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中醫(yī)藥作為我國五千年傳承的寶貴財富，其療效與科學性歷經(jīng)歲月洗禮，得到了廣泛認可。然而，由于中醫(yī)藥的理論體系及其作用機制仍有許多尚未明晰之處，這在一定程度上制約了其深入發(fā)展和廣泛應用。

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轉錄組是指特定細胞在特定功能狀態(tài)下所表達的全部基因的總和，通過對其進行深入研究，可以揭示不同組織或不同生理狀態(tài)下基因表達水平的差異。人體疾病的調控機制與轉錄組中的差異基因以及信號通路的變化緊密相關，這為深入探索生命科學的奧秘提供了重要線索。

通過對中藥藥物干擾后的細胞系進行比較轉錄組研究分析，我們可以從整體上把握藥物處理對細胞活動的影響。通過分析功能基因及其表達規(guī)律，我們可以確定與特定表型相關的信號通路和關鍵基因，從而精準鎖定藥物作用的靶點。同時，這種研究方法還有助于篩選出具有潛力的藥用成分，為新型中藥藥物的研發(fā)提供科學、精確、全面的數(shù)據(jù)支撐。

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因此，采用轉錄組測序（RNA-seq）技術深入探究中醫(yī)藥的研究領域，不僅有助于我們更全面地理解中醫(yī)藥的作用機制，而且有望為新型藥物的研發(fā)開辟一條嶄新的道路，從而推動中醫(yī)藥事業(yè)的穩(wěn)步發(fā)展。

傳統(tǒng)的RNA-seq文庫構建方式通常是每個樣本單獨進行，這種方式不僅建庫通量較低，還導致建庫成本高昂。為了克服這一難題，研究者們成功開發(fā)了一種高通量、低成本的中藥轉錄組混樣測序技術，即TCM-seq技術[1]。該技術在建庫環(huán)節(jié)巧妙地將多個樣本混合在一起進行建庫，尤其適用于中藥這種成分復雜且需要大量樣本的實驗，為中醫(yī)藥研究提供了更為高效和經(jīng)濟的方法（圖1）。

生物公司也成功開發(fā)出商業(yè)化的建庫試劑盒，此試劑盒可高效地完成對數(shù)百種藥物處理后的細胞進行RNA捕獲和混合建庫流程，進而支持高通量藥物篩選工作的高效推進。同時，該試劑盒也適用于在多種不同細胞系及不同處理條件下，對同一類中藥處理樣本進行RNA捕獲和混合建庫，為中藥藥效機制的研究提供有力支持。這種建庫方法通常結合了樣本條形碼技術和一步法反轉錄擴增技術，能夠高效地獲取細胞培養(yǎng)板中的cDNA分子，隨后進行混合建庫。在測序完成后，通過識別不同的條形碼信息，可以精確地拆分出各個樣本的轉錄組信息，從而確保研究結果的準確性和可靠性。

該技術一般分成以下3步：

具體的建庫流程：

在上面建庫流程中，瑞孚迪JANUS G3工作站整合NIVO酶標儀（用于濃度檢測）和Labchip微流控毛細管電泳（用于片段檢測）可以幫助客戶實現(xiàn)整體建庫流程的自動化（如下圖）。

Janus G3整合型移液工作站：

靈活配置，配合ODTC模塊、磁力架模塊、傾斜模塊可實現(xiàn)RNA-seq文庫制備工作。

獨立4或8通道， 各通道均有液面探測功能，并可轉移不同體積液體

移液通道間距可自動調整，可操作不同規(guī)格的容器

可進行濃度均一化，系列稀釋和PCR板準備

可整合labchip及酶標儀，提供自動化方案

LabChip®GX Touch核酸分析儀

質控金標準，基于微流控技術

速度快，大約30秒內即可對核酸進行質量控制分析

自動化程度高、運行成本低、通量高且靈活等特點

DNA/RNA樣本以及下游NGS文庫片段質控