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(1)微生物菌種的形態(tài)特征：大小、形狀（露滴狀、圓形、菜花樣、不規(guī)則等）、突起或扁平、凹陷、邊緣（光滑、波形、鋸齒狀、卷發(fā)狀等）、顏色（紅色、灰白色、黑色、綠色、無色、黃色等）、表面（光滑、粗糙等）、透明度（不透明、半透明、透明等）和粘度等。據(jù)細菌菌落表面特征不同，可將菌落分為3型： ①光滑型菌落（S型菌落）：菌落表面光滑、濕潤、邊緣整齊，新分離的細菌大多呈光滑型菌落。②粗糙型菌落（R型菌落）：菌落表面粗糙、干燥、呈皺紋或顆粒狀，邊緣大多不整齊。R型菌落多為S型細菌變異失去菌體表面多糖或蛋白質(zhì)形成。R型細菌抗原不完整，毒力和抗吞噬能力都比S型細菌弱。但也有少數(shù)細菌新分離的毒力株就是R型，如炭疽孢桿菌、結(jié)核分枝菌等。③粘液型菌落（M型菌落）：菌落粘稠、有光澤、似水珠樣。多見于厚莢膜或豐富粘液層的細菌、結(jié)核桿菌等。
(2)菌落溶血特征：菌落溶血有下列3種情況。①α溶血：又稱草綠色溶血，菌落周圍培養(yǎng)基出現(xiàn)1~2mm的草綠色環(huán)，為高鐵血紅蛋白所致；②β溶血：又稱*溶血，菌落周圍形成一個*清晰透明的溶血環(huán)，是細菌產(chǎn)生的溶血素使紅細胞*溶解所致；③γ溶血：即不溶血，菌落周圍的培養(yǎng)基沒有變化，紅細胞沒有溶解或缺損。(3)色素：有些細菌產(chǎn)生水溶性色素，使菌落和周圍的培養(yǎng)基出現(xiàn)綠色、金黃色、白色、橙色、檸檬色等顏色，產(chǎn)生的色素有水溶性或脂溶性。
(4)氣味：某些微生物菌種在培養(yǎng)基中生長繁殖后可產(chǎn)生特殊氣味，如銅綠假單胞菌（生姜氣味）、變形桿菌（巧克力燒焦的臭味）、厭氧梭菌、白色假絲酵母菌（酵母味）和放線菌（泥土味）等。
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微生物菌種