詳細(xì)介紹
P6 High-Fidelity polymerase高保真酶
P6 High-Fidelity 高保真酶 DNA.Polymerase 是基于 Pyrococcus furiosus 的高溫 DNA 聚合酶,具有耐熱型 5´
-3´ 的聚合酶活
力以及 3´
-5´的核酸外切酶活力,因此屬于高保真 DNA 聚合酶(其保真度達(dá)到普通 Taq 酶的 55 倍)。該酶經(jīng)過
生物工程改造后,其擴(kuò)增能力、保真度都得到極.大提升,并且具有廣泛的模板適應(yīng)性,擴(kuò)增速度達(dá)到 2-4
kb/min。優(yōu)化的 2×P6 buffer反應(yīng)緩沖液對(duì)于簡(jiǎn)單或復(fù)雜模板、短片段或長(zhǎng)片段 PCR擴(kuò)增都具有良好的適應(yīng)性,
其中,質(zhì)粒、λ DNA 等簡(jiǎn)單模板有效擴(kuò)增長(zhǎng)度可達(dá) 40 kb,cDNA 有效擴(kuò)增長(zhǎng)度可達(dá) 15 kb,基因組有效擴(kuò)增長(zhǎng)
度可達(dá) 20 kb。
產(chǎn)品組成
組分
21804-1
21804-2
21804-3
P6 High-Fidelity polymerase高保真酶
100 U
5 × 21804-1
10 × 21804-1
2× P6 buffer
2 × 1.25 mL
dNTPs (10 mM each)
100 μL
Loading buffer
1 mL
產(chǎn)品應(yīng)置于-20 ℃保存。
產(chǎn)品質(zhì)控
(1)性能檢測(cè) 1:
在 50 μL PCR 反應(yīng)體系加入 1 U P6 High-Fidelity DNA Polymerase、100 ng Human RP11 13M9-pBACe3.6 質(zhì)
粒,擴(kuò)增 15 kb 的 DNA ,在 30 個(gè)循環(huán)擴(kuò)增后經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠檢測(cè)可在 15 kb 處檢測(cè)到非常亮且單一 的目的條帶。
(2)性能檢測(cè) 2:
在 50 μL PCR 反應(yīng)體系加入 1 U P6 High-Fidelity DNA Polymerase、大腸桿菌菌落,擴(kuò)增 5 kb 的 DNA 目的
片段,在 30 個(gè)循環(huán)擴(kuò)增后經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠檢測(cè)可在 5 kb 處檢測(cè)到較亮的單一目的條帶。
(3)大腸桿菌核酸殘留檢測(cè):
在 20 μL 熒光定量 PCR 反應(yīng)體系加入 1 U P6 High-Fidelity DNA Polymerase 和大腸桿菌特異基因擴(kuò)增引物
(如 gapA);在不加入大腸桿菌 DNA 模板的情況下,20 個(gè)循環(huán)內(nèi)熒光信號(hào)值在基線范圍。
常規(guī) PCR 反應(yīng)體系:
P6 High-Fidelity polymerase高保真酶
#21804
2. PCR 反應(yīng)參數(shù)(供參考):
(起始變性): 95 ℃ 5 min
(解鏈): 95 ℃ 30 sec
(退火): 55 ℃ 30 sec
(延伸): 72 ℃ x min (30-35 循環(huán):2 kb/min)
(終延伸): 72 ℃ 7 min
1. 在冰浴上設(shè)置 PCR 反應(yīng)(供參考):
模板: < 500 ng
2× P6 Buffer: 25 μL
Primer 1/2: 0.2 - 1.0 μM
dNTPs (10 mM): 1 μL
P6: 1 μL
滅菌蒸餾水 Up to 50 μL應(yīng)用實(shí)例
P6 擴(kuò)增速度測(cè)試
以pUC18質(zhì)粒為模板擴(kuò)增不同長(zhǎng)度的DNA ,PCR反應(yīng)程序設(shè)置為:95℃ 5min;98℃ 5sec, 55℃ 30sec,
72℃ 1sec;72℃ 5min(30 Cycles)。結(jié)果如下:
常規(guī) PCR 擴(kuò)增指南:
1. 簡(jiǎn)單模板如質(zhì)粒等可按照 5 sec/kb 設(shè)置程序。
2. 大多數(shù)模板的預(yù)變性溫度為 95 度,30 sec-5 min。
高 GC 含量模板預(yù)變性溫度為 98 度,30 sec-5 min。
3. 常規(guī)退火時(shí)間設(shè)置為 10 sec,復(fù)雜模板設(shè)置為 10 sec-30 sec。
P6 擴(kuò)增不同長(zhǎng)度的 DNA
以 100 ng Human RP11 13M9-pBACe3.6 質(zhì)粒為模板擴(kuò)增不同長(zhǎng)度的 DNA ,PCR 反應(yīng)程序設(shè)置為:
95 ℃ 5min;98 ℃ 5 sec, 55 ℃ 30 sec, 72 ℃ 8 min;72 ℃ 10 min(30 Cycles)。結(jié)果如下:
長(zhǎng)片段擴(kuò)增指南:
1. 使用高質(zhì)量的模板。
2. 增加引物長(zhǎng)度提高退火溫度,退火/延伸合并成一步。
3. 添加適當(dāng)濃度的 DMSO,一般不高于 5%。
4. 增加體系中 P6 使用量。
5. 提高變性溫度為 98 度,縮短變性時(shí)間為 5 sec。
P6 擴(kuò)增高 GC 含量和低 GC 含量 DNA
以人基因組為模板擴(kuò)增不同 GC 含量的 DNA ,程序設(shè)置為:95 ℃ 5min;95 ℃ 30 sec, 55 ℃ 30 sec,
72 ℃ 1 sec;72 ℃ 5 min(30 Cycles)。結(jié)果如下:
高 GC 和低 GC 模板擴(kuò)增指南
1. 使用高質(zhì)量的模板。
2. 高 GC 模板可適當(dāng)添加 DMSO,一般終濃度不高于 5%。
3. 高 GC 含量模板可適當(dāng)提高退火溫度,還可使用 Touch
down 的方法進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增。
4. 低 GC 含量模板可以適當(dāng)降低退火溫度。