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從石蠟包埋固定的組織中制備 RNA 實驗

閱讀:578      發(fā)布時間:2023-07-07
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材料與儀器

1. 緩沖液、溶液和試劑
去離子化的甲酰胺;焦碳酸二乙酯(DEPC) 處理過的水;消化緩沖液(lmol/L 異硫氰酸胍,25 mmol/Lβ-巰基乙醇,0.5%N-月桂酰肌氨酸,20 mmol/LTris-HCl,pH7.5);乙醇,100% 70%
;肝糖;異丙醇;苯酚 (pH4.3): 氯仿(70%:30%);蛋白酶 K(60 mg/ml,20U/mg);Trizol(Invitrogen)二甲苯
2. 特殊設備
微量離心管,2 ml, RNA
恒溫箱,預調至 37°C
水浴或恒溫箱,預調至 55°C
3. 細胞和組織

石蠟包埋的組織樣品,切割為 5~50 5um 厚的切片

步驟

1. 將組織塊置于 2.0 ml 微量離心管中,向樣品中加 1.8 ml 二甲苯。37°C 溫育 20 min。
2. 稍微地離心樣品,移棄上清液再加入二甲苯,重復溫育和離心步驟。
3. 0.5 ml 乙酵洗滌組織。移棄乙醇,風干。
4. 80ul 蛋白酶 K(60 mg/ml,20U/mg) 72ul 消化緩沖液。55°C 下振蕩溫育過夜。
5. 再次加 80ul 蛋白酶 K,55°C 下振蕩溫育過夜。次日再次加 80ul 蛋白酶 K, 再次 55°C下振蕩溫育過夜。
6. 加等體積酚:氯仿,混合,在微量離心機中以最大轉速離心 5 min。將液相轉移到RNA 酶的新管中。
7. 加等體積異丙醇和 2ug 肝糖,-20°C 放置 30 min
8. 在微董離心機中以最大轉速離心 30 min。移棄上清液,用 70% 乙酵洗滌沉降物。
9. 在微量離心機中以最大轉速離心 30 min 并移棄上清液。風干沉降物,將之再溶解20ulDEPC 處理過的水中。加 500ulTrizol。遵循 Trizol 方案(見本章方案 3),對一處做修改:在第一次 Trizol 處理后,將液相轉移到無 RNA 酶的新管中,用 500ulTrizol 第二次處理樣品。
10. 向第二次 Trizol 處理過的液相加 500ul 異丙醇以沉淀 RNA
11. RNA 沉降物再溶解于 20ul 去離子甲酰胺中。-20°C 儲存 RNA

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