6月25日,在太平洋彼岸,由Nature主辦珀金埃爾默協(xié)辦的網(wǎng)絡(luò)直播中,多倫多大學的David Andrews博士[1] 和來自悉尼大學的Elizabeth New博士[2] 結(jié)合珀金埃爾默解決方案,向我們展示單細胞水平分析推動下的前沿癌癥研究。大家可以在微信文末獲得完整視頻的鏈接,同時我們特意做了視頻的漢化,并提供雙語字幕,讓大家的學習更加輕松有效。
高內(nèi)涵應用的臨床轉(zhuǎn)化
David Andrews博士關(guān)注高內(nèi)涵應用的臨床轉(zhuǎn)化,致力于利用病人來源的腫瘤細胞(Patient-derived cell,PDC)模型實現(xiàn)腫瘤治療的醫(yī)療。在該研究中,Opera Phenix 高內(nèi)涵平臺在20X物鏡配置下(臨床轉(zhuǎn)化考量),主導基于1536孔板的高通量細胞表型篩選。
基于體外模型進行藥效預測的一大挑戰(zhàn)就是在支持高通量篩選的同時,如何保證樣本的病理生理相關(guān)性。針對血液瘤樣本,David Andrews利用小分子化合物模擬體內(nèi)微環(huán)境,在不過度改變細胞命運的情況下對PDC進行一定的重編程。并在此基礎(chǔ)上,David Andrews通過多種染料分析了常見的細胞活力指標,包括細胞核形態(tài)、線粒體膜電位和凋亡等。
在單細胞解析中,David Andrews向我們強調(diào)了樣本的復雜性,需要利用機器自學習的優(yōu)勢來深度挖掘藥物處理后的表型變化。利用對照藥物,研究通過多指標分析定義多種表型,并以此為基礎(chǔ)進行臨床抗腫瘤藥物的藥效預測。通過分析藥物處理后的PDC細胞表型,不僅能預測針對特定病人的藥物治療有效性,還能挖掘藥物對應的細胞表型,做到了細胞表型-藥物相互作用的深度分析。
后的答疑環(huán)節(jié)也非常精彩,涉及到流式細胞技術(shù)、免疫治療、外泌體、臨床轉(zhuǎn)化和機器自學習等多個熱門方向。在答疑的過程中,David Andrews也強調(diào)了Opera Phenix 高內(nèi)涵平臺的Pre-scan和水鏡等優(yōu)勢,是能靈活用于從科研研究到臨床應用開發(fā)的檢測平臺。
單細胞ICP-MS應用優(yōu)勢
Elizabeth New博士則從金屬藥物和納米材料分析角度出發(fā),展示了單細胞水平分析在腫瘤藥物研究中的應用前景?,F(xiàn)階段,鉑類等金屬藥物已經(jīng)成為化療治療中的一線用藥,并且是多種聯(lián)合用藥的基礎(chǔ)。要了解金屬藥物和細胞之間的相互作用,我們離不開分析細胞對金屬的攝取和積累,探究藥物和蛋白&DNA之間的相互作用,以及藥物處理對整個細胞穩(wěn)態(tài)的影響。傳統(tǒng)的分析技術(shù)主要基于大量細胞的裂解液得出均一化的結(jié)果,因此受到金屬藥物代謝多樣性和腫瘤細胞異質(zhì)性的挑戰(zhàn)。
針對金屬藥物代謝多樣性的難題,Elizabeth New利用熒光探針特異識別具有活性的鉑類藥物代謝中間體,并結(jié)合成像技術(shù)分析腫瘤細胞對藥物的攝取情況。類似地,基于流式技術(shù)的分析方法也可以從單細胞水平分析細胞的的氧化還原狀態(tài)。
*,醫(yī)學需要解決的一大難題就是腫瘤異質(zhì)性分析。結(jié)合了電感耦合等離子體(ICP)的高溫電離特性的質(zhì)譜技術(shù)(ICP-MS)雖然極為靈敏,但無法從單細胞水平解析腫瘤細胞的異質(zhì)性。因此,單細胞ICP-MS分析技術(shù)因運而生。在擁有質(zhì)譜靈敏度的同時,珀金埃爾默的單細胞ICP-MS解決方案僅需少量的細胞,就可完成多種細胞的胞內(nèi)金屬離子的特異檢測。這次報告中,Elizabeth New從金屬含量和納米顆粒分析兩個方向展示了單細胞ICP-MS的應用優(yōu)勢。
基于單細胞ICP-MS分析的結(jié)果,我們可以看到隨著時間的推移,腫瘤細胞逐漸積累金屬藥物。同時對比順鉑敏感的腫瘤細胞株,耐受細胞株明顯攝取更少的金屬藥物。進一步的實驗證明,血清饑餓導致的細胞周期變化不會影響細胞對藥物的攝取。針對納米金的研究,ICP-MS可直接用于分析懸液樣本中的顆粒大小和均一性等理化性質(zhì),而單細胞ICP-MS則能從單細胞水平發(fā)現(xiàn)腫瘤細胞對納米金顆粒攝取的異質(zhì)性。
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參考文獻
1.https://sunnybrook.ca/research/team/member.asp?m=514&page=172
2.https://sydney.edu.au/science/people/elizabeth.new.php
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