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行業(yè)產(chǎn)品
SDS-PAGE 作為一個老生常談的實驗,早已廣為科研者所知。然而該實驗雖然基礎(chǔ),但是細節(jié)繁瑣,耗時長久,光是配制試劑就要花費 2 個小時左右。而這還只是 Western blot(WB)的第一步,也使得完成 WB 實驗將會耗費 2 天左右的時間。 這也難怪科研者們常說,一入 WB 深似海,從此休閑是路人。不過,實踐出真知,長期在該實驗里跌爬滾打也總結(jié)出了若干小技巧,可使大家輕松快捷的完成該實驗。
1、未雨綢繆,做好萬全準備
常言道,不打無準備之仗,方能立于不敗之地。實驗中種種試劑、抗體等等均是完成實驗這座大廈的基石,如果基石打不牢,實驗很有可能會半路夭折。而實驗中最痛苦的莫過于與實驗結(jié)果就差那么一步之遙。
以 Western blot(WB)為例,這眼瞅著就要到條帶現(xiàn)身的奇跡時刻,卻愣是讓曝光試劑的匱乏給硬生生的截斷了見證過程,又怎會不讓人懊惱上火呢?
其實,上述窘境皆是科研者在實驗前準備不足所致,若是能提前發(fā)現(xiàn)試劑的不足,或?qū)υ噭┲匦掠嗁?,又或者重新配制溶液,均能再次推進實驗進程。然而就這訂購或配制試劑的過程無疑會消耗我們的時間以及精力。
那么為了避免原材料浪費以及節(jié)省更多的時間,SDS-PAGE 電泳過程中的一些試劑還是早早的配制并妥善保存起來為好,如此方可以備不時之需。
緩沖液(buffer):
關(guān)于這一點,你可能早已知曉,但再次重復(fù)一遍也不是壞事。實驗中可將所有的凝膠緩沖液進行一次性大量配制,如此可方便后續(xù)實驗中對其的任意使用。至于配制的濃度,10x 濃度是實驗室配制母液常用的濃度。有些實驗室會多次重復(fù)利用這些凝膠電泳緩沖液,在這種情況下,建議每次使用 buffer 時均要在緩沖瓶上貼一個標簽,已記錄使用的次數(shù),超過一定期限后就要對緩沖液進行重新配制,以免對實驗結(jié)果造成影響。
過硫酸銨(APS):
在接觸 SDS-PAGE 電泳之初,每次配膠時均會制備新鮮的 APS,可后來發(fā)現(xiàn)溶解后的 APS 在分裝后,可在-20℃冰箱中得以長期儲存。另外,如果你需要經(jīng)常使用 SDS-PAGE 凝膠,那么可取出一只分裝后的 APS 溶液,將其置于 4℃冰箱里,可保證其一個月不會過期。
凝膠(gel):
凝膠是現(xiàn)用現(xiàn)配的好,已成為了各位心中的常識,那么是不是就意味著凝膠不能提前制備么?其實不然,提前準備好的凝膠在 4℃冰箱中大致可以保持兩周左右。但需要謹記的是在儲存凝膠時,保持凝膠濕潤是非常重要??梢詫⒛z板、梳子甚至整個固定裝置都裝入一個充滿蒸餾水的塑料盒中,而后再將其放在 4℃冰箱中進行保存。
樣品(sample):
大家都知道,制備好的蛋白樣品要放在-20℃冰箱中進行存儲,有時一些稀少珍貴的樣品甚至還要放在-80℃冰箱里保存。在此,建議在儲存近期就要進行 PAGE 電泳的蛋白樣品時,可將該蛋白樣品與 loading buffer 混合在一起,加熱變性之后再進行儲存。如此就可以在上樣前,將蛋白樣品解凍并離心即可。用該法儲存樣品長達一年的時間,且實驗結(jié)果依然沒有被破壞。
2、改變分離膠的覆蓋液體
通常多數(shù)人在制備好分離膠后,會用蒸餾水覆蓋其上,以避免分離膠的高低不平。但是實際上,此時用異丙醇代替水的效果會更好,因為異丙醇可以更好保護凝膠,并使凝膠更快地發(fā)生聚合,進而節(jié)省制膠的時間。
3、緩沖液不夠用?準備些彈珠吧
有時,實驗過程中,你會忽然發(fā)現(xiàn)沒有足夠的電泳緩沖液,此時一個節(jié)省時間的方法就是在現(xiàn)有電泳緩沖液添加一些彈珠(是的,就是我們小時候曾經(jīng)玩過的),以提高緩沖液的高度水平來保證緩沖液能沒過上樣孔。 但是要確保這些彈珠是潔凈的,否則一旦其對上樣的蛋白樣品造成了污染,就不要妄想此次實驗會得到一張漂亮的實驗結(jié)果圖片了。
4、傳輸緩沖區(qū)
每個做 SDS-PAGE 電泳的童鞋,只怕都擔心過內(nèi)腔中的電泳緩沖液會有所泄露,畢竟當緩沖液水平降低過多,以至于不能達到覆蓋加樣孔時,就會導(dǎo)致孔內(nèi)變得干燥,進而使得凝膠電泳變得無法正常運行。也許,有人會建議你,當你發(fā)現(xiàn)緩沖液下降的太過厲害,則需要暫停電泳,打開電泳槽,重新給內(nèi)腔添加電泳液,而后再次開啟電泳過程??赡茈娪酒陂g你會多次重復(fù)該過程直至實驗完成為止。
顯然,該方法需要大家時刻關(guān)注電泳槽內(nèi)腔類電泳液的高低水平變化,其實也是蠻費時費力的。而有個簡單粗暴的做法,即一次性在內(nèi)腔外部也添加同水平的電泳液,如此便可以一勞永逸的解決內(nèi)腔電泳液泄露問題。
參考文獻:SDS-PAGE Tips and Tricks to Save You Time
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