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iTRAQ（TMT）-多通量定量分析蛋白組學(xué)服務(wù) 標(biāo)記肽段通過(guò)LC-MS，能同時(shí)實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)的鑒定和對(duì)蛋白質(zhì)的相對(duì)定量分析。
詳細(xì)介紹
iTRAQ(TMT)-多通量定量分析蛋白組學(xué)服務(wù)：
iTRAQ (Isobaric Tag for Relative and Absolute Quantitation) 和 TMT(Tandem Mass Tag) 分別是由AB SCIEX和Thermo Scientific公司分別開(kāi)發(fā)的、對(duì)trypsin酶解肽段進(jìn)行標(biāo)記的試劑盒。標(biāo)記肽段通過(guò)LC-MS，能同時(shí)實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)的鑒定和對(duì)蛋白質(zhì)的相對(duì)定量分析。
iTRAQ和TMT的技術(shù)原理*一樣，區(qū)別在于：（1）生產(chǎn)商不同；（2）分子結(jié)構(gòu)稍有差異；（3）標(biāo)記通量有差異。iTRAQ有4標(biāo)（4-plex）和8標(biāo)（8-plex）2種規(guī)格，TMT有2標(biāo)（2-plex）、6標(biāo)（6-plex）和10標(biāo)（10-plex）等3種規(guī)格。iTRAQ/TMT標(biāo)記通量多樣，為實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)提供了更多的選擇性，有利于用戶(hù)根據(jù)自己的樣品數(shù)量，選擇合適的標(biāo)記方案。
iTRAQ/TMT技術(shù)的優(yōu)勢(shì)是能同時(shí)分析8-10組樣品，實(shí)驗(yàn)周期短。但其不足體現(xiàn)在實(shí)驗(yàn)步驟多，系統(tǒng)誤差較大。
iTRAQ(TMT)-多通量定量分析蛋白組學(xué)服務(wù)方案：
客戶(hù)只需提供樣本即可。我方負(fù)責(zé)完成后續(xù)所有實(shí)驗(yàn)，包括：
蛋白質(zhì)提取與trypsin酶解。
酶解肽段iTRAQ/TMT標(biāo)記與混合。
混合肽段HPLC分離，收集餾分。
對(duì)每個(gè)餾分進(jìn)行LC-MS測(cè)試。
MS數(shù)據(jù)定性及定量分析，篩選差異表達(dá)的蛋白質(zhì)。
差異表達(dá)蛋白常規(guī)生物信息學(xué)分析。
我方該服務(wù)的優(yōu)勢(shì)體現(xiàn)在：（1）樣品通常分為15個(gè)餾分；（2）每個(gè)流程LC-MS測(cè)試時(shí)間為2h，共計(jì)測(cè)試15×2=30h。餾分和測(cè)試時(shí)間的增加，能顯著提高蛋白質(zhì)鑒定數(shù)目和蛋白質(zhì)定量的準(zhǔn)確度。