GST Pull down實驗技術(shù)
1. 實驗原理
Pull down技術(shù)是將"誘餌"蛋白與一種易于純化的配體標(biāo)簽(如:GST標(biāo)簽、His標(biāo)簽)進(jìn)行融合表達(dá),而帶標(biāo)簽的誘餌蛋白能被特異結(jié)合該標(biāo)簽的固相親和配基捕獲,形成"次級親和支持物",用于純化與誘餌蛋白相互作用的其他蛋白。純化產(chǎn)物洗脫后,經(jīng)Western blot驗證或LC-MS/MS,即鑒定與誘餌蛋白互作的蛋白。1988年Smith等利用谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶(GST)融合標(biāo)簽從細(xì)菌中一步純化出GST融合蛋白。從此,GST融合蛋白在蛋白質(zhì)相互作用研究領(lǐng)域里得到了極大的推廣。GST融合蛋白在經(jīng)過固定有谷胱甘肽(GSH)的色譜柱時,就可以通過GST與GSH的相互作用而被吸附。當(dāng)再有細(xì)胞抽提物過柱,就可以得到能夠與“誘餌”蛋白相互作用的興趣蛋白。GST pull down是一種體外驗證或篩選互作蛋白的技術(shù)。
2. 實驗流程
構(gòu)建帶標(biāo)簽的誘餌蛋白原核表達(dá)載體(帶GST標(biāo)簽或His或);
載體轉(zhuǎn)化大腸桿菌,表達(dá)誘餌蛋白(關(guān)鍵步驟,很多蛋白原核表達(dá)時會形成包涵體,極大地影響后續(xù)實驗。我們采用自誘導(dǎo)培養(yǎng)基培養(yǎng)細(xì)菌,能有效降低包涵體的形成);
細(xì)菌裂解液過柱子,帶標(biāo)簽的誘餌蛋白被特異結(jié)合標(biāo)簽的固相化親和配基捕獲,產(chǎn)生"次級親和支持物”;
待測樣品裂解液過柱子孵育,與誘餌蛋白互作的蛋白被“次級親和支持物”吸附;
清洗,離心,去除未結(jié)合的雜蛋白;
洗脫,得到誘餌蛋白及其互作蛋白的復(fù)合物;
如要驗證某個蛋白X與誘餌蛋白互作,則將6.所得的蛋白復(fù)合物與X蛋白的抗體孵育,做Western blot驗證;
如要尋找誘餌蛋白可能的互作蛋白,則將6.所得的蛋白復(fù)合物進(jìn)行LC-MS/MS鑒定。
3. 技術(shù)服務(wù)
原核表達(dá)載體構(gòu)建;
融合蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)和純化;
pull down捕獲互作蛋白;
Western blot驗證(兩種目標(biāo)蛋白互作/兩種蛋白互作的結(jié)構(gòu)域);
LC-MS/MS鑒定可能的互作蛋白。
4. 交付結(jié)果
客觀公正的實驗原始數(shù)據(jù)和分析結(jié)果;
提供詳細(xì)、完整的實驗報告。
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