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逐典Pannarase全能核酸酶作為一種非特異性核酸內(nèi)切酶,展現(xiàn)出了優(yōu)勢(shì)。其來源于Serratia marcescens,能夠在多種條件下高效降解各種形式的DNA和RNA,生成特定大小的寡核苷酸殘基片段。這種酶對(duì)核酸堿基序列沒有特異性要求,意味著它可以在核酸鏈內(nèi)的任意位置進(jìn)行切割,從而大大提高了去除殘留核酸的效率。
Q1:使用過程中,如何保證讓酶活力處于最佳?
A:pH和溫度控制很重要,最適pH在8.0,不過6-10之間也可使用,最高活性溫度是37℃,酶活性溫度范圍0~42°C。
Q2:關(guān)于存放問題,如果臨時(shí)使用會(huì)不會(huì)影響后期?
液體有效期為1年。打開包裝使用后,如果在 2~8oC 環(huán)境下放置超過1周時(shí)間,建議過濾除菌,防止微生物污染。
Q3:樣品中含有EDTA,鹽酸胍等成分,我們需要注意什么?
常用試劑對(duì)全能核酸酶的活性有抑制作用,反應(yīng)條件不適合容易加長(zhǎng)反應(yīng)時(shí)間,影響實(shí)驗(yàn)進(jìn)度
Q4:不同應(yīng)用途徑中應(yīng)該添加多少全能核酸酶比較合適呢?
具體的核酸酶添加量會(huì)根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)用途而有所不同,以下是一些簡(jiǎn)單參考,具體操作和數(shù)據(jù)調(diào)整還需要經(jīng)過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證:
真核細(xì)胞裂解液:為了降低細(xì)胞裂解液黏度,縮短處理時(shí)間,改善分離效果,可以參考細(xì)胞數(shù)來添加。比如一般為106~107個(gè)細(xì)胞添加1μl即500單位的核酸酶。
純化后的疫苗病毒:由于DNA含量較少,可以按照萬分之一到萬分之五也就是每毫升5個(gè)單位的最終濃度加入。
Q5:哪些緩沖液可以用于稀釋?
稀釋液緩沖液: 20 mM Tris-HCl(pH 8.0),2 mM MgCl2,20 mM NaCl。不需要無菌的可以直接加入,若有無菌要求,建議將酶用buffer稀釋,然后用0.2μm的膜除菌過濾后加入。酶被稀釋后盡快用掉,避免反復(fù)凍融。
Q6.倘若反應(yīng)溫度無法達(dá)到最適溫度37℃,如何保證核酸酶消化效果佳?
當(dāng)反應(yīng)溫度過低的情況下,推薦延長(zhǎng)反應(yīng)時(shí)間來保證消化效果。
Q7.實(shí)驗(yàn)過程中遇到需要蛋白變性環(huán)境,對(duì)核酸酶是否有影響?
在問題三中已列舉出如SDS、尿素等試劑都會(huì)影響到核酸酶的酶活,隨著濃度與時(shí)間的增加,核酸酶會(huì)出現(xiàn)變性失活,可通過控制抑制劑濃度范圍及提高核酸酶濃度來補(bǔ)償抑制因素影響。
Q8.核酸酶的使用時(shí)間
可以選擇在細(xì)胞收獲前、澄清后或是純化后用廣譜核酸酶處理樣品,一般選擇在收獲前或澄清后處理,可以提高病毒得率。
早期使用:可以減少大的DNA片段,并且可以在下游純化步驟中去除殘留的核酸酶。 但為了去除樣品中大量的核酸,必須使用大量的酶。
后期使用:節(jié)約了核酸酶的用量,降低成本;但必須增加一個(gè)去除廣譜核酸酶殘留的步驟,并且,采用這種方式可能會(huì)導(dǎo)致病毒的得率減少。
逐典Pannarase全能核酸酶優(yōu)勢(shì):
1.無動(dòng)物源性、無氨芐青霉素
2.杰出單位比酶活、更高效的核酸降解能力
3.先進(jìn)的生產(chǎn)工藝,非傳統(tǒng)His標(biāo)簽純化、排除引入金屬離子風(fēng)險(xiǎn)
4.嚴(yán)格的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn),內(nèi)毒水平低,確保單位酶活的準(zhǔn)確性以及批次間穩(wěn)定性
全能核酸酶應(yīng)用條件:
全能核酸酶的酶活會(huì)受到多種因素的影響(例如溫度、pH、離子強(qiáng)度等),故用量范圍也會(huì)從0.1 U/mL-250 U/mL不等。因此,不同的操作環(huán)境下酶的最佳濃度不同,需要通過實(shí)驗(yàn)設(shè)置梯度進(jìn)行最佳條件的摸索。
應(yīng)用實(shí)例:
1.樣品:狂犬病毒濃縮液
處理?xiàng)l件:核酸酶濃度50~90U/ml ,
37 ℃處理 2 h,轉(zhuǎn)入18 ~ 26 ℃處理 6h
2.樣品:狂犬病病毒濃縮液
處理?xiàng)l件:25、50和100 U/ml,37℃
3.樣品:流感病毒濃縮液
處理?xiàng)l件:10 U/mL,37℃