多年來(lái)，自身免疫疾病和炎癥疾病的研究已經(jīng)鑒定出了數(shù)百個(gè)與這些病癥相關(guān)的遺傳區(qū)域。同時(shí)，表達(dá)數(shù)量性狀基因座（eQTLs）的相關(guān)研究也揭示了正常人群中基因表達(dá)水平遺傳變異的豐度。目前科學(xué)家們大多認(rèn)為大多數(shù)疾病相關(guān)基因座是通過(guò)基因表達(dá)中的調(diào)節(jié)性變化影響疾病風(fēng)險(xiǎn)，但這種假說(shuō)并未得到驗(yàn)證，尤其是大多數(shù)影響疾病風(fēng)險(xiǎn)的遺傳基因座是否也可以被eQTL檢測(cè)到。

為了驗(yàn)證這一假說(shuō)，研究人員分析大約270個(gè)與七種疾病相關(guān)的遺傳基因座，嘗試在關(guān)鍵免疫細(xì)胞中利用eQTL將它們映射致病基因上。

在高等生物中，許多重要生理性狀及復(fù)雜疾病都是數(shù)量性狀，如農(nóng)作物的產(chǎn)量和人類的高血壓、糖尿病等，這些復(fù)雜性狀受到多個(gè)基因和環(huán)境因素的控制。為了有效地研究多基因控制的復(fù)雜性狀，數(shù)量性狀基因座（QTL）分析技術(shù)在20世紀(jì)90年代應(yīng)運(yùn)而生，有效地將控制數(shù)量性狀的眾多主效基因定位在相應(yīng)的染色體上。

在這篇文章中，研究人員分析了大約270個(gè)與七種疾病相關(guān)的遺傳基因座，其中55個(gè)候選基因關(guān)聯(lián)與未受刺激的免疫細(xì)胞中的基線基因表達(dá)的變化具有強(qiáng)統(tǒng)計(jì)學(xué)一致性，但是這只是其中的少部分基因座，大約為25％。而余下的研究人員沒(méi)有觀察到eQTL數(shù)據(jù)中與自身免疫性疾病相關(guān)性一致的任何信號(hào)，盡管事實(shí)上與其它疾病相比，更容易從血液樣品獲得疾病相關(guān)的細(xì)胞群體。

如果只是基于與疾病的相關(guān)性來(lái)推斷觀察到的eQTL的病理相關(guān)性，那么就必須十分謹(jǐn)慎。因此在進(jìn)行耗時(shí)又昂貴的實(shí)驗(yàn)性解析之前，需要先獲得共有遺傳效應(yīng)的有力證據(jù)。

此前，在美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院基因型-組織表達(dá)（GTEx）項(xiàng)目的資金資助下，美國(guó)研究人員曾構(gòu)建出了一個(gè)新數(shù)據(jù)資源，可以幫助確立個(gè)體基因組構(gòu)成之間的差異對(duì)于基因活性的影響以及對(duì)疾病的貢獻(xiàn)。

甚至在多個(gè)組織中活化之時(shí)，同一變異有時(shí)在不同的組織中也可以產(chǎn)生不同的影響。例如，GTEx研究人員發(fā)現(xiàn)有一個(gè)變異影響了兩個(gè)與血液相關(guān)的基因的活性，雖然在其他組織中有著更高的總體基因活性，它對(duì)脛動(dòng)脈中血壓相關(guān)的基因表達(dá)造成了更強(qiáng)的影響。牛津大學(xué)的Manuel Rivas博士和同事們利用 GTEx數(shù)據(jù)和來(lái)自一個(gè)大型歐洲項(xiàng)目的信息，研究了600多人的基因讀值。研究小組發(fā)現(xiàn)一些PTVs是通過(guò)降解基因轉(zhuǎn)錄物或是破壞剪接過(guò)程來(lái)影響了蛋白質(zhì)生成。研究人員利用GTEx數(shù)據(jù)在兩種情況下檢測(cè)了一些個(gè)體和組織類型中的這些效應(yīng)。研究小組現(xiàn)正在開(kāi)發(fā)更好的方法來(lái)預(yù)測(cè)患者中發(fā)現(xiàn)的一些PTVs的影響。