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人們?cè)絹?lái)越擔(dān)心，科學(xué)界正在經(jīng)歷一場(chǎng)可重復(fù)性危機(jī)。微生物組學(xué)是目前面臨大挑戰(zhàn)的領(lǐng)域之一，因?yàn)樵谄涔ぷ髁鞒痰拿恳徊蕉紩?huì)引入大量的偏差[1]。這令研究人員開(kāi)始使用模擬微生物菌落標(biāo)準(zhǔn)（如Zymobiomics®微生物菌落標(biāo)準(zhǔn)（Zymo Research Corp.，Irvine，CA））來(lái)質(zhì)疑和驗(yàn)證他們的方法。Zymobiomics®標(biāo)準(zhǔn)包含10種特性良好的微生物（即5種革蘭氏陽(yáng)性、3種革蘭氏陰性和2種酵母），它們以規(guī)定的比例混合。該標(biāo)準(zhǔn)由不同大小和細(xì)胞壁韌性的微生物組成，是評(píng)估微生物工作流程每一步的理想標(biāo)準(zhǔn)。

研究顯示，在核酸提取步驟中選擇的細(xì)胞裂解技術(shù)可顯著影響微生物組二代測(cè)序（NGS）的分析結(jié)果[2]。珠式機(jī)械裂解已成為金標(biāo)準(zhǔn)。由于其強(qiáng)大的3D運(yùn)動(dòng)，Precellys Evolution在幾秒鐘內(nèi)提供了強(qiáng)大的裂解功能。在這里，我們使用ZymoBIOMICS®微生物菌落標(biāo)準(zhǔn)來(lái)證明Precellys®Evolution生物樣品研磨器與Zymobiomics®DNA/RNA Miniprep試劑盒相結(jié)合能夠在不損害RNA完整性的情況下實(shí)現(xiàn)*溶解，從而實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確的亞基因組和微生物組分析。此外，我們還評(píng)估了用此工作流程從本標(biāo)準(zhǔn)中提取的核酸的質(zhì)量，以及另外3個(gè)樣本，包括革蘭氏陽(yáng)性菌和革蘭氏陰性菌以及人類糞便樣本。

Precellys生物樣品研磨器：

超快速: up to 10 000 rpm

超靈活: 0.5, 2, 7和 15mL研磨管

超高效: 強(qiáng)力3D振動(dòng)

超保護(hù): Cryolys Evolution新型冷卻技術(shù)，無(wú)需液氮和壓縮空氣

參考資料

1、Wesolowska-Andersen A, Bahl Ml, Carvalho V et al. Choice of bacterial DNA extraction method from fecal material influences community structure as evaluated by metagenomic analysis. Microbiome 2(1), 19 (2014)

2、Costea Pl. Zeller G, Sunagawa S et al. Towards standards for human fecal sample processing in metagenomic studies. Nat. Biotechnol. 35(11), 1069-1076 (2017)

3、Zymo Research is a privately-held American manufacturer of molecular biology research tools used for DNA and RNA research and analysis. Their offices are headquartered at 17062 Murphy Ave., Irvine, CA92614, Tel:949-679-1190