Minilys:快速可重復的病毒宏基因組研究
閱讀:1037 發(fā)布時間:2020-9-10
二代測序(NGS)*改變了人類腸道微生物群落的研究,即存在于人體腸道內(nèi)的微生物群落(包括細菌、真菌和病毒)。雖然近年來,我們對人類微生物群落的了解有了很大的提高,但大多數(shù)研究都集中在細菌上,忽略了病毒基因組,故此現(xiàn)在對人類病毒組(人類微生物組的病毒成分)知之甚少,同時研究人類腸道病毒組的一個主要挑戰(zhàn)是缺乏有效的高通量和可重復的病毒組分析方法。
科學家們利用qPCR和NGS對病毒組分析樣品制備的不同步驟的效果進行了評估。利用一個模擬病毒組(包括9種高度多樣化的病毒,其中包含冠狀病毒)和一個細菌模擬菌群,進行均質(zhì)、離心、過濾和隨機擴增步驟的測試,由此建立了一種優(yōu)化的糞便樣品制備方法,即新型病毒富集技術NetoVIR。其中NetoVIR利用Minilys生物樣品研磨器(法國Bertin)及Minilys提供的優(yōu)化步驟對樣品進行了高效、均勻地均質(zhì)化,從而保證了進一步分析結果的可靠性和重復性。
下圖所示,NetoVIR可以富集到模擬病毒組樣本中存在的所有病毒。更多詳情,請點擊閱讀原文。