1、什么是內參?
內參是Western Blot實驗中用于標準化和校正實驗誤差的一類蛋白質。它們通常是在不同組織和細胞中表達相對恒定的蛋白質,由管家基因編碼,常用作檢測目的蛋白表達水平變化時的參照物。
2、內參在WB中的作用是什么?
校正實驗誤差:內參用于校正蛋白質定量和上樣過程中的實驗誤差,以保證實驗結果的準確性。由于不同的樣品在蛋白質提取、定量、上樣等步驟中可能存在操作誤差,使用內參可以對這些誤差進行校正。
半定量分析:通過比較內參和目標蛋白的信號強度,可以對實驗結果進行半定量分析。如果樣品蛋白量有限,只夠進行一次電泳轉膜實驗時,分別檢測樣品的內參量和目的蛋白量,然后將各樣品目的蛋白量分別除以其內參含量,得到內參校正后的各樣品中目的蛋白相對含量,用此數值進行樣品間的比較和分析。
作為空白對照:內參可以作為空白對照,檢測蛋白轉膜情況是否wan全,以及整個Western Blot顯色或者發(fā)光體系是否正常。
確保實驗結果的可比性:在比較不同條件下或不同組織中目的蛋白表達量的相對多少時,內參提供了一個參照標準,確保了實驗結果的可比性。
3、常見的WB內參有哪些?
β-Actin:β-肌動蛋白是一種細胞骨架蛋白,分子量42KDa左右,廣泛分布于各種組織中,表達量豐富且相對恒定。它通常用作總蛋白的內參,尤其是在非肌肉組織中。然而,需要注意的是,β-Actin在某些特定組織(如心?。┲械谋磉_量可能較低,因此并非在所有情況下都適用。此外,不同的β-Actin亞型在不同組織中的分布也有所不同,選擇抗體時需考慮這一點。
大鼠腦裂解物20μg
人結腸癌組織
Hela細胞
abs171598 Rabbit anti-β-Actin Monoclonal Antibody
GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶):36kD左右,GAPDH是一種廣泛表達的蛋白,適用于多種細胞類型。然而,在某些條件下,如缺氧或糖尿病,GAPDH的表達可能會受到影響,因此需要根據實驗條件謹慎選擇。
1: HeLa whole cell lysate 20ug Lane
2: THP-1 whole cell lysate 20ug Lane
3: MCF7 whole cell lysate 20ug Lane
4: NIH/3T3 whole cell lysate 20ug Lane
5: mouse spleen lysate 20ug Lane
6: C6 whole cell lysate 20ug Lane
7: rat spleen lysate 20ug
abs132004 Rabbit anti-GAPDH Polyclonal Antibody
β-Tubulin:55kDa左右,β-Tubulin是微管蛋白的一種,參與構成細胞骨架。由于其在細胞中的穩(wěn)定表達,尤其用于檢測細胞骨架蛋白時。β-Tubulin的表達在多種細胞類型中相對恒定,但同樣需要考慮特定條件下的表達變化,如在凋亡細胞中。
Hela細胞全裂解物
大鼠腎組織
NIH3T3細胞
abs171597 Rabbit anti-β-Tubulin Monoclonal Antibody
除了以上介紹的內參以外,還有α-Tubulin、Hsp90等等,每個內參的分子量及適用情況不一樣,建議選擇之前做好功課。
4、如何挑選合適的內參,需要考慮哪些因素?
目的蛋白分子量:內參蛋白的分子量應與目標蛋白的分子量相差至少5kDa以上,以確保在凝膠電泳和Western Blot中能夠清晰地區(qū)分目標蛋白和內參的條帶。
樣本種屬來源:不同種屬的樣本可能需要選擇不同的內參蛋白。例如,哺乳動物的組織或細胞樣本常選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH等,而植物樣本可能選擇plant actin、Rubisco等作為內參。
細胞定位:根據目標蛋白的亞細胞定位選擇相應的內參。例如,如果是檢測全細胞或細胞質蛋白,可以選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH等;如果是核蛋白,則可能選擇Lamin B、Histone H3等作為內參。
實驗環(huán)境:內參的選擇還需要考慮實際的實驗環(huán)境和樣品的前處理。在某些特殊條件下,一些內參蛋白的表達可能會發(fā)生變化,從而影響其作為內參的穩(wěn)定性和可靠性。例如,在缺氧或糖尿病等條件下,GAPDH的表達可能會增加,因此可能不適合作為內參。
組織特異性:不同的組織可能需要選擇不同的內參。例如,肌肉組織中可能需要選擇特定的肌動蛋白亞型作為內參,而在非肌肉組織中則可能選擇β-actin等。
5、內參抗體和目標抗體如何孵育?
順序孵育:在檢測完目標蛋白后,使用strip緩沖液洗掉膜上的抗體,然后重新進行內參蛋白的抗體溫育和顯色檢測。這種方法需要在兩次孵育過程中使用同一張膜。
雙膜法:在蛋白轉膜后,根據預染的蛋白質Marker的大小將膜剪成大分子量和小分子量兩部分,使內參蛋白與目的蛋白分開。然后兩塊膜分別與內參蛋白抗體以及目的蛋白抗體進行孵育和顯色。
同時孵育(如果分子量相差較大):如果目的蛋白的分子量與內參蛋白的分子量相差較大,可以在轉膜后的同一張膜上同時進行兩種抗體的孵育。由于條帶位置的差異,可以在同一張膜上分別檢測內參和目標蛋白。
使用標記內參抗體:有些實驗室使用預先標記有酶(如HRP)的內參抗體,這樣可以在二抗孵育時加入這種標記內參抗體,按照正常操作進行顯色。
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