微生物多樣性測(cè)序

微生物多樣性測(cè)序是基于二代高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)樣品中的優(yōu)勢(shì)物種、稀有物種以及一些未知的物種進(jìn)行檢測(cè)，獲得樣品中的微生物群落組成以及它們之間的相對(duì)豐度。具有低成本、高通量、流程自動(dòng)化等優(yōu)勢(shì)。

擴(kuò)增子測(cè)序

• 16S rRNA測(cè)序（細(xì)菌多樣性研究）

• 18S rRNA測(cè)序（真核微生物多樣性研究）

• ITS測(cè)序（真菌多樣性研究）

宏基因組測(cè)序
2005 年，加州大學(xué)伯克利分校的 Kevin Chen 和Lior Pachter 將宏基因組定文為“應(yīng)用現(xiàn)代基因組學(xué)的技木直接研究自然狀態(tài)下的微生物的有機(jī)群落，而不需要在實(shí)驗(yàn)室中分離單一的菌株"的科學(xué)。宏基因組測(cè)序是以特定生境中的整個(gè)微生物群落作為研究對(duì)象，提取環(huán)境樣本總 DNA，獲得環(huán)境微生物基因信息總和，研究環(huán)境微生物的群落結(jié)構(gòu)、物種分類、基因功能及代謝網(wǎng)絡(luò)等，具有通量高、速度快、信息全等特點(diǎn)，在鑒定低豐度的微生物群落、挖掘更多基因資源方面具有很大優(yōu)勢(shì)。

實(shí)驗(yàn)流程：樣品準(zhǔn)備、DNA提取、DNA檢測(cè)、文庫(kù)制備、文庫(kù)質(zhì)檢、上機(jī)測(cè)序、生信分析

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