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微生物菌種在培養(yǎng)或保藏過程中，由于自發(fā)突變的存在，出現(xiàn)某些原有優(yōu)良性狀的劣化、遺傳標記的丟失等現(xiàn)象，稱為菌種衰退。菌種衰退不是突然發(fā)生的，而是從量變到質(zhì)變的逐步演變過程。菌種衰退的主要原因是有關基因的負突變。合理的育種、選用合適的培養(yǎng)基、創(chuàng)造良好的培養(yǎng)條件、采用有效的菌種保藏方法等可以有效的防止菌種的退化。
常用的菌種保藏方法有斜面低溫保藏法、液體石蠟保藏法、濾紙保藏法、沙土保藏法、液氮冷凍保藏法、冷凍干燥保藏法。
菌種衰退不是突然發(fā)生的，而是從量變到質(zhì)變的逐步演變過程。開始時，在群體細胞中僅有個別細胞發(fā)生自發(fā)突變(一般均為負變)，不會使群體菌株性能發(fā)生改變。經(jīng)過連續(xù)傳代，群體中的負變個體達到一定數(shù)量，發(fā)展成為優(yōu)勢群體，從而使整個群體表現(xiàn)為嚴重的衰退。
產(chǎn)生菌種衰退的原因是什么？
菌種衰退的主要原因是有關基因的負突變。如果控制產(chǎn)量的基因發(fā)生負突變，則表現(xiàn)為產(chǎn)量下降；如果控制孢子生成的基因發(fā)生負突變，則產(chǎn)生孢子的能力下降。菌種在移種傳代過程中會發(fā)生自發(fā)突變。雖然自發(fā)突變的幾率很低(一般為10-6~10-9)，尤其是對于某一特定基因來說，突變頻率更低。但是由于微生物具有*的代謝繁殖能力，隨著傳代次數(shù)增加，微生物菌種衰退細胞的數(shù)目就會不斷增加，在數(shù)量上逐漸占優(yōu)勢，zui終成為一株衰退了的菌株。
表型延遲造成菌種衰退
表型延遲現(xiàn)象也會造成菌種衰退。如，在誘變育種過程中，經(jīng)常會發(fā)現(xiàn)某菌株初篩時產(chǎn)量較高，進行復篩時產(chǎn)量卻下降了。
質(zhì)粒脫落導致菌種衰退
質(zhì)粒脫落導致菌種衰退的情況在抗生素中較多，不少抗生素的合成是受質(zhì)?？刂频?。當菌株細胞由于自發(fā)突變或外界條件影響(如高溫)，致使控制產(chǎn)量的質(zhì)粒脫落或者核內(nèi)DNA和質(zhì)粒復制不一致，即DNA復制速度超過質(zhì)粒，經(jīng)多次傳代后，某些細胞中就不具有對產(chǎn)量起決定作用的質(zhì)粒，這類細胞數(shù)量不斷提高達到優(yōu)勢，則微生物菌種表現(xiàn)為衰退。