一、PEG是什么?
PEG,聚乙二醇是一種高分子聚合物,無刺激性,味微苦,具有良好的水溶性,并與許多有機物組分有良好的相溶性。具有優(yōu)良的潤滑性、保濕性、分散性、粘接性,可作為抗靜電劑及柔軟劑等使用,在化妝品、制藥、化纖、橡膠、塑料、造紙、油漆、電鍍、農(nóng)藥、金屬加工及食品加工等行業(yè)中均有極為廣泛的應用。其分子式為HO(CH2CH2O)nH,其中n代表聚合度,決定了PEG的分子量。PEG具有良好的水溶性、無毒性、生物相容性和化學穩(wěn)定性,這些特性使得PEG在生物醫(yī)學領(lǐng)域得到了廣泛應用。
二、PEG在核酸提取中的作用機制
1、促進核酸凝聚
PEG在核酸提取中的主要作用之一是促進核酸的凝聚。在高鹽濃度(如NaCl)存在下,PEG能夠與核酸分子相互作用,使核酸從水化的線狀構(gòu)象轉(zhuǎn)變?yōu)榫o湊的球狀構(gòu)象。這種構(gòu)象轉(zhuǎn)變暴露出核酸分子表面的負電荷磷酸基團,增加了核酸分子之間的靜電相互作用,從而促進核酸的凝聚和沉淀。
2、增強核酸與固相載體的結(jié)合
在核酸提取過程中,常常使用磁珠、硅膠等固相載體來吸附和純化核酸。PEG的加入能夠增強核酸分子與固相載體之間的結(jié)合力。具體來說,PEG能夠通過與核酸分子表面的負電荷磷酸基團和固相載體表面的正電荷基團(如氨基)形成離子橋,從而牢固地將核酸分子吸附在固相載體上。
3、減少非特異性吸附
在核酸提取過程中,除了目標核酸分子外,還常常存在許多非特異性成分(如蛋白質(zhì)、多糖等)。這些非特異性成分可能會與固相載體結(jié)合,影響核酸的純化效果。PEG的加入能夠在一定程度上減少這些非特異性成分與固相載體的結(jié)合,提高核酸提取的純度。
4、沉淀雜質(zhì)
PEG還能夠在核酸提取過程中沉淀一些雜質(zhì)成分,如細胞碎片、蛋白質(zhì)等。這些雜質(zhì)成分如果存在于核酸提取物中,會對后續(xù)的分子生物學實驗產(chǎn)生干擾。PEG通過形成高分子凝膠狀物質(zhì),將雜質(zhì)成分包裹并沉淀下來,從而凈化核酸提取物。
三、PEG在核酸提取中的具體應用
1、基于磁珠的核酸提取
在基于磁珠的核酸提取方法中,PEG常作為重要的輔助試劑。具體步驟包括:首先,將待提取的樣本(如血液、組織等)裂解,釋放出核酸分子;然后,加入PEG和高鹽溶液,使核酸分子凝聚并暴露出負電荷磷酸基團;接著,加入帶有正電荷基團的磁珠,通過離子橋作用將核酸分子吸附在磁珠上;最后,通過磁場作用將磁珠與溶液分離,洗滌磁珠以去除雜質(zhì)成分,最后洗脫磁珠上的核酸分子。
2、無醇清洗液中的應用
在一些無醇清洗液中,PEG也作為重要的成分之一。這些清洗液主要用于去除核酸提取過程中的乙醇殘留和其他雜質(zhì)成分。PEG通過沉淀作用將雜質(zhì)成分去除,同時避免了乙醇殘留對下游實驗的影響。這種無醇清洗液在xinguan病毒等病原體的核酸提取中得到了廣泛應用。
3、片段化DNA的篩選
在下一代測序(NGS)等高通量測序技術(shù)中,需要從樣本中提取特定大小的DNA片段。PEG可以通過調(diào)節(jié)其濃度和反應條件,實現(xiàn)對不同大小DNA片段的選擇性吸附和純化。具體來說,通過兩輪或多輪吸附過程,可以逐步去除較小或較大的DNA片段,最終得到符合要求的特定大小DNA片段。
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