Precellys Evolution—蛋白質(zhì)樣本制備理想方案
蛋白質(zhì)是生命的基石,它們幾乎在地球的每一種生物中都能被找到,對(duì)我們的生存很重要。一些蛋白質(zhì)例如抗體、酶、激素等會(huì)參與化學(xué)反應(yīng)免疫過(guò)程以及細(xì)胞活動(dòng)。蛋白質(zhì)還在運(yùn)動(dòng)、結(jié)構(gòu)支持、存儲(chǔ)能量、細(xì)胞消化、底物運(yùn)輸?shù)确矫嫫鹱饔?。蛋白質(zhì)由長(zhǎng)鏈氨基酸組成,形成多種多樣,不同形狀大小的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)因?yàn)槠洳煌拈L(zhǎng)鏈氨基酸組成,每一種類型都有穩(wěn)定特別的三維結(jié)構(gòu)。這種特殊的結(jié)構(gòu)是至關(guān)重要的,每一個(gè)形狀的改變都會(huì)引起蛋白質(zhì)功能的變化。所以說(shuō)像蛋白質(zhì)這種對(duì)熱敏感的分子,在分子下游分析過(guò)程之前的樣品制備就顯得格外重要。Precellys Evolution結(jié)合Cryolys Evolution冷卻系統(tǒng)能夠有效的在研磨過(guò)程中使研磨腔室溫度穩(wěn)定保持在4℃。
使用Precellys提高組織蛋白質(zhì)的提取量
APPNOTE 1:從大鼠皮膚組織提取蛋白質(zhì)沉淀和脂肪
APPNOTE 2:使用Minilys從小鼠心臟組織從提取蛋白質(zhì)
Protocol 1:大體積大腸桿菌中提取蛋白質(zhì)
Protocol 2: 96通道眼睛組織中提取蛋白質(zhì)
APPNOTE 1
從*勻質(zhì)的大鼠皮膚組織中提取蛋白質(zhì)沉淀和脂肪
本應(yīng)用中研究了從大鼠皮膚組織中提取蛋白質(zhì)沉淀和有生物活性的脂肪。本應(yīng)用中利用固相萃取與液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(LC-MS/MS)來(lái)測(cè)組織中脂肪含量。大鼠皮膚組織使用Precellys Evolution生物樣品研磨器和Cryolys冷卻系統(tǒng)進(jìn)行研磨,配合7mlCKMix50_研磨管。此外還測(cè)試了在大鼠組織整個(gè)研磨的過(guò)程結(jié)束后,樣本溫度都在40℃以下。
實(shí)驗(yàn)材料
自動(dòng)研磨器:Precellys Evolution生物樣品研磨器和Cryolys冷卻系統(tǒng);
研磨管:CKMix50_7ml(Cat #: KT03961-1-306.7);
組織樣本:大鼠皮膚組織(后足背側(cè)和腹側(cè));
干冰;
Buffer:甲醇。
實(shí)驗(yàn)方法
20-90mg成年大鼠皮膚組織(后足背側(cè)和腹側(cè)),7ml研磨管加2.8mm和5.0mm陶瓷珠,500µL甲醇;轉(zhuǎn)速8000rpm,5個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)10s,循環(huán)之間間歇120s;Cryolys冷卻系統(tǒng)將腔室內(nèi)溫度降至5℃時(shí)開(kāi)始研磨;研磨結(jié)束之后立即使用溫度探針檢測(cè)樣本管內(nèi)的溫度。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果
如下圖1、2所示,圖1中a、b分別為研磨前與研磨后效果對(duì)比,結(jié)果顯示皮膚樣本被充分研磨;圖2為樣本被勻質(zhì)后經(jīng)過(guò)固相萃取,用LC-MS/MS技術(shù)檢測(cè),成功檢測(cè)到花生四烯酸,5-HETE、8-HETE、9-HETE的濃度分別為1.3 ±0.3、7.9±0.6和1.3 ± 0.4 ng/mg。
實(shí)驗(yàn)結(jié)論
大鼠的后爪皮膚比背部皮膚厚,因此獲得其完整勻質(zhì)的難度更大,使用Precellys Evolution生物樣品研磨器,結(jié)合Precellys裂解試劑盒成功研磨大鼠后爪皮膚組織。本應(yīng)用同樣也展示了Cryolys冷卻系統(tǒng)能夠保證樣本溫度在40℃以下。
APPNOTE 2
使用Minilys從小鼠心臟組織中提取蛋白質(zhì)
開(kāi)曼化學(xué)研究和生產(chǎn)抗體,為了營(yíng)造更好的研究市場(chǎng)。為了保證質(zhì)量,需要合適的組織裂解產(chǎn)物來(lái)確保我們的產(chǎn)品達(dá)到或者超過(guò)我們質(zhì)量控制的標(biāo)準(zhǔn)。我們很多目標(biāo)蛋白都是多通道跨膜受體,因此需要一個(gè)非常強(qiáng)力的裂解系統(tǒng)。
實(shí)驗(yàn)材料
Minilys生物樣品研磨器;CKMix 2mL (KT03961-1-009.2)研磨管;920mg小鼠心臟組織;裂解Buffer:920µL M-PER (Mammalian Protein Extraction Reagent, Pierce)。
實(shí)驗(yàn)方法
Minilys研磨參數(shù):研磨速率5000rpm;4個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)20s,循環(huán)之間間歇5s;
分析方法:使用Minilys研磨樣本之后,從中提取細(xì)胞質(zhì)和膜蛋白;HEK 293細(xì)胞(S1P3轉(zhuǎn)染和未轉(zhuǎn)染)在細(xì)胞培養(yǎng)板上培養(yǎng),隨后提取蛋白質(zhì);所有的蛋白通過(guò)BCA法測(cè)定,溶菌產(chǎn)物通過(guò)Western Blot分析。
結(jié)果如圖所示:圖1為使用S1P3多克隆抗體;一列為3µLMark,第二列為2.5μgS1P3轉(zhuǎn)染過(guò)的HEK293細(xì)胞裂解產(chǎn)物,第三列為5μgS1P3轉(zhuǎn)染過(guò)的HEK293細(xì)胞裂解產(chǎn)物,第4列為50μg小鼠心臟膜蛋白裂解產(chǎn)物。結(jié)果顯示均有很好的條帶,研磨提取效果好。圖2為使用一種視神經(jīng)多克隆抗體(C-Terminal);一列為3µLMark,第二列為60μgHEK293細(xì)胞裂解產(chǎn)物,第三列為40μgHEK293細(xì)胞裂解產(chǎn)物,第四列為50μg小鼠心臟細(xì)胞質(zhì)裂解產(chǎn)物,第五列為小鼠心臟膜蛋白裂解產(chǎn)物,結(jié)果顯示均有很好條帶,研磨提取效果好。
實(shí)驗(yàn)結(jié)論
Minilys生物樣品研磨器結(jié)構(gòu)緊湊,使用方便,Minilys提供了更純凈、更濃縮的裂解產(chǎn)物,對(duì)目標(biāo)蛋白分析有很高的重復(fù)性。Minilys可同時(shí)研磨3個(gè)樣本,可用2ml或0.5ml研磨管,是低通量實(shí)驗(yàn)的理想選擇。
Protocol 1
大體積大腸桿菌中提取蛋白質(zhì)方案
研磨管:7ml VKMix_或15mlVK05_
樣本量:5ml或10ml(OD600下為50)
研磨參數(shù):7ml:轉(zhuǎn)速9000rpm,6個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)30s,循環(huán)間歇60s;15ml:轉(zhuǎn)速9900rpm,6個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)60s,循環(huán)間歇60s
Protocol 2
96通道從眼組織中提取蛋白質(zhì)
研磨管:CKMix_WP
樣本:視網(wǎng)膜神經(jīng)或眼杯
Buffer:50µL M-PER
研磨參數(shù):視網(wǎng)膜:轉(zhuǎn)速5500rpm,3個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)30s,循環(huán)間歇30s;眼杯:轉(zhuǎn)速8200rpm,3個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)30s,循環(huán)間歇30s。
Precellys生物樣品研磨器:
超快速: up to 10 000 rpm
超靈活: 0.5, 2, 7和 15mL研磨管
超高效: 強(qiáng)力3D振動(dòng)
超保護(hù): Cryolys Evolution新型冷卻技術(shù),無(wú)需液氮和壓縮空氣