *如果在轉膜/檢測后條帶看起來不明顯和模糊,可能是由于抗體濃度過高。遵循制造商建議的稀釋度或通過斑點印跡確定最適抗體濃度。

Q8:我使用了你們的一種預染蛋白質分子量標準品進行轉印,但是膜上的轉印效果較差??赡艹隽耸裁磫栴}?
A8:
  • *凝膠上的分子量標準品的量不足: 將適當體積的分子量標準品上樣到凝膠上。以下是我們的建議:(小型凝膠:每孔5μL(厚度0.75-1.0 mm)或每孔10μL(厚度1.5 mm);•大凝膠:每孔10μL(厚度0.75-1.0 mm)或每孔20μL(厚度1.5 mm))

  • *轉印不全或不理想: 優(yōu)化轉印條件

Q9:我使用了你們的一種預染蛋白質分子量標準品,這些條帶沒有很好地分離??赡苁鞘裁丛蛟斐傻??
A9:
  • *樣品被煮沸: 丟棄煮沸的分裝樣品。

  • *使用的分子量標準品體積過大: 加入較少的體積或使用前用蛋白質上樣緩沖液稀釋分子量標準品。


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