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應該如何避免在PCR實驗中管子變型?
閱讀:9582 發(fā)布時間:2017-3-17共計923字 | 建議閱讀時間 6 分鐘
首先,倒置管子變性的罪魁禍首是PCR儀的熱蓋,熱蓋的作用是為了防止PCR反應過程中反應液的蒸發(fā),水汽在管蓋上凝結。
早期的PCR儀沒有熱蓋,PCR加熱過程中反應液蒸發(fā)形成水汽在管蓋上凝結,導致PCR反應體系隨著循環(huán)的進行不斷減少,影響PCR反應的正常進行。為了防止PCR反應液的蒸發(fā),會在配置好的PCR反應液中加入石蠟油或礦物油。但是反應結束以后,石蠟油不好清除趕干凈,對接下來的步驟有所影響。
后來出現了帶熱蓋的PCR儀,熱蓋的作用并不是防止蒸發(fā),而是防止蒸發(fā)的水汽在管上凝結。因為管蓋頂部有熱源加熱使管體內的蒸汽形成循環(huán),所以反應液蒸發(fā)后的水汽不會在管蓋上凝結。
市面上大家目前接觸比較多的是可調式熱蓋,即熱蓋的高度可以手動調節(jié),適用于各種PCR管,如高管和矮管。但是高度調節(jié)的壓力是通過使用者來感覺的。
沒壓嚴實,導致熱蓋未發(fā)揮功能,反應體系減少,壓得過頭了,壓力導致管體型變。
后來有了力矩式可調熱蓋
即熱蓋旋轉到一定力矩后內置機構打滑,從而既保證了熱蓋壓力,又防止了過度導致的變型。
但是還是需要注意的是,這類熱蓋使用結束后需要擰松熱蓋,否則下一個用戶如果直接下壓熱蓋,可能造成PCR管變型。
很多使用者會忘記松熱蓋。所以日常操作中不論是操作配置什么熱蓋的儀器,我們要養(yǎng)成習慣,除了使用后擰松熱蓋再取樣本,同時在使用PCR儀器前習慣性地擰松熱蓋,預防上一位操作者未松熱蓋。
實際工作中,按照了以上良好的習慣去操作,為何還會出現管子變型的問題???
答 案
使用孔太少,壓力不均導致的。以96孔為例,實驗中,如果使用了16個以上的模塊孔(具體的操作因人而異,同時也和放置的位置有關),實驗的管子不會變型。
如果只用幾個模塊孔,反應的幾個樣本管,而且放在模塊中央或者中央偏一點的位置,就很容易發(fā)生管子變型的情況。解決這一問題的辦法其實也很好辦。
如果這一批實驗需要用到的模塊孔很少,只有幾個,那可以在模塊孔zui邊緣的四個角分別放4個空管(加不加水隨意,目的只是為了平衡熱蓋下壓的壓力)。這樣就可以解決擴增少量樣本出現的管子變型的情況。
以上是對PCR實驗中經常遇到的管子融化、變型問題的探討,希望對您有幫助。