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靶向蛋白降解技術(shù)
靶向蛋白降解(Targeted Protein Degradation,TPD)是一種新興的藥物發(fā)現(xiàn)策略。這種技術(shù)利用小分子或抗體等大分子,劫持細(xì)胞內(nèi)的兩大蛋白降解系統(tǒng):
泛素化-蛋白酶體系統(tǒng)
溶酶體降解途徑
實(shí)現(xiàn)對(duì)疾病相關(guān)蛋白的特異性高效降解。
iTPD(a)與eTPD(b)蛋白降解機(jī)制
相較于傳統(tǒng)的小分子抑制劑,基于TPD技術(shù)的藥物在靶點(diǎn)蛋白的選擇上限制性更小,能夠用于消除經(jīng)典的無(wú)成藥性蛋白,從而擁有更為豐富的靶點(diǎn)庫(kù)。近年來(lái),通過(guò)蛋白降解靶向嵌合體(Proteolysis-Targeting Chimeras,PROTACs)、分子膠等對(duì)細(xì)胞內(nèi)靶向蛋白降解(iTPD),已發(fā)展成小分子藥物的重要新模式。這類降解劑大多借助蛋白酶體途徑,促進(jìn)E3連接酶與靶蛋白(POI)的相互作用,導(dǎo)致泛素(Ub)從E2酶轉(zhuǎn)移到POI,隨后被蛋白酶體降解。iTPD藥物在過(guò)去的20年里得到了快速發(fā)展,有越來(lái)越多的管線進(jìn)入臨床階段解決患者的實(shí)際需求。
分泌蛋白和膜結(jié)合蛋白由至少四分之一的人類基因組編碼,這些蛋白中有多數(shù)與腫瘤發(fā)生、衰老相關(guān)疾病以及自身免疫病等息息相關(guān)。細(xì)胞外靶向蛋白降解(extracellular targeted protein degradation, eTPD)技術(shù)借助溶酶體途徑,通過(guò)內(nèi)吞、吞噬和自噬作用降解長(zhǎng)壽命蛋白、不溶性蛋白聚集體,以及其他大分子化合物和細(xì)胞器等。最近幾年,不斷有通過(guò)溶酶體途徑的TPD技術(shù)被開(kāi)發(fā)出來(lái),如LYTAC、KineTAC等,為蛋白降解賽道的發(fā)展帶來(lái)新動(dòng)力。
各種TPD策略
瑞孚迪產(chǎn)品在TPD藥物開(kāi)發(fā)中的應(yīng)用
在這篇文獻(xiàn)中,研究者設(shè)計(jì)了一種基于CRBN E3連接酶的多激酶降解劑TL12-186,通過(guò)定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法來(lái)篩選感興趣的基因家族,以確定易于降解的靶標(biāo),其結(jié)果進(jìn)一步指導(dǎo)開(kāi)發(fā)了針對(duì)FLT3和BTK的選擇性降解劑,具有改善疾病治療的潛力。
值得一提的是,我們的產(chǎn)品在這項(xiàng)研究中發(fā)揮了重要作用:
1
利用JANUS工作站進(jìn)行自動(dòng)化液體處理,例如向?qū)嶒?yàn)板中添加化合物;
2
通過(guò)AlphaScreen實(shí)驗(yàn)測(cè)定TL12-186與CRBN的有效結(jié)合;
3
使用EnVision多功能酶標(biāo)儀進(jìn)行生化水平CRBN結(jié)合實(shí)驗(yàn)、細(xì)胞內(nèi)CRBN結(jié)合實(shí)驗(yàn)及細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)的檢測(cè)。
JANUS液體處理工作站和納升級(jí)微量移液頭
AlphaScreen和EnVision多功能酶標(biāo)儀
除了上述產(chǎn)品外,瑞孚迪(Revvity)的高內(nèi)涵成像系統(tǒng)(HCS)、Celigo全視野細(xì)胞掃描分析儀和Cellaca 細(xì)胞計(jì)數(shù)儀等產(chǎn)品,也在TPD研發(fā)中扮演了重要角色。例如,高內(nèi)涵成像系統(tǒng)能夠進(jìn)行多參數(shù)細(xì)胞分析,幫助科研人員深入了解細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的降解機(jī)制。通過(guò)高通量、高分辨率的成像技術(shù),研究人員可以更快地篩選出具有潛力的藥物分子。Celigo具備全孔無(wú)標(biāo)記的細(xì)胞成像功能,能夠在不干擾細(xì)胞生長(zhǎng)的情況下,監(jiān)測(cè)細(xì)胞狀態(tài)和藥物反應(yīng)。這一功能對(duì)于研究蛋白降解過(guò)程中的細(xì)胞變化至關(guān)重要。