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Videometer植物病害表型成像平臺介紹
VideometerLab 500是一款大成像面積多光譜成像系統(tǒng),用于快速、有效測定表面顏色、質(zhì)構、化學組分,成像面積可達0.5X0.25米,主要針對要求單次成像面積大的應用領域,是VideometerLab 4的大成像面積升級版,可處理更大的樣品,波段數(shù)量為14個,涵蓋波長405-970nm,可廣泛應用于植物病害成像、植物種質(zhì)資源和表型研究,如葉片、種子表型和果實表型研究等,也用于食品、中草藥、煙草、茶葉等研究。
成像柜前視圖
VideometerLab 500采用了LED技術,組合測量可達多達14個不同波長并集成到1張高分辨光譜圖像中,實現(xiàn)圖譜合一測量。圖像的每一個像素為反射光譜。該系統(tǒng)為一款*多光譜顏色、質(zhì)構、成分綜合分析儀,集成了可見光高清成像,紫外成像以及部分近紅外成像等強大功能。此設備還可選配熒光測量模塊,用于植物等熒光研究。
此設備易于使用,該設備簡單易用,集成了照明,相機以及計算機技術,具有強勁數(shù)字圖像分析以及數(shù)據(jù)統(tǒng)計能力。該技術對于于對樣品或表面的化學和可視特性定性測量特別有用,目前利用該技術發(fā)表文章超過300篇。
Videometer植物病害表型成像平臺技術參數(shù)
1. 成像系統(tǒng)帶掃描系統(tǒng) 、PC和選通控制器.
2. 載物臺、藍帶背景
3. 存儲箱帶校準目標
4.相機12.3M像素
5、LED照明: 4 x LED板-14波長: 405, 430, 450, 470, 490, 515, 590,630, 660, 780, 850, 880, 940, 970 nm,集成RGB、紫外、部分近紅外波段
6、光源壽命長、可達10萬小時
7. 成像尺寸:4096 x 2048像素
8. 視野:496 x 248mm分辨率0.121 mm/像素)
9. 圖像獲取時間:1秒
10. 尺寸:68(W)x 68(D)x82(H)
11. 重量:65 kg
12.電源: 100-240 VAC(PC和選通控制器)
13. 環(huán)境條件
14.VideometerLab-500 設備用于在以下環(huán)境條件下運行:
環(huán)境溫度: 10-30 °C
濕度:20-80%濕度
環(huán)境照明: 該設備適合室內(nèi)多種照明條件,但不得暴露在直射陽光下
震動:系統(tǒng)要取得最佳運行效果,需置于溫度表面、遠離持續(xù)震動
保護級: IP20
14.軟件:圖像處理工具箱(IPT)、光譜成像工具箱(MSI)、斑點工具箱等。
15.采用錐形體設計,提供均勻和彌散光線照明
16.的彩色測量功能,符合CIE標準
17.備選濾波輪模塊:長波濾光片
設備一覽:前門打開,插入裝載臺。錐形體照明艙配有LED板以及散射板,確保產(chǎn)品上散射、平穩(wěn)光分布
LL條件下大豆葉綠素a(a)和b(b)含量分布的可視化圖。平行顏色條表示圖像中的葉綠素含量。
除DD(b)外,LL條件(a)下不同時間的大豆葉片在記錄期間反射差分圖像(彩色)在780nm處顯示出不均勻性的節(jié)奏?。
從大麥品種Guld、Scarlett、MS Bladplet、Rolfi獲得的接種網(wǎng)斑病發(fā)展進程。(A)用于在2、4和9天檢測接種網(wǎng)斑病的大麥植株的疾病癥狀的偽RGB圖。(B)接種后2、4和9天,Guld, MS Bladplet, Scarlett與Rolfi疾病嚴重度以占葉面積(%)表示。通過VideometerLab軟件估計發(fā)病面積,每個像素值被分類為有癥狀或健康。(C)在接種Guld、MS Bladplet、Scarlett和Rolfi品種8、24、48和120小時后,使用qRT PCR分析,根據(jù)DNA含量比較感染程度。將相對數(shù)量標準化用于樣本模擬。以log2值和條形圖代表的標準誤差來自27個生物重復樣本數(shù)據(jù)(p<0.05)
番茄單成熟突變體的果實性狀。(A)與等基因突變體Cnr、nor和rin相比,野生型番茄(WT)、c.v.“Ailsa Craig"成熟進程經(jīng)歷了四個發(fā)育階段:成熟綠[MG,花后37天(dpa)]、轉(zhuǎn)綠(T,45 dpa)、紅熟(RR,50 dpa)和過熟(或57 dpa)整體顯示在左側(cè),縱向顯示在右側(cè)。圖像由VideometerLab儀器采集和處理。條形圖對應于2 cm。(B)測定了MG、RR和OR每個階段的水果硬度(n=28-44)、總可溶性固形物(TSS)(n=5-12)和可滴定酸度(TA)(n=5-12)的測量值。誤差條代表每個樣本的生物復制品之間的標準誤差。字母表示ANOVA和Tukey HSD計算的基因型和階段之間存在顯著差異(P≤ (C)在RR(n=22-34)和OR階段(n=28-40),根據(jù)每個基因型的L*a*b*色標測量的外部顏色的主成分分析。重心由一個三角形表示,周圍的橢圓表示95%的置信區(qū)間。
接種禾谷鐮刀菌)的普通小麥葉片的光譜特征以及相應的RGB圖
在多光譜圖像上應用支持向量機方法(SVM)自動檢測白粉?。≒M)和HR。在(A,B)中,顯示了多光譜圖像的代表性區(qū)域。健康組織以綠色像素表示,PM疾病組織以藍色像素表示(A)。紅色像素表示正在經(jīng)歷HR(B)的組織。PM和HR像素按其與健康像素的比率(C)進行量化。定量分析顯示,5天中的大量PM病變像素表明近等基因系WT易感病。Mla近等基因系可以通過大量的HR像素來識別。對于mlo近等基因系,兩種模型的像素比率均較低。
大豆未老化種子和老化種子類別12、24和48小時原始RGB圖像以及在365/400 nm激發(fā)-發(fā)射組合下捕獲的相應自體熒光圖像(灰度和nCDA),顯示種皮存在(a)和不存在(b)時的自體熒光模式。使用nCDA圖像中具有不同自發(fā)熒光模式的種子在播種后8天進行發(fā)芽試驗(c)。在nCDA圖像中,基于10%修剪平均值計算像素值(自發(fā)熒光強度),以提供更真實的圖像。
圖4(A) sRGB圖像。(B),490nm(藍光),(C),570nm(黃色),(D) 轉(zhuǎn)換,(E)和(F),2種類型定量分割。
圖5(A) sRGB 圖像,(B)490nm(藍光),(C) 570nm(黃色),(D)轉(zhuǎn)換,(E)定量分割
藜麥病害定量研究
蔓越莓果實硬度可視化研究