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SRM2374外部RNA控制的DNA序列庫標準品NIST

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產(chǎn)品型號

品       牌NIST/美國

廠商性質(zhì)經(jīng)銷商

所  在  地東莞市

更新時間:2022-03-29 18:03:20瀏覽次數(shù):455次

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供貨周期 現(xiàn)貨 貨號 SRM2374
應用領域 食品,化工
SRM2374外部RNA控制的DNA序列庫標準品NIST旨在用作使用體外轉(zhuǎn)錄 (IVT) 進行核糖核酸 (RNA) 對照合成的模板。

SRM2374外部RNA控制的DNA序列庫標準品NIST旨在用作使用體外轉(zhuǎn)錄 (IVT) 進行核糖核酸 (RNA) 對照合成的模板。這些 RNA 對照旨在用作外部對照或“加標"對照,通過對基因表達測量的技術(shù)性能進行定量評估來支持基因表達測定的可信度。一個 SRM 單元包含 96 個不同的 0.5 mL 聚丙烯管,其中通過吸光度 (A260) 測量,每個脫水質(zhì)粒脫氧核糖核酸 (DNA) 約為 10 µg。

每個試管都含有質(zhì)粒 DNA,其具有*的模板序列,用于不同的外部 RNA 對照。這些控制是與外部 RNA 控制聯(lián)盟 (ERCC) 合作開發(fā)的。


這些模板可以很容易地用于制作 RNA 控制(參見圖 1)。根據(jù)轉(zhuǎn)錄的鏈,對照將模擬“有義"或“反義"真核信使 RNA (mRNA)。當用于制造有義對照 RNA 時,每個對照在 3' 端將有一個標稱的 24 個核苷酸 (nt) 多聚腺苷酸 (polyA) 片段。由它們產(chǎn)生的 DNA 模板和 RNA 轉(zhuǎn)錄本在圖 2 和圖 3 中進行了注釋和描述。對照序列范圍從 273 nt 到 2022 nt,GC 分數(shù) (1) 有兩種群體分布,一種以 35% GC 為中心,另一種以 47% 為中心。



認證特性:

SRM2374外部RNA控制的DNA序列庫標準品NIST 的認證特性是 ERCC 對照插入片段的 DNA 序列。核苷酸身份使用國際純粹與應用化學聯(lián)合會 (IUPAC) 核苷酸符號進行編碼,包括序列中幾個堿基的歧義代碼。表 2 包括,對于每個組件,對包含國家生物信息中心 (NCBI) GenBank 數(shù)據(jù)庫中認證序列的記錄的引用。經(jīng)認證的序列可從 NIST 以 FASTA 格式的數(shù)據(jù)文件 [1] 獲得,與此證書相關(guān)聯(lián)。


由于被測量是標稱屬性(核苷酸序列)的值,因此不能使用符合 JCGM GUM [2] 的測量不確定度的常規(guī)評估和表達。相反,與每個核苷酸相關(guān)的不確定性以表示對規(guī)定值的信念強度的順序標度表示(0 = 最有信心,1 = 非常有信心,2 = 有信心,3 = 模棱兩可)。與序數(shù)尺度水平相關(guān)的序列數(shù)據(jù)的特征在表 1 中進行了描述(參見“Certified Properties Confidence Estimates")。這些置信度估計值可在隨附的 FASTA 格式文件 [1] 中獲得。


在缺乏*發(fā)展的身份計量學(目前的事態(tài))的情況下,一種務實的前進方式是將這些 DNA 序列視為從文庫轉(zhuǎn)錄的 RNA 對照的“身份可比性"的來源。

360截圖20220216144438831.jpg


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