小分子藥物研發(fā)中,篩選能有效結(jié)合目標(biāo)蛋白的分子是非常耗時(shí)耗(財(cái))力的一個(gè)環(huán)節(jié),但又是必須進(jìn)行的工作。高失敗率源于結(jié)合情況的錯(cuò)綜復(fù)雜,體外生化實(shí)驗(yàn)的結(jié)合效果,往往不能很好的在細(xì)胞水平進(jìn)行重現(xiàn)。這其中可能是因?yàn)榉肿釉诖┰郊?xì)胞膜時(shí),出現(xiàn)了被修飾;也可能是因?yàn)榧兓鞍缀驼鎸?shí)細(xì)胞環(huán)境的蛋白構(gòu)象不同。例如,在生化水平顯示很好結(jié)合效果的分子,在細(xì)胞水平可能結(jié)合的是另一個(gè)蛋白。是不是很崩潰……
試想,如果有一個(gè)高通量解決方案讓你可以直接在細(xì)胞水平進(jìn)行小分子結(jié)合相應(yīng)靶向蛋白的驗(yàn)證,開(kāi)不開(kāi)心,意不意外?
這個(gè)方案就是Alpha®-CETSA®!
什么是CETSA®?
CETSA®是細(xì)胞熱遷移實(shí)驗(yàn)(Cellular Thermal Shift Assay)的簡(jiǎn)稱(chēng),是PELAGO公司2012年在歐洲注冊(cè)的技術(shù)。該技術(shù)基于的原理是:每種蛋白質(zhì)都有自身的熱熔曲線(如下圖)。隨著溫度的升高,蛋白質(zhì)會(huì)發(fā)生降解(藍(lán)色曲線);當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)結(jié)合小分子以后,該復(fù)合蛋白的熱熔曲線會(huì)右移(紅色虛線),即相同溫度下,未降解蛋白的量會(huì)提高。CETSA®實(shí)驗(yàn)的樣品來(lái)源十分靈活,可以是細(xì)胞,也可以是活體給藥以后的組織樣本。
傳統(tǒng)的CETSA®對(duì)于天然構(gòu)象蛋白的檢測(cè)模式主要有Western-Blot和MS方法,這兩種方法都無(wú)法實(shí)現(xiàn)高通量的篩選。2019年7月,PELAGO公司正式和PerkinElmer公司達(dá)成戰(zhàn)略合作協(xié)議,推出高通量,高靈敏度的CETSA®HT檢測(cè)方案,即Alpha®-CETSA®
Alpha®-CETSA®的操作
1.樣品和化合物進(jìn)行孵育。
2.進(jìn)行熱休克操作(建議在PCR儀上進(jìn)行該操作)。
3.加入合適的裂解液。
4.加入Alpha® CETSA®檢測(cè)試劑。
5.在具有Alpha®功能的酶標(biāo)儀上檢測(cè)。
新酶標(biāo)儀加載Alpha®功能
PerkinElmer公司的Victor NIVO新款酶標(biāo)儀加載了Alpha®功能,這是目前可以開(kāi)展Alpha®CETSA®檢測(cè)細(xì)胞水平蛋白-分子相互作用的小的儀器。
目前,PerkinElmer和PELAGO一起推出的蛋白靶點(diǎn)試劑盒有Akt1,BCL-2,EGFR,MEK1和p38 MAKP,工具微珠2套,方便客戶(hù)靈活使用這項(xiàng)技術(shù)。更多的商品化試劑盒也會(huì)陸續(xù)推出。
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