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更新時(shí)間:2024-08-16 09:12:03瀏覽次數(shù):957評(píng)價(jià)
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應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,環(huán)保,生物產(chǎn)業(yè),農(nóng)業(yè) |
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初始狀態(tài):維也納大學(xué)醫(yī)學(xué)院臨床研究的一個(gè)被CD3陽(yáng)性細(xì)胞染色的前列腺部分的樣本。該課題的目的是進(jìn)行T-cells分布的分析。
組織檢測(cè):組織分析的一步是對(duì)組織邊界和空穴進(jìn)行自動(dòng)檢測(cè)識(shí)別。
所有細(xì)胞核的虛擬通道: 在下一步中圖像的顏色會(huì)被分成藍(lán)色和棕色然后細(xì)胞核會(huì)被檢測(cè)出。
上皮細(xì)胞核的Heat 圖: 通過(guò)細(xì)胞核(藍(lán)色)的形態(tài)特征來(lái)區(qū)分細(xì)胞亞群,進(jìn)而產(chǎn)生相應(yīng)的熱點(diǎn)圖。
上皮部分的膜: 小型對(duì)象的heat圖很清晰,然后以此為基礎(chǔ)上皮細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞的膜產(chǎn)生。
上皮細(xì)胞的間距測(cè)量: 被檢測(cè)的上皮細(xì)胞組織被用于分析,所有CD3細(xì)胞的間距都被測(cè)量。上皮細(xì)胞的T細(xì)胞測(cè)量區(qū)域被確定以間距為0-25um為范圍,25-50um和50-75um。
TG引入細(xì)胞社會(huì)學(xué)概念
在一個(gè)較大的器官中,一個(gè)功能正常的細(xì)胞只是一個(gè)小的細(xì)胞單元的一個(gè)成員。它的發(fā)展和分化與母細(xì)胞和相鄰細(xì)胞所決定。
因此,在細(xì)胞所處的具體環(huán)境中進(jìn)行分析是很重要的。
針對(duì)組織中細(xì)胞實(shí)際情況中的特點(diǎn)StrataQuest包含特殊的圖像處理工具。區(qū)別于間距測(cè)量的是,特殊的圖像處理工具有確定具體細(xì)胞聯(lián)系的功能。
90種抗原+被檢測(cè)的生物形態(tài)結(jié)構(gòu)+確定的細(xì)胞類型中,我們可以得到什么?
MELC是一種多重染色技術(shù),每次染色都有染色、成像、漂白的過(guò)程。每一個(gè)染色過(guò)程都能夠利用一種抗體在一種不同的蛋白質(zhì)中。結(jié)果呈現(xiàn)同一樣本中多種蛋白質(zhì)分布的集合的圖像。 對(duì)于補(bǔ)充數(shù)據(jù)比較多的自動(dòng)圖像分析是一個(gè)理想的工具?;颊吆谒亓龅钠つw細(xì)胞MELC的樣本被分析。
該課題的目的是量化所有90蛋白質(zhì)在melan-A陽(yáng)性黑素瘤細(xì)胞的周圍的表達(dá)。部分運(yùn)行步驟和結(jié)構(gòu)列出。
生物形態(tài)的染色在基質(zhì)和腫瘤方面的檢測(cè)
主要優(yōu)勢(shì)之一是能夠只根據(jù)生物形態(tài)染色來(lái)劃分生物結(jié)構(gòu)。
在以下的案例中該軟件被用于檢測(cè)在被免疫組化染色的腫瘤樣品的腫瘤間部分基質(zhì)較薄的區(qū)域以便對(duì)CD8+T細(xì)胞進(jìn)行蘇木精復(fù)染色。復(fù)染色被利用在基質(zhì)的檢測(cè)中。
基質(zhì)部分只需利用hemalaun復(fù)染色被檢測(cè),17.3%的樣本是基質(zhì)(橘色外框)。22%的CD8+T細(xì)胞存在基質(zhì)部分(綠色)。
血管中腫瘤細(xì)胞的間距
該軟件的細(xì)胞形態(tài)分析功能也能夠應(yīng)用于免疫熒光樣本中。例如,腫瘤區(qū)域能夠用特異的anti-cytokeratin+cells進(jìn)行檢測(cè)。血管組織用anti-CD31特異染色進(jìn)行檢測(cè)。血管中腫瘤部分的細(xì)胞間距也能夠被測(cè)量。
結(jié)果:血管組織中腫瘤細(xì)胞的數(shù)目及每個(gè)細(xì)胞間的距離都會(huì)呈現(xiàn)出來(lái): 0-50 μm: 6.988/52%; 50-100 μm: 3.483/26%; 100-150 μm: 1.845/14%。
單個(gè)細(xì)胞的獲取和細(xì)胞群簇的特性
可以提供雙重的功能。一種是視覺(jué)上分離然后處理特殊的細(xì)胞類型,比如利用TissueFAXS掃描得到的。另一種是,檢測(cè)和分析相對(duì)大的器官中的細(xì)胞亞群。群簇通過(guò)特殊的中央細(xì)胞和其它的群簇細(xì)胞的間距和可見(jiàn)的特殊染色類型被確定。
以下圖像描述了兩種工作流程的主要部分在被DAPI,F(xiàn)OXP3,CD25和CD4的結(jié)腸樣本中。
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