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質(zhì)粒是我們?nèi)粘?shí)驗(yàn)中比較常用的載體,其可以自主生長(zhǎng),也能通過(guò)比較容易的方法進(jìn)行大量擴(kuò)增,但往往單一的質(zhì)粒不能滿足實(shí)驗(yàn)需求,需通過(guò)一系列方法進(jìn)行質(zhì)粒重組,我目前比較常用的方法也就是比較陳舊的酶切重組質(zhì)粒的方式,簡(jiǎn)易實(shí)驗(yàn)過(guò)程如下圖:
在這個(gè)過(guò)程中,有幾個(gè)小Tips:
1.原載體的酶切位點(diǎn)由文獻(xiàn)、載體說(shuō)明書(shū)或者導(dǎo)師建議得來(lái),選擇正確的酶切位點(diǎn)是重組質(zhì)粒開(kāi)始的第一步,常見(jiàn)的酶切體系如下:
上述體系適用于大多數(shù)酶切,不是特別難切開(kāi)的載體1μl內(nèi)切酶足夠,酶切前計(jì)算好量,先加ddH2O,最后加內(nèi)切酶。
2.酶切完成后,需要跑瓊脂糖膠鑒定酶切效果,配膠時(shí)注意選擇合適的膠濃度,原則是分子量越大,膠濃度越小。跑膠完成后紫外燈下一般會(huì)有兩段即為成功:載體和切下來(lái)的片段,根據(jù)結(jié)果進(jìn)行膠回收,注意切下來(lái)的片段不回收,膠回收完成后測(cè)濃度備用。
3.插入片段根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)選擇,通常插入片段可以通過(guò)PCR而來(lái),或者是一段由三方公司合成的序列,在連接開(kāi)始前也需要用同樣的兩個(gè)內(nèi)切酶切出缺口。常見(jiàn)連接體系如下:
其中,加入載體和插入片段的量由說(shuō)明書(shū)得來(lái),加樣前計(jì)算好量,先加ddH2O,最后加連接酶,由于連接體系較小,一般使用pcr管進(jìn)行。
4、為確保連接的順利進(jìn)行,務(wù)必保證連接酶和連接酶緩沖液配套使用,即使用同一廠家的,不能混用。
測(cè)序的準(zhǔn)確性對(duì)于后續(xù)慢病毒感染是非常重要的,因此測(cè)序公司的選擇十分重要,尤其出現(xiàn)一些比較難測(cè)的結(jié)構(gòu)如shRNA的發(fā)卡結(jié)構(gòu)等,測(cè)序技術(shù)不成熟的話會(huì)一直報(bào)重疊峰或者測(cè)不通的情況。
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