北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院梁軍教授團隊通過 CRISPR 篩選,得到了一種驅(qū)動 HCC 細胞對治療藥物產(chǎn)生耐藥機制的方法。并通過這種方法發(fā)現(xiàn) PSTK(磷酸絲氨酰-tRNA激酶)是一種重要的 RNA 依賴性激酶,也是 HCC 細胞對靶向治療產(chǎn)生抗性的關(guān)鍵介導(dǎo)因子,可通過抑制鐵死亡誘導(dǎo)起作用。
鐵死亡是一種鐵依賴性的,區(qū)別于細胞凋亡、細胞壞死、細胞自噬的新型的細胞程序性死亡方式。其的本質(zhì)是谷胱甘肽的耗竭、谷胱甘肽過氧化物酶(GPX4)活性下降、脂質(zhì)氧化物不能通過 GPX4 催化的谷胱甘肽還原酶反應(yīng)代謝,之后二價的鐵離子氧化脂質(zhì)產(chǎn)生活性氧,從而促使鐵死亡的發(fā)生。
因癌細胞比正常細胞利用更高水平的鐵以促進其更具侵襲性的生長,且對鐵誘導(dǎo)劑更敏感,因此,鐵誘導(dǎo)物有望治療腫瘤耐藥,特別是在 HCC 中。
CRISPR 篩選結(jié)果
PSTK 抑制鐵死亡誘導(dǎo)
谷胱甘肽過氧化物酶 4 (GPX4) 是鐵中毒的中心調(diào)節(jié)因子,可減輕鐵中毒過程的毒性。PSTK 是參與硒代半胱氨酸生物合成的關(guān)鍵激酶,而硒代半胱氨酸是 GPX 蛋白的活性中心 ,因此 PSTK 的調(diào)控可以使 HCC 對靶向治療誘導(dǎo)的鐵離子中毒產(chǎn)生抗性。
肝癌患者 PSTK 過度表達與 Gpx4 表達相關(guān)
例如,在使用 Abemaciclib、Sorafenib 或 Erastin 進行靶向治療時,會導(dǎo)致 HCC 細胞中產(chǎn)生明顯的鐵離子信號 (圖AC),且 PSTK-KO HCC 細胞會顯示較低的 GPXs 和 GPX4 基線活性 (圖D)、PSTK-KO Hep3B 細胞會表現(xiàn)出較高的 ROS 基線水平,并且這些水平在靶向治療后會進一步放大 (圖E),但是 PSTK 可通過維持 GPX4 的活性來抑制鐵離子的誘導(dǎo)。
PSTK 維持 GPX4 的活性以防止鐵離子誘導(dǎo)
同時,作者通過 RNA-seq 分析,以及對差異表達基因進行 KEGG 富集分析 (圖A) 發(fā)現(xiàn),敲除 PSTK 后,磷酸化鐵蛋白相關(guān)基因表達有明顯差異 (圖B) ,嗜鐵基因組呈負富集 (圖C),與鐵卟啉相關(guān)的關(guān)鍵保護因子下調(diào) (圖D) 。
綜合代謝組學(xué)和 RNA-seq 分析將 PSTK 鑒定為鐵死亡抗性的介質(zhì)
細胞內(nèi)氧化磷脂水平顯著增加, GSH(谷胱甘肽)轉(zhuǎn)化為 GSSG(氧化型谷胱甘肽) 。
代謝物水平變化
GSH 合成過程中的關(guān)鍵成分,γ-谷氨酰半胱氨酸、半胱氨酸甘氨酸和半胱氨酸水平顯著降低,胱氨酸和谷氨酸水平不會明顯變化。此外,與葉酸生物合成相關(guān)的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物水平降低,包括葉酸和 5-甲基四氫葉酸。
GSH 合成成分水平變化
由此可見,GSH 的耗竭和一些直接、間接的靶向機制,都可以導(dǎo)致 GPX4 失活,而且除抑制體系 System Xc-外,直接抑制 GSH 的合成也可誘導(dǎo)鐵細胞凋亡。因此可通過調(diào)控 PSTK 維持 GPX4 的活性和 GSH 的合成來保護 HCC 細胞免受鐵細胞死亡的誘導(dǎo)。
PSTK 抑制劑
作者利用 TargetMol 的化合物庫進行了基于結(jié)構(gòu)的虛擬篩選以識別 PSTK 抑制劑。top 10 的化合物對接得分如圖所示。通過結(jié)合模式分析,選取了 4 個具有代表性的化合物,其中兩種可水解的單寧 (Punicalin 和 Geraniin) 對 PSTK 活性袋的結(jié)合親和力最高。
虛擬篩選后top 10 的化合物
這兩種單寧直接用于治療 HCC 細胞時,會使得 HCC 細胞對索拉非尼更加敏感,且腫瘤細胞中 GPX4 蛋白水平會顯著降低。
CCK-8 試驗表明,Geraniin 和 Punicalin 具有顯著的抗 HCC 活性
PSTK 和 GPX4 蛋白水平顯著降低
同時,在一項動物研究中發(fā)現(xiàn) Punicalin/ geraniin 與 Sorafenib 一起口服后,Punicalin 與 Sorafenib 協(xié)同作用能夠顯著抑制腫瘤生長。
動物實驗中腫瘤體積隨時間變化
因此,使用 Punicalin 阻斷 PSTK 激酶活性可能是克服肝癌中索拉非尼耐藥的一種有效手段。 綜上所述,作者的研究確定了 PSTK 是肝癌細胞鐵死亡抵抗的關(guān)鍵介質(zhì)。從機制上講,PSTK 的耗竭與硒代半胱氨酸依賴的 Gpx4 激活、谷胱甘肽代謝和葉酸合成的抑制有關(guān),并可導(dǎo)致亞致死性鐵死亡的誘導(dǎo),從而使肝癌細胞對能夠誘導(dǎo)鐵死亡的靶向治療更加敏感。因此,抑制 PSTK 可能是克服肝癌患者靶向治療耐藥性的一種新穎可行的方法,該蛋白的抑制劑值得進一步的臨床研究。 陶術(shù)可提供多種 PSTK 抑制劑相關(guān)的化合物和化合物庫以及虛擬篩選服務(wù),助力領(lǐng)域相關(guān)研究。
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References
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