簡(jiǎn)介
獲得高質(zhì)量和完整的 RNA 是很多分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中最重要的一步,當(dāng)前應(yīng)用最多的是 Trizol/氯仿萃取的方法。
原理
1、4℃ 預(yù)冷離心機(jī);
2、取出培養(yǎng)皿,在超凈臺(tái)中去除培養(yǎng)基,按照每 1x107 細(xì)胞加入 1mL Trizol 試劑,用槍頭吹打充分裂解細(xì)胞;
3、將細(xì)胞裂解液轉(zhuǎn)移到 1.5 mL 無(wú) RNA 酶的 EP 管中,向每個(gè) EP 管中加入(1/5 Trizol 體積的)200 μL 氯仿,上下翻轉(zhuǎn)充分混合后,室溫靜置 10 分鐘,使核酸蛋白復(fù)合物wan全解離;
4、在 4℃ 下 12000 g 離心 15 分鐘;
5、離心后,將上層水相(約 1/2 Trizol體積)小心轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的 EP 管,加入等體積異丙醇,震蕩后室溫靜置 5-10 分鐘,然后 12000 g 4℃ 離心 15 分鐘,棄上清保留沉淀;
6、加入1 mL 75% 乙醇清洗并沉淀 RNA,12000 g 離心 10 分鐘;
7、棄上清,并重復(fù)上述操作一次;
8、棄上清,在超凈工作臺(tái)中打開(kāi) EP 管蓋,風(fēng)干 5-10 分鐘,不需wan全干燥;
9、視沉淀的量,加入 10-30 μL RNase-Free 的 DEPC 雙蒸水中;
10、待沉淀溶解后,用 nanodrop 測(cè)定其濃度和純度并作標(biāo)記,進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn),多余的RNA 保存于 -80℃ 冰箱。
用途
RT-PCR、分子克隆、Northern-Blot、RNA 體外轉(zhuǎn)錄與翻譯等。
材料與儀器
【材料】:細(xì)胞;Trizol 試劑;氯仿;異丙醇;75% 乙醇(使用 RNase-Free 水配制);RNase-Free 水。
【物品及儀器】:1.5 ml EP管(RNA-free),大,中,小號(hào)槍頭(RNA-free),移液器,渦旋振蕩器,高速冷凍離心機(jī),超凈工作臺(tái)。
步驟
1、4℃ 預(yù)冷離心機(jī);
2、取出培養(yǎng)皿,在超凈臺(tái)中去除培養(yǎng)基,按照每 1x107 細(xì)胞加入 1mL Trizol 試劑,用槍頭吹打充分裂解細(xì)胞;
3、將細(xì)胞裂解液轉(zhuǎn)移到 1.5 mL 無(wú) RNA 酶的 EP 管中,向每個(gè) EP 管中加入(1/5 Trizol 體積的)200 μL 氯仿,上下翻轉(zhuǎn)充分混合后,室溫靜置 10 分鐘,使核酸蛋白復(fù)合物wan全解離;
4、在 4℃ 下 12000 g 離心 15 分鐘;
5、離心后,將上層水相(約 1/2 Trizol體積)小心轉(zhuǎn)移到一個(gè)新的 EP 管,加入等體積異丙醇,震蕩后室溫靜置 5-10 分鐘,然后 12000 g 4℃ 離心 15 分鐘,棄上清保留沉淀;
6、加入1 mL 75% 乙醇清洗并沉淀 RNA,12000 g 離心 10 分鐘;
7、棄上清,并重復(fù)上述操作一次;
8、棄上清,在超凈工作臺(tái)中打開(kāi) EP 管蓋,風(fēng)干 5-10 分鐘,不需wan全干燥;
9、視沉淀的量,加入 10-30 μL RNase-Free 的 DEPC 雙蒸水中;
10、待沉淀溶解后,用 nanodrop 測(cè)定其濃度和純度并作標(biāo)記,進(jìn)行下游實(shí)驗(yàn),多余的RNA 保存于 -80℃ 冰箱。
注意事項(xiàng)
1、過(guò)程中需佩戴口罩和新手套,對(duì)臺(tái)面以及周?chē)h(huán)境進(jìn)行滅酶處理,盡量在超凈臺(tái)中進(jìn)行操作;
2、使用無(wú) Rnase 的塑料制品和槍頭,避免交叉污染。
3、溶液配制應(yīng)使用無(wú) Rnase 的水,(將水加入到干凈的玻璃瓶中,加入 DEPC 至終濃度為 0.1%(V/V),放置過(guò)夜,高壓滅菌。注:DEPC 有致癌之嫌,須小心操作)。
4、Trizol 裂解液非常危險(xiǎn),因小心避免濺到身上,臺(tái)面上的 Trizol 要及時(shí)清理干凈。
常見(jiàn)問(wèn)題
RNA 得率過(guò)低:
1.使用更有效的破碎/勻漿方法。如液氮搗碎、酶消化破壁、電動(dòng)勻漿器勻漿;
2.更換抽提試劑;
3.核酸濃度低時(shí),采用低溫沉淀,并延長(zhǎng)沉淀時(shí)間;
4.增加細(xì)胞。
RNA 質(zhì)量不高:
1、取上層水相時(shí)求多,吸到了下層有機(jī)相;
2、清洗不干凈。
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