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植物總RNA快速提取試劑盒
產(chǎn)品貨號(hào):26125
產(chǎn)品規(guī)格:20T/50T
產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
本試劑盒采用的方法改變傳統(tǒng)一次性裂解的作法,對(duì)材料連續(xù)進(jìn)行兩次裂解,并確保RNA不被降解,有效地解離核蛋白與核酸的復(fù)合物。使用本試劑盒能在2h內(nèi)完成RNA的提取工作,并得到質(zhì)量較高的產(chǎn)品,通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳可以直觀地看到,條帶清晰,不拖尾。
本試劑盒可從植物組織(農(nóng)作物、水果、花草)中,快速提取總RNA,可同時(shí)處理大量不同樣品。提取的總RNA純度高,基本沒(méi)有基因組、蛋白和其它雜質(zhì)的污染,可用于RT-PCR、Real Time RT- PCR、芯片分析、Northern Blot、Dot Blot、PolyA篩選、體外翻譯、RNase保護(hù)分析和分子克隆等多種下游實(shí)驗(yàn)。
產(chǎn)品組成:
產(chǎn)品組成 | 20T | 50T | 保存條件 |
裂解液Ⅰ | 15ml | 37.5ml | 室溫 |
裂解液Ⅱ | 12ml | 30ml | 室溫 |
去蛋白液 | 13ml | 32.5ml | 室溫 |
緩沖液 | 8ml | 20ml | 室溫 |
提取液 | 15ml | 37.5ml | 室溫 |
分離液 | 5ml | 12.5ml | 室溫 |
洗滌液 | 12ml | 30ml | 室溫 |
RNase-Free ddH2O | 2ml | 5ml | 室溫 |
RNase-Free離心管 | 80個(gè) | 200個(gè) | 室溫 |
本試劑盒在室溫儲(chǔ)存12個(gè)月不影響使用效果。
儲(chǔ)存事項(xiàng):
1. 不合適的儲(chǔ)存于低溫(4℃或者-20℃) 會(huì)造成溶液沉淀, 影響使用效果,因此運(yùn) 輸和儲(chǔ)存均在室溫下(15-25℃)進(jìn)行。
2. 避免試劑長(zhǎng)時(shí)間暴露于空氣中產(chǎn)生揮發(fā)、氧化、PH值變化,各溶液使用后應(yīng)及時(shí)蓋緊蓋子。
預(yù)防RNase污染:
1. 經(jīng)常更換新手套。因?yàn)槠つw經(jīng)常帶有細(xì)菌,可能導(dǎo)致RNase污染。
2. 使用無(wú)RNase的塑料制品和槍頭避免交叉污染。
3. RNA在裂解液SL中時(shí)不會(huì)被RNase降解。但提取后繼續(xù)處理過(guò)程中應(yīng)使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。
4. 配制溶液應(yīng)使用RNase-Free ddH2O。(將水加入到干凈的玻璃瓶中,加入DEPC至終濃度0.1%(VNV),混勻后放置過(guò)夜,高壓滅菌。)
操作步驟 (僅供參考) :
注:所有相關(guān)器皿耗材都應(yīng)為RNase-free產(chǎn)品,操作過(guò)程要小心,帶口罩、手套避免環(huán)境中RNA酶污染樣品。
1. 取試驗(yàn)材料放入研缽加入液氮快速研磨成粉末狀,分裝于1.5ml新的無(wú)RNase離心管中,每管約加材料50-100mg。
2. 迅速加入600μl RNA裂解液Ⅰ。
3. 渦旋震蕩混勻后再加入200μl分離液和200μl去蛋白液,振蕩至混勻。
4. 冰上平放靜置5min,4℃ 12000r/min離心10min。
5. 取約700μl上清液轉(zhuǎn)入新的無(wú)RNase離心管后加入500μl RNA裂解液Ⅱ。
6. 振蕩混勻后冰上平放靜置5min,4℃ 12000r/min離心5min。
7. 取約700μl上清液轉(zhuǎn)入新的無(wú)RNase離心管,加350μl緩沖液,搖晃混勻,再加入350μL去蛋白液,震蕩混勻。
8. 4℃ 12000r/min離心10min。
9. 取約700μl上清液轉(zhuǎn)入新的無(wú)RNase離心管并加入等體積的提取液,溫和混勻后室溫放置10min。
10. 4 ℃ 12000r/min離心10min,小心倒掉上清。
11. 加入500μl洗滌液,4℃ 12000r/min離心1min。
12. 小心倒掉上清,風(fēng)干殘留液體,加入30~50μl RNase-Free ddH2O溶解沉淀。
13. 得到RNA溶液并于-70 ℃保存。
RNA得率:
植物樣本(100mg) | 總RNA量(μg) |
棉花葉片 | ~25 |
擬南芥種子 | ~40 |
香蕉果肉 | ~5 |
太子參塊根 | ~15 |
RNA純度及濃度檢測(cè):
完整性: RNA可用普通瓊脂糖凝膠電泳由于細(xì)胞中70-80%的RNA為rRNA,電泳后UV下應(yīng)能看到非常明顯的rRNA條帶。rRNA大小分別約為5kb和2kb,分別相當(dāng)于28S和18S rRNA;植物RNA樣品中最大rRNA亮度應(yīng)為次大rRNA亮度的1.5-2.0倍,否則表示RNA樣品的降解。出現(xiàn)彌散片狀或條帶消失表明樣品嚴(yán)重降解。
純度: OD260/OD280比值是衡量蛋白質(zhì)污染程度的指標(biāo)。高質(zhì)量的RNA,OD260/OD280讀數(shù)在1.8-2.1之間,比值為2.0是高質(zhì)量RNA的標(biāo)志。OD260/OD280讀數(shù)受測(cè)定所用溶液的pH值影響。同一個(gè)RNA樣品,假定在10mM Tris,pH7 .5溶液中測(cè)出的OD260/OD280讀數(shù)1.8-2.1之間,在水溶液中所測(cè)讀數(shù)則可能在1.5-1.9之間,但這并不表示RNA不純。
濃度: 取一定量的RNA提取物,用RNase-Free ddH2O稀釋n倍,用RNase-FreeddH2O將分光光度計(jì)調(diào)零,取稀釋液進(jìn)行OD260,OD280測(cè)定,按照以下公式進(jìn)行RNA濃度的計(jì)算。
終濃度(ng/μl) = (OD260)× (稀釋倍數(shù)n)×40
注意事項(xiàng):
1. 所有的離心步驟均在4攝氏度下進(jìn)行,使用轉(zhuǎn)速可以達(dá)到13,000 rpm的傳統(tǒng)臺(tái)式離心機(jī),如Eppendorf 5415C或者類(lèi)似離心機(jī)。
2. 需要自備研缽。
3. 裂解液Ⅰ和去蛋白液中含有刺激性化合物,操作時(shí)戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大量清水或者生理鹽水沖洗。
4. 關(guān)于DNA的微量殘留:
一般說(shuō)來(lái)任何總RNA提取試劑在提取過(guò)程中無(wú)法wan全避免DNA的微量殘留 (DNase消化也無(wú)法做到10%無(wú)殘留),本公司的 RNA提取產(chǎn)品,由于采取了本公司du特的緩沖體系和基因組DNA清除技術(shù),絕大多數(shù)DNA已經(jīng)被清除,不需要DNase消化,可直接用于反轉(zhuǎn)錄PCR和熒光定量PCR。個(gè)別特殊情況如DNA含量過(guò)于豐富造成殘留或者要進(jìn)行嚴(yán)格的mRNA表達(dá)量分析熒光定量PCR,我們建議在進(jìn)行模板和引物的選擇時(shí):
1)選用跨內(nèi)含子的引物,以穿過(guò)mRNA中的連接區(qū),這樣DNA就不能作為模板參與擴(kuò)增反應(yīng)。
2)選擇基因組DNA和cDNA上擴(kuò)增的產(chǎn)物大小不一樣的引物對(duì)。
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