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PCR檢測方法有很多,其中PCR擴增儀又稱為“PCR儀",它是PCR實驗中*的實驗室設(shè)備之一。PCR儀器大致可以分為三類:即:普通PCR儀,熒光定量PCR儀,梯度PCR儀和原位PCR儀等。
一、PCR的原理
在pcr擴增實驗中,PCR反應過程實質(zhì)就是DNA按模板復制而發(fā)生的聚合酶鏈反應的過程,主要包括引物、dNTP、DNA靶序列、DNA聚合及PH緩沖液體系。
PCR反應過程如下:
1.通過升溫反應體系混合物一般為:94℃/15s-30s.使目標DNA雙螺旋的氫鍵產(chǎn)生斷裂從而形成單鏈DNA作為合成模板.
2、在反應體系冷卻至引物的TM值左右,使引物與單鏈DNA模板產(chǎn)生互補結(jié)合,從而實現(xiàn)DNA的互補擴增,這一過程也被稱之為退火。
3、擴增延伸
在PCR擴增過程中,當反應體系的溫度升高到72 ℃左右時,引物在TAQ聚合酶的作用下,以引物為起點dNTP作為底物合成新的DNA鏈條。
以上步驟重復循環(huán),直擴增量達到基因檢測的所需要數(shù)量即可停止循環(huán)。
使用PCR擴增儀進行PCR反應過程中常見的問題:
無明顯的擴增條帶
這種情況主要是由于以下情況產(chǎn)生:
(1)Taq酶失活或Taq酶活性加入量少所造成。DNA聚合Taq酶的保存溫度一般在-20℃環(huán)境下,盡量避免反復凍融所產(chǎn)生的影響。
(2)混合模板反應體系中如果含有甲酸、甲醛含等雜質(zhì)也會對DNA鏈上的堿基造成影響,降低PCR擴增效果。
(3)PCR儀的各反應階段適宜溫度設(shè)定也很重要,過高或過低的反應溫度,都會使DNA聚合酶產(chǎn)生失活。
(4)引物設(shè)置不合理或反應系統(tǒng)中被蛋白酶及核酸酶,這些因素也同樣會影響到DNA的合成與產(chǎn)出。
(5)另外,PCR循環(huán)數(shù)不足或者延伸擴增時間短也會影響到PCR產(chǎn)物產(chǎn)量。
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