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快速、高效AAV衣殼蛋白分析助力基因治療藥物

2024-1-12  閱讀(105)

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基因治療是指將外源正?;?qū)氚屑?xì)胞,以糾正或補(bǔ)償缺陷和異?;蛞鸬募膊?,以達(dá)到治療目的?;蛑委煹妮d體在基因治療過(guò)程中起著至關(guān)重要的作用,一些病毒制劑和人工遞送技術(shù)已經(jīng)被用來(lái)嘗試安全地將蛋白受體或核酸載體遞送到宿主細(xì)胞中進(jìn)行復(fù)制,起到治療效果。然而,一些病毒載體的不良特性,包括它們的免疫原性,或它們引起的強(qiáng)烈副作用,已經(jīng)導(dǎo)致了嚴(yán)重的臨床不良事件,并限制了它們目前在臨床中的某些應(yīng)用。


腺相關(guān)病毒(Adeno-associated virus, AAV)因具有低致病性、對(duì)宿主免疫原性弱、長(zhǎng)期穩(wěn)定表達(dá)、廣泛的細(xì)胞和組織親嗜性等優(yōu)點(diǎn)而被廣泛用于研發(fā)和臨床應(yīng)用領(lǐng)域,是目前研究活躍的基因治療載體之一,已經(jīng)有超過(guò)200個(gè)AAV藥物進(jìn)入臨床試驗(yàn)和3個(gè)藥物已上市。AAV由一個(gè)蛋白質(zhì)衣殼組成,該衣殼包裹著一個(gè)大小約為4.7kb的小基因組,并依賴于與輔助病毒的共感染來(lái)進(jìn)行復(fù)制。AAV衣殼由三種病毒蛋白(VP1、VP2和VP3)組成,其比例、鑒別、純度影響藥物效能和效價(jià)強(qiáng)度,需要被鑒定并監(jiān)控以確保藥物質(zhì)量。AAV衣殼是病毒基因組的保護(hù)結(jié)構(gòu),也是病毒復(fù)制的起源和包裝信號(hào),是影響病毒感染活性和基因轉(zhuǎn)導(dǎo)的關(guān)鍵因素。不同血清型之間的衣殼蛋白質(zhì)具有較高一致性,因此在基因治療方法的開(kāi)發(fā)和商業(yè)化過(guò)程中需要使用高效、可靠的載體鑒定方法。


為使VP1、VP2和VP3可視化,我們利用SDS-PAGE銀染法來(lái)產(chǎn)生定性數(shù)據(jù),此過(guò)程耗時(shí)費(fèi)力且重現(xiàn)性差。LabChip®GXII Touch™蛋白分析系統(tǒng)提高了AAV純度分析的速度、通量和數(shù)據(jù)質(zhì)量。利用SDS存在下的微流控毛細(xì)管電泳技術(shù)分離AAV衣殼蛋白,并測(cè)定每種病毒衣殼蛋白的大小和濃度。


LabChip®GXII Touch™系統(tǒng)的ProteinEXact™試劑采用系統(tǒng)校準(zhǔn)步驟,可實(shí)現(xiàn)高精度重現(xiàn)性,并具有更高的靈敏度和較寬的分析范圍。65秒內(nèi)即可完成樣品分析。這種高通量的分析方法可以同時(shí)測(cè)定96份AAV樣品,并提供傳統(tǒng)毛細(xì)管電泳可比結(jié)果。


利用ProteinEXact™試劑,LabChip®GXII Touch™蛋白分析系統(tǒng)可以提供:

  • 定量和數(shù)字化的結(jié)果

  • 標(biāo)準(zhǔn)化分析流程

  • 多個(gè)用戶、多臺(tái)儀器上結(jié)果的可重復(fù)性

  • 分析速度快

高通量



圖1:(A) LabChip® GXII Touch™儀器(B)芯片,可測(cè)試多達(dá)400個(gè)樣品(C)顯示蛋白質(zhì)如何在微流控通道中得以分離和脫色


Protein EXact™ Assay檢測(cè)AAV衣殼蛋白


AAV的熱穩(wěn)定性因血清型不同而有所變化,衣殼蛋白組成的比例類似,即VP1:VP2:VP3=1:1:102。LabChip®GXII Touch™蛋白鑒定系統(tǒng)采用PerkinElmer的ProteinEXact™分析技術(shù),利用IntelliChip™分析優(yōu)化技術(shù),使樣品的蛋白濃度分析具有高分辨率和可重復(fù)性,從而使重組病毒生產(chǎn)的AAV鑒定具有最高的準(zhǔn)確性。




圖2:AAV8變性后衣殼蛋白Labchip電泳圖譜,樣品重現(xiàn)性好


幾種血清型(AAV2、AAV8和AAV9)的空衣殼顆粒被用于這些實(shí)驗(yàn)。為了分離衣殼顆粒,AAV樣品在洗滌劑的存在下反復(fù)加熱。由于不同的AAVs具有不同的穩(wěn)定性,因此對(duì)每個(gè)血清型分別選擇了不同的溫度。如圖2所示,變性的AAV8顆粒在SDS存在的情況下,在80℃加熱后,只有三個(gè)峰的分子量分別為80、90和115kDa左右。


AAV動(dòng)力學(xué)觀察實(shí)驗(yàn)(穩(wěn)定性)


為了研究AAV變性的時(shí)間條件,對(duì)每個(gè)重組構(gòu)建體進(jìn)行了動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)。LabChip™GXII Touch™蛋白鑒定系統(tǒng)能夠在30-50秒內(nèi)收集多達(dá)300個(gè)實(shí)驗(yàn)點(diǎn),這可能為衣殼蛋白提供額外的信息。




圖3A和3B:動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)中部分變性的AAV8(圖3B—只顯示二聚體)


部分變性衣殼可由不同蛋白質(zhì)分子量(單體、二聚體、三聚體等)的混合物組成,如圖3所示。在實(shí)驗(yàn)期間。在1% SDS和TE緩沖液中加入AAV樣品的96孔板被加熱到特定的溫度進(jìn)行變性,隨后進(jìn)行檢測(cè)。


AAV糖基化檢測(cè)實(shí)驗(yàn)


一些研究者在LabChip®GXII Touch™蛋白表征系統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)中,觀察到VP3的主要峰上有明顯的“小峰"。最近,Sara Murrey等人報(bào)道了AAV2衣殼蛋白的糖基化,并從理論上估算了衣殼蛋白表面糖基化的四個(gè)可能位置。為了研究衣殼糖基化的假設(shè),我們使用我們研發(fā)實(shí)驗(yàn)室之前開(kāi)發(fā)的酶處理(PNGase F消化)對(duì)AAV2、AAV8和AAV9顆粒進(jìn)行去糖基化;圖4中的數(shù)據(jù)顯示了處理前(a)和處理后(b)的AAV8。在圖4b中,觀察到VP3峰的分子量變化為79 kDa,而圖4a中未處理的VP3的分子量變化為81kDa。對(duì)于VP2 (92kDa vs. 94kDa)和VP1 (113kDa vs.115 kDa),可以觀察到大約2kDa的相同變化。觀察結(jié)果與衣殼蛋白上糖基化的平均分子量一致。




圖4A和4B:變性AAV8去糖基化結(jié)果


為了證明去糖基化的再現(xiàn)性,我們對(duì)變性的AAV顆粒進(jìn)行了額外的實(shí)驗(yàn)。圖5顯示了與圖4相同的三種衣殼蛋白分子量變化的重疊電泳圖。此外,在LabChip®GXII Touch™蛋白分析系統(tǒng)中也可以顯示虛擬膠圖結(jié)果,其前后的分子量變化非常明顯。




圖5:去糖基化前后AAV8檢測(cè)結(jié)果


我們展示了LabChip®GXII Touch™蛋白分析系統(tǒng)上利用ProteinEXact™對(duì)AAV樣品進(jìn)行多項(xiàng)檢測(cè)的結(jié)果,證明該平臺(tái)提供AAV衣殼蛋白的全面分析的能力。該方法為AAV衣殼蛋白鑒定提供了一種快速、高通量、穩(wěn)定可靠的方法。高重現(xiàn)性和準(zhǔn)確的衣殼成分檢測(cè)可以作為重組AAV病毒顆粒表征的新方法,是基因治療應(yīng)用的關(guān)鍵一步。另外,衣殼蛋白糖基化的高分辨率驗(yàn)證進(jìn)一步有利于重要治療成分的生產(chǎn)。


參考文獻(xiàn)

1. J.T. Bulcha et.al. Signal Transduct. Target. Ther.6, 53 (2021).

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4. Xie, Q., et.al. The atomic structure of adeno-associated virus (AAV-2), a vector for human gene therapy. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002 99:10405–10410.

5. Sara Murrey et.al. Characterization of the capsid protein glycosylation of adeno-associated virus type 2 by high-resolution mass spectrometry 2006 Journal of Virology,80: 6171–6176.



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