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Genetic Signatures成立于2001年，由Geoffrey Grigg博士（原澳大利亞聯(lián)邦科學與工業(yè)研究組織（CSIRO）分子生物學部主任）創(chuàng)立。甲基化分析中使用廣泛的方法是亞硫酸氫鹽法，由Grigg博士在英國劍橋設想，并被減少到CSIRO實驗室的實踐中[1]。初的方法隨后得到改進，這些改進導致了遺傳簽名MethylEasy™DNA亞硫酸氫鈉修飾產品系列的開發(fā)和發(fā)布。
由于改進的轉化方法和用于胞嘧啶甲基化檢測的應用，發(fā)現(xiàn)了一個有趣的發(fā)現(xiàn)：通過亞硫酸氫鈉處理微生物DNA能夠將四種核酸堿基還原成僅三個堿基，通過將胞嘧啶轉化為胸腺嘧啶。該技術被稱為3base ™，是我們的EasyScreen ™病原體檢測試劑盒的基石。
此后，遺傳標志開發(fā)并商業(yè)化了一套基于EasyScreen ™實時PCR的產品，用于常規(guī)檢測傳染病。EasyScreen ™產品為醫(yī)院和病理實驗室提供了分子工具，可在快速高通量的環(huán)境中篩查各種傳染性病原體。
腸道病原篩選試劑盒
胃腸疾病可能由各種各樣的感染因素引起，包括病毒，細菌和原生動物。因此，傳染性胃腸疾病的診斷可能具有挑戰(zhàn)性，并且涉及微生物學，病毒學和寄生蟲學方面的專家。
據估計，澳大利亞每年有1680萬胃腸炎病例，導致醫(yī)院急診科就診25萬人，住院15,000人，死亡80人[1]。
為了簡化感染性胃腸道疾病病原體的檢測，我們開發(fā)了 EasyScreen™ 實時PCR篩選檢測方法，用于所有主要胃腸炎病原體。所有的分析方法都采用通用樣品處理方法，并采用我們之前描述的 3base™ 技術 [2]。
傳統(tǒng)的胃腸炎診斷在某些情況下可能需要長達5天[3]才能提供明確的結果。為了減少這種情況，我們的實驗提供了樣品，可以在3小時內完成結果周轉時間。
遺傳特征 EasyScreen ™腸道病原體檢測試劑盒具有以下優(yōu)點：
- 集成的自動化樣品處理方法
提供從臨床樣品到可報告結果的完整工作流程。通過這種方式，結果也從實驗室到實驗室標準化。 - 快速檢測
從樣本到結果3-5小時，與傳統(tǒng)方法相比，少的手工操作時間 - 內置控制
由于提取失敗和抑制控制可降低錯誤結果的可能性，因此對結果具有高度的置信度 - 實時PCR格式
無PCR后處理，幾乎消除了污染的可能性 - 全面涵蓋常見病原體
同時檢測到一種標本制劑導致的22種引起胃腸炎的病原體 - 開放式平臺
兼容大多數(shù)病理實驗室常見的自動化樣品制備系統(tǒng)和實時PCR儀器
該 EasyScreen™ 腸道病原體檢測試劑盒包括：
| 產品＃ | EasyScreen™套件 | 檢測到微生物 |
|---|---|---|
| EB001和EB001-HT | 腸道細菌檢測 | （i）沙門氏菌屬 （ii）彎曲桿菌屬（Campylobacter spp。） （iii）痢疾桿菌/腸內侵襲性大腸桿菌（EIEC） （iv）小腸結腸炎耶爾森氏菌。 （v）產毒的艱難梭菌和 （vi）單核細胞增生李斯特菌 |
| EP001和EP001-HT | 腸道原生動物檢測 | （i）隱孢子蟲屬， （ii）腸道賈第蟲， （iii）脆弱東部阿米巴， （iv）溶組織內阿米巴，和 （v）人芽囊原蟲（Blastocystis hominis） |
| EV002和EV002-HT | 腸道病毒檢測 | （i）諾如病毒GI （ii）諾如病毒GII （iii）星狀病毒 （iv）輪狀病毒A （v ）沙波病毒 （vi）腸病毒 （vii）博卡 病毒（viii）腺病毒和 （ix）腺病毒（僅40 + 41） |
| CDD001 | 艱難梭菌檢測 | 致病性艱難梭菌（針對tcdA和tcdB） |
| CDD002 | 艱難梭菌反射 | 超致病性艱難梭菌包括 （i）位置117處的tcdC基因缺失， （ii）二元毒素基因（cdtA）和 （iii）gyrA基因突變（氟喹諾酮耐藥性）的核糖體027和078 ， |
對于HT（384孔格式）試劑盒，所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs。
所有 EasyScreen™ 腸道病原體檢測試劑盒可用于使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒制備的核酸 。
有關EasyScreen™ 工作流程以及與核酸提取和實時PCR平臺的兼容性的更多信息， 請訪問我們的EasyScreen™ 工作流程頁面。
監(jiān)管
[1]來源：澳大利亞政府衛(wèi)生與老齡部，“澳大利亞食源性疾病的年成本”，2006年3月
[2] Baleriola C，Millar D，Melki J，Coulston N，Altman P，Rismanto N和Rawlinson W.2008。新型HPV測試與Hybrid Capture II（hcII）和參考PCR方法的比較顯示高特異性和陽性對13例高危人乳頭瘤病毒感染的預測價值。J. Clin。病毒學雜志。42：22-6 2008
[3] Cunningham SA，Sloan LM，Nyre LM，Vetter EA，Mandrekar J和Pa R. 2010.三小時分子檢測糞便中彎曲桿菌，沙門氏菌，耶爾森氏菌和志賀菌的準確性與培養(yǎng)物一樣高。J. Clin。微。48：2929-33
英文信息如下：
| Product | EasyScreen™ Kit | Microorganisms Detected |
|---|---|---|
| EB001 & EB001-HT | Enteric Bacteria Detection | (i) Salmonella spp. (ii) Campylobacter spp. (iii) Shigella spp. /Enteroinvasive E.coli (EIEC) (iv) Yersinia enterocolitica. (v) toxigenic C. difficile and (vi) Listeria monocytogenes |
| EP001 & EP001-HT | Enteric Protozoan Detection | (i) Cryptosporidium spp. (ii) Giardia intestinalis (iii) Dientamoeba fragilis (iv) Entamoeba histolytica and (v) Blastocystis hominis |
| EV002 & EV002-HT | Enteric Viral Detection | (i) Norovirus GI (ii) Norovirus GII (iii) Astrovirus (iv) Rotavirus A (v) Sapovirus (vi) Enterovirus (vii) Bocavirus (viii) Adenovirus and (ix) Adenovirus (40 + 41 only) |
| CDD001 | C. difficile Detection | Toxigenic C. difficile (targets both tcdA and tcdB) |
| CDD002 | C. difficile Reflex | Hypervirulent C. difficile incl. ribotype 027 & 078 targeting: (i) tcdC gene deletion at position 117, (ii) binary toxin gene (cdtA) and (iii) gyrA gene mutation (fluoroquinolone resistance) |
對于HT（384孔格式）試劑盒，所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs
所有 EasyScreen™ 病原體檢測試劑盒都可用于使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒準備的 樣品。
有關EasyScreen™ 工作流程以及與核酸提取和實時PCR平臺的兼容性的更多信息， 請訪問我們的 EasyScreen™ 工作流程頁面。
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